More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0638 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0638  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 184 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06970  Cro/CI family transcriptional regulator  95.65 
 
 		 184 aa  356  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2635  XRE family transcriptional regulator  59.44 
 
 		 185 aa  210  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.362634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0803  XRE family transcriptional regulator  56.35 
 
 		 185 aa  205  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215741  normal  0.130979 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5384  XRE family transcriptional regulator  55.8 
 
 		 185 aa  202  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  normal  0.424249 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4807  XRE family transcriptional regulator  55.25 
 
 		 185 aa  202  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3464  XRE family transcriptional regulator  55.8 
 
 		 185 aa  202  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4902  XRE family transcriptional regulator  55.8 
 
 		 185 aa  202  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.634753 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3720  XRE family transcriptional regulator  55.25 
 
 		 200 aa  201  7e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.310668  normal  0.0265405 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4279  XRE family transcriptional regulator  54.7 
 
 		 185 aa  198  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3556  XRE family transcriptional regulator  56.28 
 
 		 184 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.427188  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2181  Cro/CI family transcriptional regulator  56.28 
 
 		 184 aa  192  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1846  XRE family transcriptional regulator  54.4 
 
 		 183 aa  192  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.677123  hitchhiker  0.00632075 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1788  XRE family transcriptional regulator  55.74 
 
 		 184 aa  190  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1784  XRE family transcriptional regulator  52.2 
 
 		 184 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2177  transcriptional regulator, putative  52.2 
 
 		 184 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3560  XRE family transcriptional regulator  53.07 
 
 		 184 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.444346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4917  XRE family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 184 aa  106  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3867  XRE family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 201 aa  106  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3586  XRE family transcriptional regulator  41.21 
 
 		 207 aa  105  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2821  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 199 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2868  Cro/CI family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 199 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2913  XRE family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 199 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5722  putative transcriptional regulator  34.09 
 
 		 199 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4841  cupin 2 domain-containing protein  35.36 
 
 		 202 aa  101  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65950  putative transcriptional regulator  33.52 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0230  transcriptional regulator  34.5 
 
 		 197 aa  94.7  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1480  XRE family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 198 aa  90.9  9e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0641  XRE family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 211 aa  86.3  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199173  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2294  XRE family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 211 aa  86.3  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  28.65 
 
 		 181 aa  84.3  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  28.65 
 
 		 181 aa  84.3  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  28.07 
 
 		 181 aa  84.3  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  28.65 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  28.07 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  28.07 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  27.49 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2836  DNA-binding protein  27.81 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000716748  hitchhiker  0.00000000374058 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 181 aa  81.3  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 199 aa  80.5  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2578  transcriptional regulator, XRE family  33.71 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0965  transcriptional regulator, XRE family  31.03 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 181 aa  79  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  27.72 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  31.69 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1457  transcriptional regulator  26.09 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.96188e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0751  XRE family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000101746  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  31.11 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  32.18 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  32.18 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  32.18 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  32.18 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  32.18 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  32.18 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4729  XRE family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  31.69 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5317  XRE family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221767  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0847  XRE family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1034  transcriptional regulator, XRE family  27.47 
 
 		 181 aa  74.7  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000342515  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0188  XRE family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 229 aa  74.3  0.0000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.054457 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  28.18 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  31.46 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0772  transcriptional regulator  31.72 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.855503 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2265  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 433 aa  73.2  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.796244  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2046  XRE family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298774  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  27.65 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  27.65 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  27.65 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  27.06 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1456  xenobiotic response element family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01823e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  26.49 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  30.46 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0361  XRE family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0898  XRE family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  30.59 
 
 		 201 aa  67.8  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16550  predicted transcriptional regulator  32.7 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4415  XRE family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0274  transcriptional regulator, XRE family  32.39 
 
 		 205 aa  67  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.64998  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1721  XRE family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 201 aa  67  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  27.71 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  28.74 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  25.56 
 
 		 175 aa  66.2  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2222  DNA-binding protein  28.57 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  30.81 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>