More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1539 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
292 aa  593  1e-168  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4357  transcriptional regulator, MerR family  40.15 
 
 
269 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00580847 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4678  MerR family transcriptional regulator  39.55 
 
 
276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.825044  normal  0.111013 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  38.15 
 
 
292 aa  172  5e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7693  transcriptional regulator MerR family  41.2 
 
 
271 aa  172  5.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4027  transcriptional regulator, MerR family  39.48 
 
 
269 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2278  MerR family transcriptional regulator  32.1 
 
 
273 aa  149  6e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.408305  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5613  transcriptional regulator, MerR family  29.57 
 
 
283 aa  119  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.395167  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4841  cupin 2 domain-containing protein  35.48 
 
 
202 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2540  Cro/CI family transcriptional regulator  37.64 
 
 
181 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0901  XRE family transcriptional regulator  37.08 
 
 
181 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000108423 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0230  transcriptional regulator  36.79 
 
 
197 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5722  putative transcriptional regulator  36.26 
 
 
199 aa  109  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  33.9 
 
 
188 aa  109  6e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  34.3 
 
 
176 aa  109  6e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65950  putative transcriptional regulator  35.16 
 
 
199 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1306  transcriptional regulator, XRE family  36.97 
 
 
170 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000237827 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0980  XRE family transcriptional regulator  34.08 
 
 
181 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000294477  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2919  transcriptional regulator, XRE family  36.97 
 
 
170 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  34.46 
 
 
178 aa  106  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0277  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 
204 aa  106  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.128046  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  34.83 
 
 
192 aa  105  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2821  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 
199 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6084  XRE family transcriptional regulator  35.86 
 
 
234 aa  105  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.207069 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0751  XRE family transcriptional regulator  32.22 
 
 
179 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000101746  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2868  Cro/CI family transcriptional regulator  33.83 
 
 
199 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3867  XRE family transcriptional regulator  33.83 
 
 
201 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2705  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  36.26 
 
 
203 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.847169  normal  0.058179 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2913  XRE family transcriptional regulator  34.72 
 
 
199 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0750  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 
181 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0884701 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3586  XRE family transcriptional regulator  40.83 
 
 
207 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 
211 aa  102  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2901  DNA-binding protein  35.71 
 
 
182 aa  102  9e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4679  putative transcriptional regulator  33.15 
 
 
180 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  33.88 
 
 
189 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3329  transcriptional regulator  35.59 
 
 
201 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.855836  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3263  transcriptional regulator, XRE family  34.81 
 
 
188 aa  100  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3247  XRE family transcriptional regulator  35.52 
 
 
187 aa  100  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000592797 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0248  XRE family transcriptional regulator  32.97 
 
 
182 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0898  XRE family transcriptional regulator  31.11 
 
 
179 aa  100  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0650  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
187 aa  99.4  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3298  Cro/CI family transcriptional regulator  34.97 
 
 
187 aa  99.4  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0888  transcriptional regulator, XRE family  30.9 
 
 
179 aa  99  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118183  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2294  XRE family transcriptional regulator  35.39 
 
 
211 aa  98.6  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  33.16 
 
 
192 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0641  XRE family transcriptional regulator  35.39 
 
 
211 aa  98.6  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199173  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2094  transcriptional regulator Cro/CI family protein  30.73 
 
 
188 aa  98.6  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0524  XRE family transcriptional regulator  34.24 
 
 
187 aa  98.6  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000827128  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  33.16 
 
 
192 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
193 aa  97.8  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3684  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 
180 aa  97.8  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000437538  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  31.25 
 
 
180 aa  97.4  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2578  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 
182 aa  97.1  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4729  XRE family transcriptional regulator  33.16 
 
 
192 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  33.16 
 
 
192 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5317  XRE family transcriptional regulator  33.16 
 
 
192 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221767  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5523  transcriptional regulator  33.33 
 
 
182 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
191 aa  96.3  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  32.4 
 
 
191 aa  96.3  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5178  XRE family transcriptional regulator  31.47 
 
 
199 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0925  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 
205 aa  95.5  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6075  putative transcriptional regulator  31.69 
 
 
182 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1058  XRE family transcriptional regulator  32.04 
 
 
184 aa  95.5  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 
201 aa  95.5  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0202  XRE family transcriptional regulator  32.97 
 
 
182 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.614203  hitchhiker  0.00167713 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5268  Cro/CI family transcriptional regulator  32.79 
 
 
182 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1456  xenobiotic response element family transcriptional regulator  30.56 
 
 
188 aa  94.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01823e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  32.82 
 
 
190 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5320  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 
182 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.8166  normal  0.310919 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0361  XRE family transcriptional regulator  37.65 
 
 
205 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  33.16 
 
 
193 aa  94  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69980  putative transcriptional regulator  31.69 
 
 
182 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  28.89 
 
 
199 aa  93.2  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2125  transcriptional regulator  35.71 
 
 
182 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1889  transcriptional regulator, XRE family  32.79 
 
 
188 aa  93.6  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2320  transcriptional regulator, XRE family  32.24 
 
 
188 aa  93.2  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  26.86 
 
 
175 aa  92.8  6e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2734  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 
178 aa  92.8  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00297691  normal  0.0817302 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8486  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 
204 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  32.31 
 
 
190 aa  92.8  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0274  transcriptional regulator, XRE family  38.64 
 
 
205 aa  92.4  8e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.64998  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  33.51 
 
 
179 aa  92.4  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  33.51 
 
 
179 aa  92.4  8e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  33.51 
 
 
179 aa  92.4  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  33.51 
 
 
179 aa  92.4  8e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  33.51 
 
 
179 aa  92.4  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  33.51 
 
 
179 aa  92.4  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  33.51 
 
 
236 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  34.09 
 
 
201 aa  91.7  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2714  XRE family transcriptional regulator  31.43 
 
 
204 aa  92  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1046  XRE family transcriptional regulator  34.97 
 
 
186 aa  92  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1128  XRE family transcriptional regulator  30.39 
 
 
182 aa  91.7  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  33.51 
 
 
236 aa  91.3  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3217  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  33.15 
 
 
185 aa  91.3  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00931444 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58380  putative transcriptional regulator  32.8 
 
 
187 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2347  transcriptional regulator, XRE family  31.69 
 
 
185 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.204857  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1509  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  31.69 
 
 
185 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01287  hypothetical protein  31.69 
 
 
185 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1414  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  31.69 
 
 
185 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  31.11 
 
 
181 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>