More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0772 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0772  transcriptional regulator  100 
 
 		 204 aa  408  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.855503 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0230  transcriptional regulator  35.33 
 
 		 197 aa  109  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3586  XRE family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65950  putative transcriptional regulator  33.7 
 
 		 199 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0641  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199173  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2294  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5722  putative transcriptional regulator  33.7 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3329  transcriptional regulator  32.95 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.855836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3867  XRE family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 201 aa  101  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 176 aa  100  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  33.15 
 
 		 188 aa  99.8  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2868  Cro/CI family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 199 aa  99  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4679  putative transcriptional regulator  31.64 
 
 		 180 aa  99  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2821  XRE family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 199 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 182 aa  97.8  9e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2913  XRE family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 199 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1128  XRE family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 182 aa  96.7  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1104  cupin 2 domain-containing protein  35.2 
 
 		 182 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.183758  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2646  XRE family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 182 aa  96.3  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1163  cupin 2 domain-containing protein  35.2 
 
 		 182 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.967119  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1195  XRE family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 182 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3195  transcriptional regulator, XRE family  35.2 
 
 		 182 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0639399 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  30.73 
 
 		 192 aa  94  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1091  XRE family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 182 aa  94  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.158888  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1058  XRE family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 184 aa  94.4  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0099  transcriptional regulator, XRE family  33.51 
 
 		 194 aa  92.8  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1265  transcriptional regulator, putative  34.64 
 
 		 182 aa  92.8  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2921  XRE family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 208 aa  92.4  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.899455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3003  XRE family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 208 aa  92.4  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3100  XRE family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 208 aa  92.4  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.510523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6084  XRE family transcriptional regulator  37 
 
 		 234 aa  92  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.207069 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  31.72 
 
 		 181 aa  91.7  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  31.72 
 
 		 181 aa  91.7  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0238  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.9 
 
 		 199 aa  91.3  9e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  31.72 
 
 		 181 aa  91.3  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 181 aa  90.5  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 181 aa  91.3  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5268  Cro/CI family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 182 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0105  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 199 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  31.18 
 
 		 181 aa  90.1  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5523  transcriptional regulator  33.9 
 
 		 182 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5178  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  31.18 
 
 		 181 aa  90.1  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4841  cupin 2 domain-containing protein  30.73 
 
 		 202 aa  89.7  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47950  Cupin, RmlC-type protein  34.08 
 
 		 182 aa  90.5  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5320  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 182 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.8166  normal  0.310919 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  31.18 
 
 		 181 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2387  XRE family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 181 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  31.18 
 
 		 181 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2948  transcriptional regulator, XRE family  31.67 
 
 		 225 aa  88.6  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211039  hitchhiker  0.000112709 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  28.98 
 
 		 175 aa  88.6  6e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0202  XRE family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 182 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.614203  hitchhiker  0.00167713 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 181 aa  87.8  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0127  transcriptional regulator, XRE family  34.62 
 
 		 193 aa  87  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116873  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0248  XRE family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 182 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2884  XRE family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 181 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0819457  normal  0.480487 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2898  XRE family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 181 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4917  XRE family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 184 aa  86.7  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2806  XRE family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 181 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69980  putative transcriptional regulator  34.25 
 
 		 182 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2714  XRE family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 204 aa  86.3  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0361  XRE family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 205 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2046  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 205 aa  85.5  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1434  transcriptional regulator, XRE family  32.82 
 
 		 232 aa  85.9  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.887851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6075  putative transcriptional regulator  34.25 
 
 		 182 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 182 aa  84.7  8e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 178 aa  84  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1428  DNA-binding protein  32.78 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16550  predicted transcriptional regulator  37.79 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1443  XRE family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 182 aa  83.2  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2085  XRE family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4443  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2901  DNA-binding protein  32.96 
 
 		 182 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4415  XRE family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4258  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4094  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4442  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4105  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4493  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1457  transcriptional regulator  28.8 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.96188e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4590  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2705  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.33 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.847169  normal  0.058179 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  28.73 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0188  XRE family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.054457 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4180  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 292 aa  81.6  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2222  DNA-binding protein  30.11 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2042  transcriptional regulator  32.28 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2578  transcriptional regulator, XRE family  36.11 
 
 		 182 aa  81.3  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1729  transcriptional regulator, XRE family  31.18 
 
 		 195 aa  81.3  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114176  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1046  XRE family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0544  XRE family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 191 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0715  transcriptional regulator, XRE family  31.02 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.39864  normal  0.0327391 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1035  transcriptional regulator, XRE family  29.03 
 
 		 179 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000017846  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1441  XRE family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0636175 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0755  DNA-binding protein  32.2 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0277  XRE family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.128046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1721  XRE family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4481  DNA-binding protein  32.2 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>