126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2409 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2409  cupin family protein  100 
 
 		 114 aa  236  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116838  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0223  cupin 2 domain-containing protein  53.51 
 
 		 114 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4521  hypothetical protein  35.44 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4456  hypothetical protein  37.97 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0285903  normal  0.0443513 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3232  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.19 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0784  cupin 2 domain-containing protein  33 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0399886  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3773  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36 
 
 		 421 aa  52  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.239832  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1305  cupin 2, barrel  37.31 
 
 		 115 aa  50.8  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0335072  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0144  cupin 2 domain-containing protein  41.79 
 
 		 165 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  33.78 
 
 		 123 aa  51.2  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0973  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.58 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.1 
 
 		 163 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  43.04 
 
 		 163 aa  49.7  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  30.16 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1488  cupin 2 domain-containing protein  32.05 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00804045  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4715  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.43 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0837  cupin 2 domain-containing protein  37.97 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168826 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.62 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.88 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1579  TonB box-like  27.84 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  37.1 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0204  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.53 
 
 		 160 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3858  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.84 
 
 		 133 aa  47.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2662  cupin 2 domain-containing protein  33.75 
 
 		 119 aa  47.4  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2863  cupin 2, barrel  35.82 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1444  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 132 aa  47  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0760  cupin 2 domain-containing protein  37.31 
 
 		 178 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.519438 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3001  cupin 2 domain-containing protein  29.27 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1532  cupin 2 domain-containing protein  32.47 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3405  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.79 
 
 		 156 aa  46.2  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  31.65 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  32.99 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.49 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492542  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2945  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.367225  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2162  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.21 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1827  hypothetical protein  26.42 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1285  cupin region  26.98 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1358  cupin 2 domain-containing protein  35.48 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.660301  normal  0.0940885 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0553  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.84 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3113  cupin 2 domain-containing protein  44.44 
 
 		 174 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.487782  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  32.26 
 
 		 186 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10260  cupin domain-containing protein  30.43 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.227794 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0079  hypothetical protein  36.51 
 
 		 282 aa  44.7  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2411  cupin 2 domain-containing protein  32.86 
 
 		 130 aa  44.7  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0565  hypothetical protein  37.1 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.52627 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.53 
 
 		 103 aa  44.7  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.754668  normal  0.233584 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  30.65 
 
 		 186 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 186 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  30.65 
 
 		 186 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2286  cupin 2 domain-containing protein  31.43 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00345  cupin domain protein  32.31 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00219915  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  30.65 
 
 		 186 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0016  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose- 6-phosphate isomerase  31.34 
 
 		 447 aa  44.3  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  30.65 
 
 		 186 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3089  Methionine--tRNA ligase  33.33 
 
 		 749 aa  43.9  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.107488  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2209  MerR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 85 aa  43.9  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000991087  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0432  cupin region  29.41 
 
 		 117 aa  43.9  0.0008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.583729  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0177  cupin 2 domain-containing protein  34.72 
 
 		 148 aa  43.9  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.29 
 
 		 166 aa  43.9  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0577  hypothetical protein  30.11 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.116523  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4882  hypothetical protein  34.21 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3023  cupin 2, barrel  28.83 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0604  cupin 2, barrel  31.82 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398371  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0617  cupin 2 domain-containing protein  31.82 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0595  cupin 2 domain-containing protein  31.82 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2173  mannose-1-phosphate guanylyltransferase  30.12 
 
 		 471 aa  42.7  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0774935  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3623  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.31 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 197 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  36.07 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0652  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.32 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5804  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.67 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0317  hypothetical protein  28.89 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.543351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3197  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.26 
 
 		 191 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229687  normal  0.39078 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0440  cupin 2, barrel  29.11 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.351298  normal  0.537185 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 192 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  23.85 
 
 		 150 aa  42  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4126  cupin 2 domain-containing protein  31.65 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1371  cupin 2 domain-containing protein  43.48 
 
 		 372 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898845 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.32 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01320  hypothetical protein  25.89 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.333196  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0266  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.465169  normal  0.12222 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1646  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.43 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0837  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.75 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1364  hypothetical protein  26.09 
 
 		 135 aa  41.6  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.43 
 
 		 135 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1023  cupin 2 domain-containing protein  30.77 
 
 		 120 aa  42  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.05 
 
 		 113 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1779  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.39 
 
 		 131 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2148  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.21 
 
 		 133 aa  41.6  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0024464  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1644  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.81 
 
 		 154 aa  41.6  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.522674  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2502  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.52 
 
 		 159 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.529336 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.26 
 
 		 122 aa  41.6  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438384  normal  0.13585 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5420  hypothetical protein  31.03 
 
 		 278 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120325  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0884  cupin 2, barrel  38.1 
 
 		 191 aa  41.6  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5442  hypothetical protein  31.03 
 
 		 278 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4827  hypothetical protein  31.03 
 
 		 278 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.576773 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2609  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.07 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.52 
 
 		 159 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3851  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0747223 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  36.96 
 
 		 332 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>