34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0652 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0652  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 112 aa  235  2e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3023  cupin 2, barrel  50 
 
 		 113 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2662  cupin 2 domain-containing protein  45.61 
 
 		 119 aa  121  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4126  cupin 2 domain-containing protein  45.87 
 
 		 119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00345  cupin domain protein  43.52 
 
 		 121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00219915  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1444  cupin 2 domain-containing protein  46.08 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  24.51 
 
 		 186 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  24.51 
 
 		 186 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  24.51 
 
 		 186 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 186 aa  47  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  24.51 
 
 		 186 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  23.53 
 
 		 186 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3172  hypothetical protein  30.88 
 
 		 271 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.535542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3001  cupin 2 domain-containing protein  28.07 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2830  hypothetical protein  35.82 
 
 		 280 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.428728  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3060  cupin 2 domain-containing protein  30 
 
 		 149 aa  44.3  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00975792 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 197 aa  44.7  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10448  hypothetical protein  27.14 
 
 		 179 aa  44.3  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2409  cupin family protein  25.32 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116838  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.33 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0121  hypothetical protein  37.5 
 
 		 242 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  28 
 
 		 152 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0760  cupin 2 domain-containing protein  28.89 
 
 		 178 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.519438 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1607  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.88 
 
 		 158 aa  41.6  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.978873  normal  0.178437 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2709  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.43 
 
 		 126 aa  42  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2209  MerR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 85 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000991087  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0617  cupin 2 domain-containing protein  30.14 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0604  cupin 2, barrel  30.14 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398371  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1227  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.718162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2392  cupin 2 domain-containing protein  34.78 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.232938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.21 
 
 		 166 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.82 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1085  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.03 
 
 		 168 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0595  cupin 2 domain-containing protein  28.77 
 
 		 165 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906672  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>