More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_58380 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_58380  putative transcriptional regulator  100 
 
 
187 aa  387  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5113  putative transcriptional regulator  98.93 
 
 
187 aa  384  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0842  cupin 2 domain-containing protein  81.72 
 
 
188 aa  313  8e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3025  XRE family transcriptional regulator  58.1 
 
 
281 aa  218  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.925102 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6377  XRE family transcriptional regulator  56.67 
 
 
286 aa  218  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3049  XRE family transcriptional regulator  55.31 
 
 
259 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0258201 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2416  XRE family transcriptional regulator  55.31 
 
 
259 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3030  XRE family transcriptional regulator  55.31 
 
 
259 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3075  XRE family transcriptional regulator  54.19 
 
 
269 aa  205  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2941  XRE family transcriptional regulator  54.19 
 
 
271 aa  205  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0631546  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1575  DNA-binding protein  56.02 
 
 
249 aa  193  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1565  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0768  DNA-binding protein  55.42 
 
 
242 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377611  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1146  DNA-binding protein  55.42 
 
 
247 aa  189  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112687  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1732  DNA-binding protein  55.42 
 
 
247 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0698  DNA-binding protein  55.42 
 
 
247 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0375351  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2423  DNA-binding protein  55.42 
 
 
247 aa  189  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1221  DNA-binding protein  55.42 
 
 
247 aa  189  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0563936  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  34.46 
 
 
191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  33.9 
 
 
191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2046  XRE family transcriptional regulator  30.68 
 
 
205 aa  108  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298774  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
189 aa  108  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  34.27 
 
 
190 aa  105  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  33.71 
 
 
193 aa  104  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
190 aa  104  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  32.58 
 
 
236 aa  103  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  32.58 
 
 
179 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  32.58 
 
 
179 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  32.58 
 
 
179 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  32.58 
 
 
179 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  32.58 
 
 
179 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  32.58 
 
 
236 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  33.15 
 
 
193 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  32.58 
 
 
179 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2714  XRE family transcriptional regulator  29.38 
 
 
204 aa  102  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  32.58 
 
 
192 aa  101  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  32.58 
 
 
192 aa  101  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4729  XRE family transcriptional regulator  32.58 
 
 
192 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  31.67 
 
 
180 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  30.51 
 
 
191 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5317  XRE family transcriptional regulator  32.58 
 
 
192 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221767  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  32.58 
 
 
192 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  29.94 
 
 
191 aa  98.2  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  29.94 
 
 
191 aa  98.2  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  29.94 
 
 
191 aa  98.2  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
292 aa  90.9  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3096  transcriptional regulator, XRE family  31.67 
 
 
192 aa  87.4  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00124629  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1721  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 
201 aa  87.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  31.98 
 
 
188 aa  85.9  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  31.98 
 
 
176 aa  85.9  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2948  transcriptional regulator, XRE family  33.52 
 
 
225 aa  85.5  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211039  hitchhiker  0.000112709 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
178 aa  85.1  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
211 aa  85.1  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3867  XRE family transcriptional regulator  32.77 
 
 
201 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0750  transcriptional regulator, XRE family  29.35 
 
 
181 aa  84.3  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0884701 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2578  transcriptional regulator, XRE family  36.14 
 
 
182 aa  82.4  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0751  XRE family transcriptional regulator  29.89 
 
 
179 aa  82.8  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000101746  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2294  XRE family transcriptional regulator  29.95 
 
 
211 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2821  XRE family transcriptional regulator  32.04 
 
 
199 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0641  XRE family transcriptional regulator  29.95 
 
 
211 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199173  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.43 
 
 
189 aa  80.5  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
201 aa  80.5  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0847  XRE family transcriptional regulator  31.79 
 
 
191 aa  80.5  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2913  XRE family transcriptional regulator  31.49 
 
 
199 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2868  Cro/CI family transcriptional regulator  31.49 
 
 
199 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3050  transcriptional regulator, XRE family  30.64 
 
 
195 aa  79.3  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0215158  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5722  putative transcriptional regulator  32.78 
 
 
199 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0062  transcriptional regulator  30.65 
 
 
211 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6084  XRE family transcriptional regulator  32.63 
 
 
234 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.207069 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0230  transcriptional regulator  30.22 
 
 
197 aa  79  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
292 aa  78.2  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1559  transcriptional regulator, XRE family  30.73 
 
 
262 aa  78.2  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65950  putative transcriptional regulator  31.67 
 
 
199 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  30.81 
 
 
182 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0980  XRE family transcriptional regulator  27.01 
 
 
181 aa  77  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000294477  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  32.02 
 
 
181 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5086  putative transcriptional regulator, XRE family  31.21 
 
 
192 aa  77.4  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2540  Cro/CI family transcriptional regulator  26.82 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  31.46 
 
 
181 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
181 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  31.46 
 
 
181 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  31.46 
 
 
181 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  31.46 
 
 
181 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1987  transcriptional regulator, XRE family  30.98 
 
 
187 aa  75.9  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144245  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  31.28 
 
 
181 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4678  MerR family transcriptional regulator  30.68 
 
 
276 aa  75.5  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.825044  normal  0.111013 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  31.46 
 
 
181 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0965  transcriptional regulator, XRE family  32.37 
 
 
191 aa  75.5  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2919  transcriptional regulator, XRE family  28.3 
 
 
170 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1306  transcriptional regulator, XRE family  28.3 
 
 
170 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000237827 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0715  transcriptional regulator, XRE family  32.56 
 
 
187 aa  75.1  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.39864  normal  0.0327391 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0901  XRE family transcriptional regulator  26.26 
 
 
181 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000108423 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1034  transcriptional regulator, XRE family  29.49 
 
 
181 aa  74.7  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000342515  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  31.68 
 
 
181 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  31.68 
 
 
181 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7693  transcriptional regulator MerR family  30.11 
 
 
271 aa  74.7  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1154  XRE family transcriptional regulator  25.41 
 
 
204 aa  74.7  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0376883  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3684  transcriptional regulator, XRE family  28.42 
 
 
180 aa  74.3  0.0000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000437538  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2247  transcriptional regulator, XRE family  30.22 
 
 
190 aa  73.9  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2231  transcriptional regulator, XRE family  29.44 
 
 
190 aa  73.9  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0888  transcriptional regulator, XRE family  26.7 
 
 
179 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>