101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0837 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0837  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 125 aa  249  6e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168826 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3856  cupin 2, barrel  43.69 
 
 		 123 aa  94  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.875667 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0506  hypothetical protein  38.83 
 
 		 126 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0871689  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11503  putative pectin degradation protein  33.02 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.380023  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0889  hypothetical protein  33.33 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0571  pectin degradation protein kdgF  33.64 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1396  cupin 2 domain-containing protein  30.3 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2453  cupin domain-containing protein  33.64 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2589  pectin degradation protein KdgF  32.71 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.933509  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2189  cupin 2 domain-containing protein  37.25 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.525757  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0542  cupin 2, barrel  32.26 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4456  hypothetical protein  37.08 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0285903  normal  0.0443513 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1368  hypothetical protein  27.52 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.505892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4521  hypothetical protein  35.96 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1026  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.34 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.208422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0847  cupin 2 domain-containing protein  33.96 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0865  cupin 2 domain-containing protein  27.45 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1863  cupin 2 domain-containing protein  30.93 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.524548 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3323  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00344723  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3039  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.124018 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2583  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 115 aa  50.8  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4715  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.83 
 
 		 127 aa  50.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1504  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.84 
 
 		 111 aa  50.4  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0731  cupin 2 domain-containing protein  34.34 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00910188  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.86 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  36.47 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.91 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2409  cupin family protein  37.97 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116838  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  32.1 
 
 		 171 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0780  cupin 2 domain-containing protein  31.91 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3283  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.91 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.219448 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3553  cupin 2 domain-containing protein  30 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3105  cupin 2 domain-containing protein  32.26 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6741  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.46 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.302286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1457  hypothetical protein  29.41 
 
 		 106 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0483  cupin 2 domain-containing protein  30.88 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.36 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3018  cupin domain-containing protein  32.5 
 
 		 120 aa  47  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.117139  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2770  cupin domain-containing protein  32.5 
 
 		 120 aa  47  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2719  hypothetical protein  32.5 
 
 		 120 aa  47  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2981  cupin domain-containing protein  32.5 
 
 		 120 aa  47  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2775  cupin 2 domain-containing protein  32.5 
 
 		 120 aa  47  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.108544  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2982  polyketide synthesis domain protein  32.5 
 
 		 120 aa  47  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2260  polyketide synthesis domain protein  32.5 
 
 		 120 aa  47  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0666056 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2978  polyketide synthesis domain protein  32.5 
 
 		 120 aa  47  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000628046 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0262  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.5 
 
 		 121 aa  47  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0826  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.1 
 
 		 115 aa  47  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2699  hypothetical protein  31.25 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.615203  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2041  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267736 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.31 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0104  cupin  33.33 
 
 		 122 aa  45.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.300673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1397  cupin 2 domain-containing protein  29.07 
 
 		 115 aa  45.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0319163  normal  0.27943 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1696  cupin domain-containing protein  28 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1805  cupin 2 domain-containing protein  28 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.241802  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3020  polyketide synthesis domain protein  31.25 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3670  cupin 2 domain-containing protein  29.03 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183912  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.92 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3893  pectin degradation protein  31.08 
 
 		 113 aa  45.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.64 
 
 		 112 aa  45.1  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3773  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.18 
 
 		 421 aa  44.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.239832  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0745  cupin 2 protein  36.11 
 
 		 477 aa  44.3  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0177  cupin 2 domain-containing protein  30.34 
 
 		 148 aa  44.3  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2699  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.25 
 
 		 113 aa  44.3  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145082  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  29.87 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3287  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.927122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.93 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8499800000000002e-33 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  33.85 
 
 		 129 aa  43.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1973  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.246266  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0274  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  33 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1607  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.03 
 
 		 158 aa  42.7  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.978873  normal  0.178437 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4192  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.96 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  hitchhiker  0.00969198 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4272  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.23 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510368  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3109  cupin region  30 
 
 		 175 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2249  cupin 2, barrel  30 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4297  cupin 2 domain-containing protein  32.84 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1023  cupin 2 domain-containing protein  26.67 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2840  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.04 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.862394  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20700  gentisate 1,2-dioxygenase  30.47 
 
 		 372 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280371  normal  0.141412 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  32.94 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0483  hypothetical protein  28.57 
 
 		 100 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.654168  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3716  cupin 2, barrel  28.4 
 
 		 129 aa  41.6  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000701811  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2268  cupin 2 domain-containing protein  29.13 
 
 		 111 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2884  AraC family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 274 aa  41.6  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2847  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25 
 
 		 119 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3674  cupin 2 domain-containing protein  31.18 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.206207  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2836  DNA-binding protein  32.79 
 
 		 184 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000716748  hitchhiker  0.00000000374058 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3737  cupin 2 domain-containing protein  44.19 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107824  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2135  cupin 2 domain-containing protein  27.55 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.769565  normal  0.829686 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3738  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 281 aa  40.8  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.250553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.85 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3781  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  25.42 
 
 		 170 aa  40.4  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.566667  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1911  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28 
 
 		 110 aa  40  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0258222  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3858  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.05 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3949  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  25.42 
 
 		 170 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3796  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  25.21 
 
 		 170 aa  40  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4258  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  25.42 
 
 		 170 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4170  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  25.42 
 
 		 170 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000017557  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4060  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  25.21 
 
 		 170 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>