114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2352 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2352  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 
113 aa  232  1.0000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4592  Cupin 2 conserved barrel domain protein  74.77 
 
 
112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1504  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.73 
 
 
111 aa  101  4e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220487  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.44 
 
 
112 aa  99  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.74 
 
 
121 aa  96.7  9e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.71 
 
 
113 aa  91.3  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2583  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.62 
 
 
115 aa  75.5  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0826  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.74 
 
 
115 aa  70.9  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0731  cupin 2 domain-containing protein  36.19 
 
 
112 aa  60.5  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00910188  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.23 
 
 
113 aa  60.5  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0833  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38 
 
 
117 aa  58.2  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64172  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3553  cupin 2 domain-containing protein  34.41 
 
 
111 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2268  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 
111 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.56 
 
 
107 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8499800000000002e-33 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.64 
 
 
115 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0542  cupin 2, barrel  40.79 
 
 
122 aa  55.5  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2041  cupin 2 domain-containing protein  32.67 
 
 
110 aa  54.7  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.267736 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2699  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.04 
 
 
113 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145082  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1024  cupin 2 domain-containing protein  40.62 
 
 
102 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1911  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.63 
 
 
110 aa  51.6  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0258222  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7186  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.71 
 
 
109 aa  50.4  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2641  pectin degradation protein  29.29 
 
 
116 aa  50.4  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.229328 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.59 
 
 
113 aa  50.1  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0847  cupin 2 domain-containing protein  33.72 
 
 
116 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1696  cupin domain-containing protein  29.17 
 
 
110 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1805  cupin 2 domain-containing protein  29.17 
 
 
110 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.241802  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3039  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.63 
 
 
112 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.124018 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3664  hypothetical protein  35.63 
 
 
235 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1005  cupin 2 domain-containing protein  32.5 
 
 
114 aa  48.5  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.75 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0609  cupin sensor transcriptional regulator  39.13 
 
 
184 aa  48.1  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.176567  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1633  cupin 2 domain-containing protein  30.56 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3323  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.41 
 
 
107 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00344723  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11503  putative pectin degradation protein  29.79 
 
 
130 aa  47.4  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.380023  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1973  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.53 
 
 
110 aa  47.8  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.246266  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0518  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  32.43 
 
 
470 aa  45.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.405466  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0552  transcriptional regulator  30.77 
 
 
183 aa  45.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0032692  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2919  transcriptional regulator, XRE family  32.86 
 
 
170 aa  45.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1306  transcriptional regulator, XRE family  32.86 
 
 
170 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000237827 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3298  Cro/CI family transcriptional regulator  38.98 
 
 
187 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3670  cupin 2 domain-containing protein  27.55 
 
 
107 aa  44.7  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183912  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1168  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.69 
 
 
121 aa  44.7  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2766  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.53 
 
 
115 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  37.29 
 
 
181 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1026  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.05 
 
 
120 aa  44.3  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.208422  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.49 
 
 
132 aa  44.3  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0257  cupin 2 domain-containing protein  34 
 
 
130 aa  44.3  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06970  Cro/CI family transcriptional regulator  48.15 
 
 
184 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0638  putative transcriptional regulator  42.03 
 
 
184 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1941  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.7 
 
 
166 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  32 
 
 
186 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2094  transcriptional regulator Cro/CI family protein  32.86 
 
 
188 aa  43.9  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  32 
 
 
186 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0980  XRE family transcriptional regulator  32.86 
 
 
181 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000294477  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  32 
 
 
186 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1659  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.49 
 
 
108 aa  43.9  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4917  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 
184 aa  43.9  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
186 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 
163 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  35.59 
 
 
181 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
181 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2209  MerR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000991087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
181 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.13 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1368  hypothetical protein  32.84 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.505892  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3153  cupin 2 domain-containing protein  32.05 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4841  cupin 2 domain-containing protein  38.33 
 
 
202 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1662  cupin 2 domain-containing protein  35.94 
 
 
108 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000140317  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0300  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.71 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  35.59 
 
 
181 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  37.29 
 
 
181 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  35.59 
 
 
181 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2204  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.77 
 
 
110 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.072688  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2171  transcriptional regulator  34.48 
 
 
184 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.809699 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3247  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 
187 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000592797 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0230  transcriptional regulator  45.65 
 
 
197 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
292 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4609  XRE family transcriptional regulator  32.08 
 
 
229 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0865  cupin 2 domain-containing protein  30.86 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2821  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 
199 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0587  cupin 2 domain-containing protein  31.75 
 
 
184 aa  42.4  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0780  cupin 2 domain-containing protein  30.61 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3249  cupin 2 domain-containing protein  33.77 
 
 
166 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  32.93 
 
 
186 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  34.15 
 
 
186 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.89 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  32.14 
 
 
129 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  32.84 
 
 
148 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02199  hypothetical protein  33.8 
 
 
139 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3954  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 
105 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.266948 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5217  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.81 
 
 
112 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181963  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0495  transcriptional regulator, XRE family  28.75 
 
 
184 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3893  pectin degradation protein  31.43 
 
 
113 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  33.9 
 
 
181 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  33.9 
 
 
181 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3329  transcriptional regulator  43.18 
 
 
201 aa  41.2  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.855836  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 
181 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2600  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.556264 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.42 
 
 
110 aa  41.2  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2366  transcriptional regulator, XRE family  31.03 
 
 
184 aa  41.2  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>