More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2294 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0641  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 211 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199173  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2294  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 211 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0230  transcriptional regulator  42.7 
 
 		 197 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4841  cupin 2 domain-containing protein  37.91 
 
 		 202 aa  119  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3867  XRE family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 201 aa  111  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5722  putative transcriptional regulator  35.33 
 
 		 199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65950  putative transcriptional regulator  35.33 
 
 		 199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2821  XRE family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 199 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2868  Cro/CI family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2913  XRE family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 199 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0772  transcriptional regulator  36.51 
 
 		 204 aa  105  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.855503 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1441  XRE family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 227 aa  103  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0636175 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1027  XRE family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 292 aa  97.8  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 178 aa  96.3  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16550  predicted transcriptional regulator  36.05 
 
 		 204 aa  95.5  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0188  XRE family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 229 aa  95.5  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.054457 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0361  XRE family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 205 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2042  transcriptional regulator  32.94 
 
 		 188 aa  91.3  9e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  30.9 
 
 		 192 aa  90.5  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2635  XRE family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 185 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.362634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 176 aa  89.4  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4679  putative transcriptional regulator  27.47 
 
 		 180 aa  89  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  29.21 
 
 		 188 aa  88.6  5e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 201 aa  88.6  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3586  XRE family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 207 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2366  transcriptional regulator, XRE family  32.34 
 
 		 184 aa  86.7  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  27.22 
 
 		 201 aa  86.3  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0638  putative transcriptional regulator  32.77 
 
 		 184 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2177  transcriptional regulator, putative  31.21 
 
 		 184 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3560  XRE family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 184 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.444346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06970  Cro/CI family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 184 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 182 aa  85.1  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  26.92 
 
 		 175 aa  84.7  8e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2734  XRE family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 178 aa  84.7  9e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00297691  normal  0.0817302 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2578  transcriptional regulator, XRE family  34.64 
 
 		 182 aa  84.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0751  XRE family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 179 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000101746  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  30.17 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  34.86 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2046  XRE family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0842  cupin 2 domain-containing protein  31.55 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1265  transcriptional regulator, putative  30.3 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0202  XRE family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.614203  hitchhiker  0.00167713 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  26.14 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5113  putative transcriptional regulator  29.95 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0238  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  31.74 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58380  putative transcriptional regulator  29.95 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3195  transcriptional regulator, XRE family  28.48 
 
 		 182 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0639399 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3100  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 208 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.510523  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2125  transcriptional regulator  29.57 
 
 		 182 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1457  transcriptional regulator  29.12 
 
 		 188 aa  80.9  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.96188e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1195  XRE family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 182 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3329  transcriptional regulator  29.61 
 
 		 201 aa  81.3  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.855836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2836  DNA-binding protein  26.55 
 
 		 184 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000716748  hitchhiker  0.00000000374058 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1104  cupin 2 domain-containing protein  28.48 
 
 		 182 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.183758  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2921  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 208 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.899455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3003  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 208 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1163  cupin 2 domain-containing protein  28.48 
 
 		 182 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.967119  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69980  putative transcriptional regulator  30.54 
 
 		 182 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 199 aa  80.9  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4807  XRE family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730727  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  25.57 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  25.57 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5384  XRE family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  normal  0.424249 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  25.57 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  26.14 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6075  putative transcriptional regulator  30.54 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  25.57 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3464  XRE family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4279  XRE family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4902  XRE family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.634753 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  26.14 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2705  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.11 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.847169  normal  0.058179 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3551  transcriptional regulator, XRE family  34.05 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3217  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  28.02 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00931444 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0733  aldehyde dehydrogenase-like protein  31.74 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126553  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0641  aldehyde dehydrogenase-like protein  31.74 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0980  XRE family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000294477  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1058  XRE family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1784  XRE family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  30 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0105  DNA-binding protein  31.14 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2025  aldehyde dehydrogenase-like protein  31.74 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5320  XRE family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.8166  normal  0.310919 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  29.12 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0965  transcriptional regulator, XRE family  27.12 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5178  XRE family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 199 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0847  XRE family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3684  transcriptional regulator, XRE family  29.19 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000437538  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  27.17 
 
 		 236 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5268  Cro/CI family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0544  XRE family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>