106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4126 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4126  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 119 aa  246  7e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3023  cupin 2, barrel  56.64 
 
 		 113 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0652  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.87 
 
 		 112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2662  cupin 2 domain-containing protein  46.22 
 
 		 119 aa  111  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1444  cupin 2 domain-containing protein  44.14 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00345  cupin domain protein  38.46 
 
 		 121 aa  96.7  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00219915  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  30.51 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.29 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2502  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.42 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.529336 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1009  cupin family protein  26.67 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.42 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2672  hypothetical protein  38.1 
 
 		 159 aa  51.2  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.391613 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  32.94 
 
 		 332 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1904  cupin region  29.41 
 
 		 120 aa  51.2  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3001  cupin 2 domain-containing protein  30 
 
 		 124 aa  50.8  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0440  cupin 2, barrel  31.71 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.351298  normal  0.537185 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.94 
 
 		 332 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1607  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.57 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.978873  normal  0.178437 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33680  Protein of unknown function (DUF861)  38.98 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3425  cupin 2, barrel  28.24 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4943  cupin 2 domain-containing protein  28.24 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.637992  unclonable  0.0000173858 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0866  cupin 2 domain-containing protein  35.44 
 
 		 333 aa  48.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.647462  normal  0.208586 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0950  cupin 2 domain-containing protein  35.63 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5343  cupin 2 domain-containing protein  28.24 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499051  normal  0.0476873 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0104  cupin  24.39 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.300673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1579  TonB box-like  30.49 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0865  cupin 2 domain-containing protein  34.48 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151953  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.57 
 
 		 192 aa  47.8  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1023  cupin 2 domain-containing protein  31.17 
 
 		 120 aa  47.4  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2936  cupin 2 protein  34.12 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0225077  hitchhiker  0.00286289 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4469  polyketide synthesis domain-containing protein  31.19 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2501  cupin 2 domain-containing protein  35.19 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.342935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2945  cupin 2 domain-containing protein  35.21 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4399  polyketide synthesis domain protein  30.28 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4402  polyketide synthesis domain-containing protein  30.28 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.155389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4287  polyketide synthesis domain protein  30.28 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.640485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4317  polyketide synthesis domain protein  30.69 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3175  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.99 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1864  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.69 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  31.4 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2148  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.85 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0024464  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3499  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.82 
 
 		 161 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.163476 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2847  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.36 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.78 
 
 		 118 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0904  hypothetical protein  24.71 
 
 		 160 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2852  cupin 2  32.26 
 
 		 156 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.03 
 
 		 172 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.814089  normal  0.762073 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1110  cupin 2, barrel  36.92 
 
 		 170 aa  43.9  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.1 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 152 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3304  signal peptide protein  31.94 
 
 		 155 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0282721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.43 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0356258  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0884  cupin 2, barrel  32.95 
 
 		 191 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2685  cupin 2 domain-containing protein  31.58 
 
 		 134 aa  42.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477579  hitchhiker  0.0004758 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1277  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.03 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0247695  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6664  hypothetical protein  29.03 
 
 		 272 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00516575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4149  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26535  decreased coverage  0.0023385 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2409  cupin family protein  31.65 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116838  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4456  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0285903  normal  0.0443513 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2121  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.16 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.625862  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2392  cupin 2 domain-containing protein  33.87 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.232938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2411  cupin 2 domain-containing protein  26.83 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  38.33 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  30.56 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5545  cupin 2 domain-containing protein  35.29 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2265  cupin 2 domain-containing protein  32.39 
 
 		 172 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.97009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4715  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.26 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.06 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.82 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0121  hypothetical protein  36.59 
 
 		 242 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1882  auxin-binding protein, putative  36.67 
 
 		 167 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1827  hypothetical protein  23.91 
 
 		 121 aa  41.6  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4186  mannose-6-phosphate isomerase, type II  28.57 
 
 		 129 aa  41.6  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2161  cupin 2 domain-containing protein  31.71 
 
 		 152 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0191913  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1593  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.96 
 
 		 138 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.147547 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1085  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.36 
 
 		 168 aa  41.6  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5786  cupin 2 conserved barrel domain protein  31.18 
 
 		 135 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242076  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3113  cupin 2 domain-containing protein  26.74 
 
 		 174 aa  41.6  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.487782  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13981  mannose-1-phosphate guanylyltransferase  37.74 
 
 		 480 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5757  hypothetical protein  29.27 
 
 		 273 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  25.27 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.68 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3556  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.36 
 
 		 169 aa  41.2  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0204  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.07 
 
 		 160 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  33.33 
 
 		 163 aa  41.2  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.754668  normal  0.233584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3197  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 191 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229687  normal  0.39078 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0577  hypothetical protein  24.53 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.116523  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0848  cupin 2 domain-containing protein  29.89 
 
 		 154 aa  40.8  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2286  cupin 2 domain-containing protein  26.83 
 
 		 130 aa  40.4  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2431  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.82 
 
 		 161 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00370098  hitchhiker  0.00000777225 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2765  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.82 
 
 		 161 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.178075 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2805  hypothetical protein  33.82 
 
 		 161 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523774  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3169  hypothetical protein  33.82 
 
 		 161 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.71 
 
 		 172 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 		 171 aa  40.8  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0565  hypothetical protein  35.85 
 
 		 155 aa  40.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.52627 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4841  cupin 2 domain-containing protein  28.99 
 
 		 202 aa  40.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4683  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.75 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  9.43245e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>