More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5929 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5929  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  400  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.828276  normal  0.0967353 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4829  cupin 2 domain-containing protein  68.56 
 
 		 182 aa  241  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0191257  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1265  XRE family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 203 aa  162  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.509144  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5143  putative transcriptional regulator, XRE family  37.87 
 
 		 192 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0117731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3471  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4257  transcriptional regulator, XRE family  36.78 
 
 		 189 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1088  transcriptional regulator  34.09 
 
 		 183 aa  108  6e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0981  DNA-binding protein  34.09 
 
 		 183 aa  107  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2039  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 187 aa  104  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4522  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0681879  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0115  transcriptional regulatory protein  35.68 
 
 		 194 aa  102  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1029  XRE family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 219 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.289543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1025  XRE family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 219 aa  101  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.976587  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3132  putative transcription regulator protein  36.6 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.25062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2158  XRE family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 224 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00315318  normal  0.41098 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0668  XRE family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 206 aa  97.8  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1147  XRE family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 206 aa  97.8  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5130  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  36.87 
 
 		 188 aa  97.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.87177  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4259  XRE family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 206 aa  97.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.655976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5472  putative transcriptional regulator, XRE family  36.57 
 
 		 198 aa  96.7  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0377247 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  31.84 
 
 		 188 aa  97.1  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1123  XRE family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 221 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0106313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 176 aa  96.7  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3563  transcriptional regulator, XRE family  31.46 
 
 		 189 aa  95.9  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2210  transcriptional regulator, XRE family  33.51 
 
 		 195 aa  95.9  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949814  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1428  DNA-binding protein  36.87 
 
 		 192 aa  95.9  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3726  transcriptional regulator, XRE family  35.56 
 
 		 195 aa  94.7  8e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3403  putative transcriptional regulator  36.57 
 
 		 183 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1454  XRE family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 189 aa  92.8  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2877  transcriptional regulator, XRE family  32.95 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40150  putative transcriptional regulator  35.91 
 
 		 183 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3137  DNA-binding protein  37.36 
 
 		 195 aa  92.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2019  DNA-binding protein  37.36 
 
 		 195 aa  92.4  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.649802  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3191  DNA-binding protein  37.36 
 
 		 195 aa  92.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.479355  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1721  XRE family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 201 aa  92.4  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0895  DNA-binding protein  37.36 
 
 		 195 aa  92.4  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.955987  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1881  DNA-binding protein  37.36 
 
 		 195 aa  92.4  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3174  DNA-binding protein  37.36 
 
 		 195 aa  92  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9176  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1033  transcriptional regulator, XRE family  37.91 
 
 		 195 aa  91.7  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2103  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 191 aa  91.7  8e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0099  transcriptional regulator, XRE family  35.83 
 
 		 194 aa  90.1  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0127  transcriptional regulator, XRE family  36.75 
 
 		 193 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116873  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6405  XRE family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 189 aa  89.7  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146143  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2728  DNA-binding protein  36.67 
 
 		 195 aa  89.4  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1150  DNA-binding protein  31.12 
 
 		 202 aa  88.6  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129822  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0004  DNA-binding protein  31.12 
 
 		 202 aa  88.6  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1430  DNA-binding protein  31.12 
 
 		 202 aa  88.6  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1509  putative DNA-binding protein  31.12 
 
 		 202 aa  88.6  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0004  DNA-binding cupin domain-containing protein  31.12 
 
 		 202 aa  88.6  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0004  DNA-binding protein  31.12 
 
 		 202 aa  88.6  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.278794  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0005  DNA-binding protein  31.12 
 
 		 202 aa  88.6  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792058  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3022  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 208 aa  88.2  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2924  XRE family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 204 aa  87.8  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.705469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3114  XRE family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 203 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935644  normal  0.475898 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4180  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 199 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2085  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 207 aa  87.4  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7005  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.89282 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5322  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 203 aa  86.3  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2614  transcriptional regulator  33.14 
 
 		 248 aa  85.9  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4806  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.67 
 
 		 203 aa  85.5  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4971  XRE family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 203 aa  85.5  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110875  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4158  XRE family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 204 aa  85.1  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1719  XRE family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 178 aa  85.1  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.499876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4537  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 203 aa  84.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4478  transcriptional regulator  34.29 
 
 		 188 aa  84.7  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0662  XRE family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 259 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 182 aa  84  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  32.34 
 
 		 181 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1109  XRE family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 183 aa  84.3  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4838  transcriptional regulator, XRE family  31.15 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0168811  hitchhiker  0.0000750229 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  31.14 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3180  XRE family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 178 aa  83.2  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1783  XRE family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 178 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1354  XRE family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0758784  decreased coverage  0.00460659 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5159  XRE family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5700  XRE family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441066 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4875  HTH-type transcriptional regulator  32.52 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.256136  normal  0.0946557 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  31.74 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1737  XRE family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  31.74 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0503  transcriptional regulator, XRE family  33.15 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0483553 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  31.14 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4917  XRE family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  31.74 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4365  XRE family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000321232  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  31.74 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5267  transcriptional regulator, XRE family  30.34 
 
 		 190 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.782951 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1556  transcriptional regulator, XRE family  28.98 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4768  XRE family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.2486  normal  0.289686 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2346  transcriptional regulator  30.22 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1642  XRE family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.065261  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0929  XRE family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145461  normal  0.153472 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0004  DNA-binding protein  29.78 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1722  transcriptional regulator, XRE family  28.89 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.185673  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>