105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1023 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1023  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 
120 aa  246  5e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2847  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.98 
 
 
119 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0104  cupin  38.98 
 
 
122 aa  101  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.300673  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3001  cupin 2 domain-containing protein  35.59 
 
 
124 aa  88.2  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2973  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.75 
 
 
274 aa  76.6  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  30.56 
 
 
137 aa  71.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  28.97 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.56 
 
 
126 aa  70.1  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.59 
 
 
118 aa  67  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1757  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.53 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.128793  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13508  hypothetical protein  35.06 
 
 
177 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1904  cupin region  28.3 
 
 
120 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0452  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.21 
 
 
136 aa  57.4  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.04 
 
 
138 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0432  cupin region  30.97 
 
 
117 aa  54.3  0.0000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.583729  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1009  cupin family protein  27.12 
 
 
119 aa  53.9  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1350  cupin 2 domain-containing protein  27.38 
 
 
287 aa  52.4  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.832765  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1827  hypothetical protein  26.96 
 
 
121 aa  51.2  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0901  XRE family transcriptional regulator  35.62 
 
 
181 aa  50.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000108423 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2121  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.29 
 
 
121 aa  50.8  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.625862  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5098  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.56 
 
 
124 aa  50.1  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0577  hypothetical protein  35.53 
 
 
125 aa  50.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.116523  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0912  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.17 
 
 
125 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1167  cupin 2 domain-containing protein  28.89 
 
 
152 aa  48.9  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.168838 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0895  cupin 2 domain-containing protein  29.49 
 
 
125 aa  48.1  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2540  Cro/CI family transcriptional regulator  32.88 
 
 
181 aa  47.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4126  cupin 2 domain-containing protein  31.17 
 
 
119 aa  47.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0801  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.18 
 
 
122 aa  47.4  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.332449  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0016  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose- 6-phosphate isomerase  30.77 
 
 
447 aa  47.8  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01320  hypothetical protein  33.33 
 
 
122 aa  47.4  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.333196  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4297  cupin 2 domain-containing protein  36.36 
 
 
144 aa  47  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1239  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  24.27 
 
 
472 aa  46.6  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.79355  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2919  transcriptional regulator, XRE family  31.43 
 
 
170 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08490  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.83 
 
 
105 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1306  transcriptional regulator, XRE family  31.43 
 
 
170 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000237827 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.35 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.09 
 
 
125 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1069  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.42 
 
 
117 aa  45.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.486556 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0980  XRE family transcriptional regulator  31.43 
 
 
181 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000294477  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.36 
 
 
159 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2502  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.36 
 
 
159 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.529336 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.93 
 
 
181 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.331871 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2400  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.8 
 
 
127 aa  45.4  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0468  cupin 2 domain-containing protein  29.11 
 
 
157 aa  45.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0819  cupin 2 domain-containing protein  25.33 
 
 
123 aa  45.4  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0389  cupin 2 domain-containing protein  28.05 
 
 
122 aa  45.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0367  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose- 6-phosphate isomerase  26.47 
 
 
486 aa  45.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 
128 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492542  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.4 
 
 
122 aa  45.1  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438384  normal  0.13585 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.59 
 
 
121 aa  44.7  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2140  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.46 
 
 
288 aa  44.3  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  31.58 
 
 
163 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1575  cupin 2, barrel  30.12 
 
 
308 aa  43.9  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2094  transcriptional regulator Cro/CI family protein  28.77 
 
 
188 aa  43.9  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1373  ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit  30.77 
 
 
551 aa  43.9  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5786  cupin 2 conserved barrel domain protein  27.66 
 
 
135 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242076  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1689  hypothetical protein  37.33 
 
 
235 aa  43.5  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.209957 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2672  hypothetical protein  30.3 
 
 
159 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.391613 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0884  cupin 2, barrel  32.73 
 
 
191 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1397  cupin 2 domain-containing protein  25.33 
 
 
115 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0319163  normal  0.27943 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0837  cupin 2 domain-containing protein  26.67 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.168826 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13981  mannose-1-phosphate guanylyltransferase  24.59 
 
 
480 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1646  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.73 
 
 
116 aa  43.5  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1279  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  25.58 
 
 
473 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2799  hypothetical protein  29.23 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.7832900000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0518  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  20.69 
 
 
470 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.405466  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4544  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  21.74 
 
 
518 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3819  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  21.74 
 
 
518 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.574629 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  23.38 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1488  cupin 2 domain-containing protein  25.74 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00804045  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  23.29 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  30.12 
 
 
158 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3705  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  21.74 
 
 
518 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02481  mannose-1-phosphate guanylyltransferase  22.33 
 
 
469 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271515  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2409  cupin family protein  30.77 
 
 
114 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116838  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1329  mannose-6-phosphate isomerase  27.17 
 
 
112 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0501  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.39 
 
 
140 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2583  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.63 
 
 
115 aa  42  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2026  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.29 
 
 
116 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0456493  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1314  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  26.17 
 
 
476 aa  41.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.79469  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3023  cupin 2, barrel  29.51 
 
 
113 aa  41.6  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0440  cupin 2, barrel  28.74 
 
 
149 aa  41.6  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.351298  normal  0.537185 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1444  cupin 2 domain-containing protein  28 
 
 
132 aa  41.2  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2277  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  22.61 
 
 
508 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.163042 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0421  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  23.3 
 
 
475 aa  41.2  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  28.57 
 
 
190 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4920  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  21.74 
 
 
508 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0212238 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0330  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  22.47 
 
 
491 aa  41.2  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00801876  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2263  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  26.14 
 
 
473 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000496774 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1496  mannose-6-phosphate isomerase type II  26.97 
 
 
126 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1523  mannose-6-phosphate isomerase type II  26.97 
 
 
126 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0901  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  26.47 
 
 
151 aa  41.2  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.554615  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01933  Mannose-1-phosphate guanylyltransferase  25.88 
 
 
474 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1794  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  25.88 
 
 
501 aa  40.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3192  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  25 
 
 
486 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.764858  normal  0.047158 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01920  hypothetical protein  25.88 
 
 
474 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5804  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.39 
 
 
123 aa  40.8  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3140  mannose-6-phosphate isomerase, bifunctional enzyme  30.59 
 
 
458 aa  40.4  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.116688  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00967  mannose-1-phosphate guanylyltransferase  21.36 
 
 
468 aa  40.4  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5545  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  20.87 
 
 
508 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204697  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>