73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0833 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0833  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 
117 aa  243  9e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64172  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.62 
 
 
115 aa  102  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0274  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  38.95 
 
 
111 aa  77.4  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2268  cupin 2 domain-containing protein  35.71 
 
 
111 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1168  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.97 
 
 
121 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.45 
 
 
113 aa  73.2  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0731  cupin 2 domain-containing protein  34.02 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00910188  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0257  cupin 2 domain-containing protein  31.19 
 
 
130 aa  67.8  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3553  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 
111 aa  67  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.69 
 
 
107 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8499800000000002e-33 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2041  cupin 2 domain-containing protein  33 
 
 
110 aa  66.6  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.267736 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1026  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.63 
 
 
120 aa  65.1  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.208422  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2840  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 
118 aa  64.7  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.862394  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 
113 aa  63.9  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11503  putative pectin degradation protein  33.63 
 
 
130 aa  63.5  0.0000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.380023  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3323  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.65 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00344723  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2538  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.3 
 
 
107 aa  61.6  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0103935  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3893  pectin degradation protein  37.89 
 
 
113 aa  61.6  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2189  cupin 2 domain-containing protein  29.66 
 
 
116 aa  61.2  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.525757  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.35 
 
 
113 aa  60.8  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7186  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.58 
 
 
109 aa  60.8  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2699  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34 
 
 
113 aa  60.5  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145082  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1659  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.67 
 
 
108 aa  60.5  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3283  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.91 
 
 
114 aa  60.1  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.219448 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35 
 
 
121 aa  60.1  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0571  pectin degradation protein kdgF  37.93 
 
 
138 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000921  putative pectin degradation protein  30.21 
 
 
109 aa  58.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1504  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.34 
 
 
111 aa  58.2  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220487  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1005  cupin 2 domain-containing protein  33.72 
 
 
114 aa  57.8  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3287  cupin 2 domain-containing protein  34.29 
 
 
107 aa  57.8  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.927122  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2655  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  39.53 
 
 
114 aa  57.4  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.104374  hitchhiker  0.00638268 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0889  hypothetical protein  36.78 
 
 
169 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2589  pectin degradation protein KdgF  36.78 
 
 
137 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.933509  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4742  cupin 2 domain-containing protein  31.71 
 
 
111 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000930389 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2453  cupin domain-containing protein  35.63 
 
 
137 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6741  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.49 
 
 
112 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.302286  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.49 
 
 
112 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.99 
 
 
112 aa  54.7  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4592  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36 
 
 
112 aa  54.7  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3105  cupin 2 domain-containing protein  29.47 
 
 
115 aa  54.7  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0780  cupin 2 domain-containing protein  31.58 
 
 
106 aa  53.9  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3670  cupin 2 domain-containing protein  28.42 
 
 
107 aa  52.8  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183912  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0865  cupin 2 domain-containing protein  32.94 
 
 
109 aa  50.8  0.000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1396  cupin 2 domain-containing protein  30.23 
 
 
102 aa  50.4  0.000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2408  cupin 2 domain-containing protein  30.53 
 
 
100 aa  50.1  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.231406 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0483  hypothetical protein  31.58 
 
 
100 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.654168  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0483  cupin 2 domain-containing protein  32.53 
 
 
111 aa  48.9  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2135  cupin 2 domain-containing protein  31.58 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.769565  normal  0.829686 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1805  cupin 2 domain-containing protein  27.84 
 
 
110 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.241802  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3039  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.19 
 
 
112 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.124018 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1973  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.84 
 
 
110 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.246266  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1696  cupin domain-containing protein  27.84 
 
 
110 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2352  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38 
 
 
113 aa  47.4  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3290  cupin 2 domain-containing protein  28.05 
 
 
126 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2641  pectin degradation protein  27.08 
 
 
116 aa  46.2  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.229328 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1863  cupin 2 domain-containing protein  31.76 
 
 
100 aa  46.2  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.524548 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1368  hypothetical protein  30 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.505892  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1911  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.84 
 
 
110 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0258222  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2204  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.78 
 
 
110 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.072688  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 
128 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0016638  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1024  cupin 2 domain-containing protein  36.21 
 
 
102 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  33.73 
 
 
133 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1623  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.56 
 
 
112 aa  44.3  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3678  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.48 
 
 
118 aa  44.3  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.1 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810725  normal 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4841  cupin 2 domain-containing protein  42.55 
 
 
202 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4773  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  29.51 
 
 
113 aa  42.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.459011  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2766  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.48 
 
 
115 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0847  cupin 2 domain-containing protein  28.41 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2444  hypothetical protein  40 
 
 
141 aa  41.2  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.406383  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4501  hypothetical protein  32.76 
 
 
112 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.465454  normal  0.16262 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0542  cupin 2, barrel  32.14 
 
 
122 aa  40.4  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0200  oxalate decarboxylase  35.19 
 
 
378 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.284083 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>