More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2085 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2085  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 207 aa  422  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1033  transcriptional regulator, XRE family  80.81 
 
 		 195 aa  322  3e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3132  putative transcription regulator protein  60.94 
 
 		 209 aa  229  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.25062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0099  transcriptional regulator, XRE family  58.97 
 
 		 194 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1123  XRE family transcriptional regulator  55.12 
 
 		 221 aa  222  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0106313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1029  XRE family transcriptional regulator  57.44 
 
 		 219 aa  222  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.289543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4259  XRE family transcriptional regulator  58.16 
 
 		 206 aa  221  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.655976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1025  XRE family transcriptional regulator  57.29 
 
 		 219 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.976587  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4180  XRE family transcriptional regulator  60.32 
 
 		 199 aa  219  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2158  XRE family transcriptional regulator  54.95 
 
 		 224 aa  216  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00315318  normal  0.41098 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0668  XRE family transcriptional regulator  55.33 
 
 		 206 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1147  XRE family transcriptional regulator  55.33 
 
 		 206 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3174  DNA-binding protein  57.3 
 
 		 195 aa  204  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9176  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1881  DNA-binding protein  56.74 
 
 		 195 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2019  DNA-binding protein  56.74 
 
 		 195 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.649802  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3191  DNA-binding protein  56.74 
 
 		 195 aa  202  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.479355  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1428  DNA-binding protein  56.67 
 
 		 192 aa  202  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3137  DNA-binding protein  56.42 
 
 		 195 aa  202  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0895  DNA-binding protein  56.74 
 
 		 195 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.955987  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2728  DNA-binding protein  56.18 
 
 		 195 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0127  transcriptional regulator, XRE family  52.11 
 
 		 193 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116873  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3471  XRE family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 197 aa  176  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4768  XRE family transcriptional regulator  54.22 
 
 		 193 aa  167  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.2486  normal  0.289686 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0115  transcriptional regulatory protein  45.83 
 
 		 194 aa  159  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4257  transcriptional regulator, XRE family  44.15 
 
 		 189 aa  157  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4522  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 188 aa  154  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0681879  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2039  transcriptional regulator, XRE family  45.11 
 
 		 187 aa  144  7.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2210  transcriptional regulator, XRE family  41.03 
 
 		 195 aa  143  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949814  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0503  transcriptional regulator, XRE family  44.15 
 
 		 194 aa  135  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0483553 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6405  XRE family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 189 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146143  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5130  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  41.48 
 
 		 188 aa  132  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.87177  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40150  putative transcriptional regulator  40.66 
 
 		 183 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3403  putative transcriptional regulator  40.88 
 
 		 183 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5030  transcriptional regulator, XRE family  37.63 
 
 		 189 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.938239  normal  0.565327 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2103  XRE family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 191 aa  117  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4478  transcriptional regulator  37.23 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1655  helix-turn-helix domain protein  34.76 
 
 		 194 aa  111  9e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000652652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5267  transcriptional regulator, XRE family  36.26 
 
 		 190 aa  111  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.782951 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5472  putative transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0377247 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1354  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 190 aa  106  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0758784  decreased coverage  0.00460659 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3726  transcriptional regulator, XRE family  35.36 
 
 		 195 aa  106  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3563  transcriptional regulator, XRE family  33.51 
 
 		 189 aa  101  9e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1454  XRE family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 189 aa  99  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2239  transcriptional regulator  34.62 
 
 		 185 aa  96.3  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0224117  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2463  DNA-binding protein  34.62 
 
 		 185 aa  95.5  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2279  DNA-binding protein  34.62 
 
 		 185 aa  95.5  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.268468  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2197  transcriptional regulator  35.16 
 
 		 185 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2448  DNA-binding protein  34.62 
 
 		 185 aa  95.5  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.191992  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2481  DNA-binding protein  34.07 
 
 		 185 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193646  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4589  transcriptional regulator, XRE family  32.79 
 
 		 188 aa  92.4  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1265  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 203 aa  92  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.509144  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2254  XRE family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 185 aa  92  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575156  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2542  DNA-binding protein  34.07 
 
 		 185 aa  91.7  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2346  transcriptional regulator  33.7 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2231  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 187 aa  87.4  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000245077 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2928  DNA-binding protein  29.55 
 
 		 185 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384603 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4268  transcriptional regulator, XRE family  31.69 
 
 		 188 aa  86.3  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0945  transcriptional regulator, XRE family  28.89 
 
 		 184 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000133489  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5929  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.828276  normal  0.0967353 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0772  transcriptional regulator  30.32 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.855503 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0424  XRE family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34730  XRE family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0210921  normal  0.262574 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0327  XRE family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000523898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0328  transcriptional regulator, XRE family  29.12 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000353964  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3086  transcriptional regulator, putative  31.69 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0196484  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0324  XRE family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 191 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000421536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0319  XRE family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 191 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000379854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0321  XRE family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 191 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250107  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0323  XRE family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000737434  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5322  XRE family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0981  DNA-binding protein  30.68 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3700  XRE family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000696836  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4158  XRE family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7005  transcriptional regulator, XRE family  32.97 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.89282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5143  putative transcriptional regulator, XRE family  33.15 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0117731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1088  transcriptional regulator  30.11 
 
 		 183 aa  77.8  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3022  XRE family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4537  XRE family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2614  transcriptional regulator  32.43 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5159  XRE family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5700  XRE family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441066 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3180  XRE family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4971  XRE family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110875  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3114  XRE family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935644  normal  0.475898 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2484  XRE family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0499056 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1555  transcriptional regulator  29.05 
 
 		 181 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03443  transcriptional regulator, HTH_3 family protein  30.65 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0004  DNA-binding protein  29.28 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0004  DNA-binding cupin domain-containing protein  28.73 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0004  DNA-binding protein  28.73 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.278794  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0004  DNA-binding protein  28.73 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1509  putative DNA-binding protein  28.73 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6084  XRE family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.207069 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0005  DNA-binding protein  28.73 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792058  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1150  DNA-binding protein  28.73 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129822  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1430  DNA-binding protein  28.73 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2877  transcriptional regulator, XRE family  29 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1982  XRE family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 175 aa  70.5  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.623481  normal  0.364753 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1722  transcriptional regulator, XRE family  29.69 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.185673  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0134  hypothetical protein  27.92 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>