69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2840 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2840  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 118 aa  245  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.862394  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2699  Cupin 2 conserved barrel domain protein  67.62 
 
 		 113 aa  162  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145082  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2189  cupin 2 domain-containing protein  57.01 
 
 		 116 aa  144  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.525757  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7186  Cupin 2 conserved barrel domain protein  56.6 
 
 		 109 aa  144  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11503  putative pectin degradation protein  53.27 
 
 		 130 aa  141  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.380023  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1026  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50 
 
 		 120 aa  133  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.208422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1168  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.9 
 
 		 121 aa  130  5e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000921  putative pectin degradation protein  52.38 
 
 		 109 aa  128  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0780  cupin 2 domain-containing protein  50.48 
 
 		 106 aa  122  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3287  cupin 2 domain-containing protein  50 
 
 		 107 aa  118  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.927122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0257  cupin 2 domain-containing protein  47.92 
 
 		 130 aa  117  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3283  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  46.67 
 
 		 114 aa  116  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.219448 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3105  cupin 2 domain-containing protein  48.96 
 
 		 115 aa  111  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3670  cupin 2 domain-containing protein  46.67 
 
 		 107 aa  110  8.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183912  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4742  cupin 2 domain-containing protein  47.66 
 
 		 111 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000930389 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1911  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.71 
 
 		 110 aa  106  8.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0258222  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.71 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2641  pectin degradation protein  44.25 
 
 		 116 aa  106  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.229328 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1973  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.79 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.246266  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1805  cupin 2 domain-containing protein  45.87 
 
 		 110 aa  104  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.241802  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1696  cupin domain-containing protein  45.87 
 
 		 110 aa  104  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2204  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.71 
 
 		 110 aa  104  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.072688  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.87 
 
 		 110 aa  104  5e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6741  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.39 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.302286  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1659  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.67 
 
 		 108 aa  88.6  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3893  pectin degradation protein  41.05 
 
 		 113 aa  85.1  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0274  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  39.18 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2408  cupin 2 domain-containing protein  40.66 
 
 		 100 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.231406 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2135  cupin 2 domain-containing protein  40.66 
 
 		 100 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.769565  normal  0.829686 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0483  hypothetical protein  40.66 
 
 		 100 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.654168  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0483  cupin 2 domain-containing protein  42.22 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0731  cupin 2 domain-containing protein  32.08 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00910188  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.48 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8499800000000002e-33 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4192  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.37 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  hitchhiker  0.00969198 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.43 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3323  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.07 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00344723  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0833  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3039  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.71 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.124018 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.58 
 
 		 113 aa  62  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2268  cupin 2 domain-containing protein  25.49 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1863  cupin 2 domain-containing protein  31.25 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.524548 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1396  cupin 2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 102 aa  60.1  0.000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0571  pectin degradation protein kdgF  27.35 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3553  cupin 2 domain-containing protein  26.53 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2041  cupin 2 domain-containing protein  31.07 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267736 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0889  hypothetical protein  28.07 
 
 		 169 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2188  cupin 2 domain-containing protein  32.98 
 
 		 101 aa  57.4  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000987781  hitchhiker  0.00000388875 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2453  cupin domain-containing protein  28.97 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2589  pectin degradation protein KdgF  28.97 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.933509  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0865  cupin 2 domain-containing protein  32.65 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1005  cupin 2 domain-containing protein  24.75 
 
 		 114 aa  52.8  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2538  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.45 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0103935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1368  hypothetical protein  27.1 
 
 		 116 aa  50.8  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.505892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2655  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  29.63 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.104374  hitchhiker  0.00638268 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.96 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3290  cupin 2 domain-containing protein  30.99 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4530  cupin 2 domain-containing protein  26.97 
 
 		 140 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.812738  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0542  cupin 2, barrel  27.96 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1482  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.62 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.336107  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1623  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.33 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0837  cupin 2 domain-containing protein  24.04 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168826 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2195  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.28 
 
 		 189 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192313  decreased coverage  0.00112961 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2205  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.71 
 
 		 141 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0708  Nucleotidyl transferase  25.64 
 
 		 334 aa  42  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.509912  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1504  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.21 
 
 		 111 aa  42  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2444  hypothetical protein  30.69 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.406383  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2463  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.42 
 
 		 165 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0556151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>