More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0766 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0766  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 183 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3869  XRE family transcriptional regulator  96.72 
 
 		 183 aa  360  6e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3411  transcriptional regulator, XRE family  87.98 
 
 		 183 aa  338  4e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4834  transcriptional regulator, XRE family  77.09 
 
 		 182 aa  297  6e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.197047  normal  0.0345523 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3161  XRE family transcriptional regulator  77.65 
 
 		 182 aa  296  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4784  transcriptional regulator, XRE family  77.65 
 
 		 182 aa  295  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0510271 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1077  XRE family transcriptional regulator  77.6 
 
 		 186 aa  290  7e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1443  XRE family transcriptional regulator  74.3 
 
 		 182 aa  285  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0925  transcriptional regulator, putative  74.86 
 
 		 182 aa  284  5e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0867  putative transcriptional regulator  74.86 
 
 		 182 aa  284  5e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0318952  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3261  XRE family transcriptional regulator  65.75 
 
 		 190 aa  248  3e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.957848  normal  0.179215 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2366  transcriptional regulator, XRE family  60.44 
 
 		 184 aa  208  4e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0544  XRE family transcriptional regulator  54.75 
 
 		 203 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2042  transcriptional regulator  53.8 
 
 		 188 aa  192  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0277  XRE family transcriptional regulator  54.19 
 
 		 204 aa  192  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.128046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3100  XRE family transcriptional regulator  47.03 
 
 		 208 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.510523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2921  XRE family transcriptional regulator  47.03 
 
 		 208 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.899455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3003  XRE family transcriptional regulator  47.03 
 
 		 208 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69980  putative transcriptional regulator  49.72 
 
 		 182 aa  181  6e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  47.8 
 
 		 182 aa  181  7e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1265  transcriptional regulator, putative  47.51 
 
 		 182 aa  179  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3011  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 183 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2377  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 183 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1128  XRE family transcriptional regulator  47.51 
 
 		 182 aa  179  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2991  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 183 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6075  putative transcriptional regulator  49.17 
 
 		 182 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6340  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 183 aa  178  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1091  XRE family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 182 aa  178  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.158888  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0105  DNA-binding protein  46.96 
 
 		 199 aa  177  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5178  XRE family transcriptional regulator  48.62 
 
 		 199 aa  177  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5268  Cro/CI family transcriptional regulator  48.62 
 
 		 182 aa  177  7e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1195  XRE family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 182 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3195  transcriptional regulator, XRE family  46.41 
 
 		 182 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0639399 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0238  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  47.51 
 
 		 199 aa  176  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5320  XRE family transcriptional regulator  48.07 
 
 		 182 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.8166  normal  0.310919 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1163  cupin 2 domain-containing protein  46.41 
 
 		 182 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.967119  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1104  cupin 2 domain-containing protein  46.41 
 
 		 182 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.183758  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2901  XRE family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 183 aa  176  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3038  XRE family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 183 aa  176  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2985  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 183 aa  174  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1058  XRE family transcriptional regulator  45.86 
 
 		 184 aa  174  6e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0202  XRE family transcriptional regulator  48.07 
 
 		 182 aa  174  9e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.614203  hitchhiker  0.00167713 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2087  XRE family transcriptional regulator  53.26 
 
 		 195 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2646  XRE family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 182 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1943  Cro/CI family transcriptional regulator putative  46.7 
 
 		 189 aa  170  7.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.693839  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0944  transcriptional regulator  47.22 
 
 		 189 aa  170  7.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 182 aa  169  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4668  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 183 aa  167  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.443743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0248  XRE family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 182 aa  167  7e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0733  aldehyde dehydrogenase-like protein  46.15 
 
 		 183 aa  167  9e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126553  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0641  aldehyde dehydrogenase-like protein  46.15 
 
 		 183 aa  167  9e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2025  aldehyde dehydrogenase-like protein  46.15 
 
 		 189 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5523  transcriptional regulator  45.3 
 
 		 182 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47950  Cupin, RmlC-type protein  45.3 
 
 		 182 aa  162  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4415  XRE family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 213 aa  160  8.000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2901  DNA-binding protein  41.99 
 
 		 182 aa  159  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2705  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  43.09 
 
 		 203 aa  159  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.847169  normal  0.058179 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2884  XRE family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 181 aa  153  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0819457  normal  0.480487 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2898  XRE family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 181 aa  153  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2806  XRE family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 181 aa  153  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4679  putative transcriptional regulator  41.34 
 
 		 180 aa  151  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2125  transcriptional regulator  41.44 
 
 		 182 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2387  XRE family transcriptional regulator  43.09 
 
 		 181 aa  150  7e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3013  XRE family transcriptional regulator  45.3 
 
 		 182 aa  150  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1714  XRE family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 182 aa  138  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.510937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3217  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  34.27 
 
 		 185 aa  105  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00931444 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01276  DNA-binding transcriptional repressor  33.52 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2347  transcriptional regulator, XRE family  33.52 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.204857  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1509  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  33.52 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2326  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  33.52 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1823  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  33.52 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0706879 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01287  hypothetical protein  33.52 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1414  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  33.52 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1535  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  33.52 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1941  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  33.52 
 
 		 185 aa  102  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.385308 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1604  XRE family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 175 aa  99  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000175154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2066  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  32.4 
 
 		 185 aa  96.3  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3329  transcriptional regulator  34.83 
 
 		 201 aa  91.3  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.855836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0980  XRE family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 181 aa  89.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000294477  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  29.55 
 
 		 211 aa  89  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2540  Cro/CI family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 181 aa  89  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2094  transcriptional regulator Cro/CI family protein  29.67 
 
 		 188 aa  88.6  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2919  transcriptional regulator, XRE family  29.38 
 
 		 170 aa  87.4  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 178 aa  87  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1306  transcriptional regulator, XRE family  29.38 
 
 		 170 aa  87.4  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000237827 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  31.87 
 
 		 192 aa  86.7  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3586  XRE family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 207 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2836  DNA-binding protein  31.72 
 
 		 184 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000716748  hitchhiker  0.00000000374058 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  32.54 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0901  XRE family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 181 aa  80.9  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108423 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1457  transcriptional regulator  27.87 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.96188e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  31.52 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0751  XRE family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000101746  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5143  putative transcriptional regulator, XRE family  32.14 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0117731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2913  XRE family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0230  transcriptional regulator  30.17 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  32.24 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6084  XRE family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.207069 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>