More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1454 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1454  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 189 aa  384  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3563  transcriptional regulator, XRE family  56.61 
 
 		 189 aa  208  4e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5472  putative transcriptional regulator, XRE family  53.23 
 
 		 198 aa  206  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0377247 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3726  transcriptional regulator, XRE family  55.68 
 
 		 195 aa  201  7e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5267  transcriptional regulator, XRE family  52.43 
 
 		 190 aa  184  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.782951 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1354  XRE family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 190 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0758784  decreased coverage  0.00460659 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4522  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 188 aa  140  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0681879  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3471  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4257  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 189 aa  135  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0127  transcriptional regulator, XRE family  38.62 
 
 		 193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116873  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0115  transcriptional regulatory protein  37.5 
 
 		 194 aa  125  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3132  putative transcription regulator protein  35.64 
 
 		 209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.25062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1029  XRE family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 219 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.289543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1025  XRE family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 219 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.976587  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6405  XRE family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146143  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4259  XRE family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 206 aa  111  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.655976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1123  XRE family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 221 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0106313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0668  XRE family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 206 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1147  XRE family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 206 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2158  XRE family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 224 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00315318  normal  0.41098 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2210  transcriptional regulator, XRE family  38.55 
 
 		 195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949814  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5130  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  36.09 
 
 		 188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.87177  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2039  transcriptional regulator, XRE family  36.72 
 
 		 187 aa  108  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0099  transcriptional regulator, XRE family  34.25 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3403  putative transcriptional regulator  36.57 
 
 		 183 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4180  XRE family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 199 aa  105  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0503  transcriptional regulator, XRE family  37.02 
 
 		 194 aa  105  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0483553 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1428  DNA-binding protein  35.23 
 
 		 192 aa  104  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4768  XRE family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 193 aa  102  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.2486  normal  0.289686 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4478  transcriptional regulator  33.16 
 
 		 188 aa  101  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40150  putative transcriptional regulator  34.29 
 
 		 183 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2019  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 195 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.649802  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3191  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 195 aa  99  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.479355  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0895  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 195 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.955987  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2085  XRE family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 207 aa  99  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1881  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 195 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1033  transcriptional regulator, XRE family  32.98 
 
 		 195 aa  99  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3137  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 195 aa  98.2  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2728  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 195 aa  98.6  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3174  DNA-binding protein  32.76 
 
 		 195 aa  97.8  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9176  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2103  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  96.3  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5030  transcriptional regulator, XRE family  34.04 
 
 		 189 aa  95.1  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.938239  normal  0.565327 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1655  helix-turn-helix domain protein  33.53 
 
 		 194 aa  94  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000652652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5929  XRE family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 202 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.828276  normal  0.0967353 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4589  transcriptional regulator, XRE family  27.61 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4268  transcriptional regulator, XRE family  27.93 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1265  XRE family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.509144  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1088  transcriptional regulator  28.09 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1740  DNA-binding protein  27.53 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000189008  hitchhiker  2.35786e-17 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01392  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.53 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2212  transcriptional regulator, XRE family  27.53 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1613  DNA-binding protein  27.53 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2225  XRE family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.639128 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01402  hypothetical protein  27.53 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1517  DNA-binding protein  27.53 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  27.22 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0981  DNA-binding protein  27.53 
 
 		 183 aa  74.3  0.0000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0321  XRE family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250107  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2039  DNA-binding protein  27.53 
 
 		 178 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000824446  hitchhiker  5.01479e-19 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0327  XRE family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 191 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000523898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0477  XRE family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.566181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0328  transcriptional regulator, XRE family  27.75 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000353964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0323  XRE family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000737434  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0424  XRE family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5143  putative transcriptional regulator, XRE family  26.67 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0117731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1722  transcriptional regulator, XRE family  28.09 
 
 		 185 aa  71.2  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.185673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1642  XRE family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 186 aa  71.2  0.000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.065261  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0319  XRE family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 191 aa  71.2  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000379854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2231  XRE family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000245077 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0872  transcriptional regulator  29.87 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.62802  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1982  XRE family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.623481  normal  0.364753 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1783  XRE family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3700  XRE family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000696836  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1719  XRE family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.499876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1556  transcriptional regulator, XRE family  27.53 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0324  XRE family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000421536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4933  transcriptional regulator, XRE family  26.55 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0929  XRE family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145461  normal  0.153472 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4983  transcriptional regulator, XRE family  26.55 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0953387  normal  0.300371 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4469  helix-turn-helix domain-containing protein  26.55 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0831  XRE family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 183 aa  67.8  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000078794  normal  0.173113 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1737  XRE family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1457  transcriptional regulator  26.88 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.96188e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02293  putative transcription regulator protein  29.67 
 
 		 182 aa  67  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.40687 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0450  XRE family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0134  hypothetical protein  29.63 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1008  DNA-binding protein  27.01 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1001  DNA-binding protein  27.01 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4679  putative transcriptional regulator  27.39 
 
 		 180 aa  64.7  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2075  helix-turn-helix domain protein  25.77 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241547  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0980  XRE family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 181 aa  63.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000294477  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3551  transcriptional regulator, XRE family  28.33 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3025  XRE family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314698  normal  0.932142 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0744  XRE family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.541206  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4252  DNA-binding protein  27.98 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0950  transcriptional regulator, XRE family  28.4 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00163253 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4740  DNA-binding protein  27.98 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0921  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>