More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6084 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6084  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 234 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.207069 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3329  transcriptional regulator  51.58 
 
 		 201 aa  188  5e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.855836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0751  XRE family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 179 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000101746  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4609  XRE family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 229 aa  106  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 292 aa  105  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2868  Cro/CI family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2913  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65950  putative transcriptional regulator  34.31 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2540  Cro/CI family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 181 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4729  XRE family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 192 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 192 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 193 aa  102  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2821  XRE family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 199 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5317  XRE family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 192 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221767  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2046  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 205 aa  102  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0901  XRE family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 181 aa  101  9e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108423 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5722  putative transcriptional regulator  33.18 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2094  transcriptional regulator Cro/CI family protein  30.61 
 
 		 188 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7693  transcriptional regulator MerR family  36.22 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 191 aa  99.8  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  34.12 
 
 		 236 aa  99.4  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  33.85 
 
 		 191 aa  99.4  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0277  XRE family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 204 aa  99.4  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.128046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 189 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2714  XRE family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 204 aa  97.8  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0980  XRE family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 181 aa  97.1  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000294477  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  35.05 
 
 		 236 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  97.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  35.26 
 
 		 179 aa  96.7  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  35.26 
 
 		 179 aa  96.7  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  30.65 
 
 		 192 aa  96.7  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  35.26 
 
 		 179 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  35.26 
 
 		 179 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  35.26 
 
 		 179 aa  96.7  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  35.26 
 
 		 179 aa  96.7  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 190 aa  96.3  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  35.45 
 
 		 201 aa  95.5  7e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 178 aa  94  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0248  XRE family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 182 aa  94  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  33.51 
 
 		 190 aa  94  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5523  transcriptional regulator  30.26 
 
 		 182 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1441  XRE family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 227 aa  92.8  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0636175 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3867  XRE family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 201 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 191 aa  92.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 191 aa  92.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 191 aa  92.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0105  DNA-binding protein  30.35 
 
 		 199 aa  92  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0772  transcriptional regulator  37 
 
 		 204 aa  92  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.855503 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0238  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.35 
 
 		 199 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  27.27 
 
 		 175 aa  91.7  9e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4027  transcriptional regulator, MerR family  38.05 
 
 		 269 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 176 aa  90.9  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  30.43 
 
 		 188 aa  91.3  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2919  transcriptional regulator, XRE family  29.57 
 
 		 170 aa  90.1  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1306  transcriptional regulator, XRE family  29.57 
 
 		 170 aa  90.1  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000237827 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0274  transcriptional regulator, XRE family  36.27 
 
 		 205 aa  89.7  3e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.64998  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2578  transcriptional regulator, XRE family  36.98 
 
 		 182 aa  89.4  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5178  XRE family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 199 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4678  MerR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 276 aa  89.4  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.825044  normal  0.111013 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69980  putative transcriptional regulator  29.74 
 
 		 182 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4841  cupin 2 domain-containing protein  32.39 
 
 		 202 aa  89  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4357  transcriptional regulator, MerR family  37.07 
 
 		 269 aa  89  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00580847 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5268  Cro/CI family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 182 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0965  transcriptional regulator, XRE family  31.63 
 
 		 191 aa  88.6  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5320  XRE family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 182 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.8166  normal  0.310919 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  32.12 
 
 		 180 aa  87.8  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1046  XRE family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 186 aa  87.8  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0847  XRE family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 191 aa  87.8  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0641  aldehyde dehydrogenase-like protein  30.05 
 
 		 183 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0544  XRE family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 203 aa  87.4  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2025  aldehyde dehydrogenase-like protein  30.05 
 
 		 189 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1943  Cro/CI family transcriptional regulator putative  30.57 
 
 		 189 aa  87.4  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.693839  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0733  aldehyde dehydrogenase-like protein  30.05 
 
 		 183 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126553  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1027  XRE family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6075  putative transcriptional regulator  29.23 
 
 		 182 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1104  cupin 2 domain-containing protein  29.74 
 
 		 182 aa  86.3  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.183758  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 199 aa  86.7  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1163  cupin 2 domain-containing protein  29.74 
 
 		 182 aa  86.3  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.967119  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3195  transcriptional regulator, XRE family  29.74 
 
 		 182 aa  86.3  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0639399 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1195  XRE family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 182 aa  86.3  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1058  XRE family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 184 aa  85.9  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1443  XRE family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 182 aa  85.5  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3100  XRE family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 208 aa  85.5  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.510523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2921  XRE family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 208 aa  85.5  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.899455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3003  XRE family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 208 aa  85.5  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  29.35 
 
 		 201 aa  85.5  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.86 
 
 		 189 aa  85.1  8e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1265  transcriptional regulator, putative  30.26 
 
 		 182 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0202  XRE family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 182 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.614203  hitchhiker  0.00167713 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 182 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1035  transcriptional regulator, XRE family  31.91 
 
 		 179 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000017846  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0898  XRE family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 179 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2646  XRE family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 182 aa  84  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0230  transcriptional regulator  32.29 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3456  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3393  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000124891  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 292 aa  83.6  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>