More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1507 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 211 aa  429  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1457  transcriptional regulator  33.9 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.96188e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3438  XRE family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 198 aa  104  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0878  cupin 2 domain-containing protein  31.87 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000206175  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  31.67 
 
 		 180 aa  102  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  28.04 
 
 		 192 aa  101  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2625  transcriptional regulator, XRE family  37.97 
 
 		 217 aa  101  9e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4415  XRE family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2148  DNA-binding protein, putative  33.15 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1806  transcriptional regulator, XRE family  33.15 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3100  XRE family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.510523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1154  XRE family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0376883  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2921  XRE family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.899455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3003  XRE family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 176 aa  100  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0079  Cro/CI family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 196 aa  99.8  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  31.25 
 
 		 188 aa  99.8  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0944  transcriptional regulator  33.53 
 
 		 189 aa  99.8  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5637  transcriptional regulator, XRE family  34.62 
 
 		 227 aa  99.4  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.76756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4668  transcriptional regulator, XRE family  33.53 
 
 		 183 aa  99.4  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.443743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6009  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 219 aa  99  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.285081  hitchhiker  0.00726065 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 182 aa  99.4  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6574  transcriptional regulator, XRE family  34.62 
 
 		 227 aa  99  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0448941 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3393  transcriptional regulator, XRE family  30.98 
 
 		 199 aa  99  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000124891  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2901  XRE family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 183 aa  99  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3038  XRE family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 183 aa  99  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1265  transcriptional regulator, putative  30.98 
 
 		 182 aa  98.6  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2946  transcriptional regulator  30.43 
 
 		 197 aa  97.8  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6340  XRE family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 183 aa  97.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3456  transcriptional regulator, XRE family  30.43 
 
 		 199 aa  97.4  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3011  XRE family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 183 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2377  XRE family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 183 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1091  XRE family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 182 aa  97.8  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.158888  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2991  XRE family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 183 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2985  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 183 aa  97.1  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0238  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.85 
 
 		 199 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2366  transcriptional regulator, XRE family  33.71 
 
 		 184 aa  97.1  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 182 aa  97.1  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3161  XRE family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 182 aa  97.1  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1456  xenobiotic response element family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 188 aa  96.3  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01823e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 292 aa  96.3  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4679  putative transcriptional regulator  31.79 
 
 		 180 aa  95.9  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 191 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2025  aldehyde dehydrogenase-like protein  34.71 
 
 		 189 aa  95.5  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0733  aldehyde dehydrogenase-like protein  34.71 
 
 		 183 aa  95.9  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126553  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0641  aldehyde dehydrogenase-like protein  34.71 
 
 		 183 aa  95.9  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 191 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 191 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69980  putative transcriptional regulator  29.95 
 
 		 182 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1139  transcriptional regulator  32.34 
 
 		 232 aa  95.1  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  0.0958639 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3301  XRE family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 234 aa  95.5  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1195  XRE family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 182 aa  94.7  8e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3195  transcriptional regulator, XRE family  28.42 
 
 		 182 aa  94.7  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0639399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1104  cupin 2 domain-containing protein  28.42 
 
 		 182 aa  94.7  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.183758  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1163  cupin 2 domain-containing protein  28.42 
 
 		 182 aa  94.7  8e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.967119  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1039  MerR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 192 aa  94.4  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5523  transcriptional regulator  31.67 
 
 		 182 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2042  transcriptional regulator  33.7 
 
 		 188 aa  94.4  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1943  Cro/CI family transcriptional regulator putative  33.92 
 
 		 189 aa  94  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.693839  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5748  transcriptional regulator  34.07 
 
 		 219 aa  94.4  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4834  transcriptional regulator, XRE family  29.94 
 
 		 182 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.197047  normal  0.0345523 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0105  DNA-binding protein  32.78 
 
 		 199 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5320  XRE family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 182 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.8166  normal  0.310919 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0202  XRE family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 182 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.614203  hitchhiker  0.00167713 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6075  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 		 182 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5268  Cro/CI family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 182 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0248  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 182 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1587  helix-turn-helix domain-containing protein  29.84 
 
 		 192 aa  92.4  5e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0980  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 181 aa  92  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000294477  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5178  XRE family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 199 aa  92  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1443  XRE family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 182 aa  92  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0325  XRE family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 192 aa  91.7  8e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4784  transcriptional regulator, XRE family  29.38 
 
 		 182 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0510271 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47950  Cupin, RmlC-type protein  32.97 
 
 		 182 aa  90.9  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1871  putative HTH-type transcriptional regulator  34.62 
 
 		 215 aa  91.3  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0589891  normal  0.573197 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1058  XRE family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 184 aa  91.3  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1987  transcriptional regulator, XRE family  35.76 
 
 		 187 aa  90.9  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144245  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3869  XRE family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 183 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1941  transcriptional regulator  34.15 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0925  transcriptional regulator, putative  29.61 
 
 		 182 aa  90.1  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 191 aa  90.5  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0867  putative transcriptional regulator  29.61 
 
 		 182 aa  90.1  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0318952  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2646  XRE family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 182 aa  90.1  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0544  XRE family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 203 aa  90.1  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2705  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  32.09 
 
 		 203 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.847169  normal  0.058179 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2901  DNA-binding protein  32.24 
 
 		 182 aa  89  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0766  XRE family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 183 aa  89  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3261  XRE family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 190 aa  89.4  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.957848  normal  0.179215 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1128  XRE family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 182 aa  89  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2578  transcriptional regulator, XRE family  35.87 
 
 		 182 aa  89  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  32.97 
 
 		 201 aa  89  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3411  transcriptional regulator, XRE family  31.16 
 
 		 183 aa  88.2  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2819  MerR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 192 aa  88.2  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5931  transcriptional regulator, XRE family  34.24 
 
 		 190 aa  88.2  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 178 aa  88.2  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1444  cupin 2 domain-containing protein  28.8 
 
 		 192 aa  87.4  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1306  transcriptional regulator, XRE family  31.65 
 
 		 170 aa  86.7  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000237827 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2125  transcriptional regulator  32.4 
 
 		 182 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2919  transcriptional regulator, XRE family  31.65 
 
 		 170 aa  86.7  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>