More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0503 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0503  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 194 aa  380  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0483553 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2039  transcriptional regulator, XRE family  55.61 
 
 		 187 aa  193  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6405  XRE family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 189 aa  167  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146143  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5130  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  46.7 
 
 		 188 aa  166  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.87177  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4478  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 188 aa  147  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5030  transcriptional regulator, XRE family  46.59 
 
 		 189 aa  144  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.938239  normal  0.565327 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3137  DNA-binding protein  43.93 
 
 		 195 aa  143  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2019  DNA-binding protein  43.93 
 
 		 195 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.649802  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3191  DNA-binding protein  43.93 
 
 		 195 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.479355  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0895  DNA-binding protein  43.93 
 
 		 195 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.955987  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2103  XRE family transcriptional regulator  41.34 
 
 		 191 aa  144  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1881  DNA-binding protein  43.93 
 
 		 195 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3174  DNA-binding protein  43.35 
 
 		 195 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9176  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1428  DNA-binding protein  42.94 
 
 		 192 aa  141  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2728  DNA-binding protein  43.35 
 
 		 195 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0099  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 194 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2085  XRE family transcriptional regulator  44.15 
 
 		 207 aa  135  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0127  transcriptional regulator, XRE family  43.96 
 
 		 193 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116873  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4259  XRE family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.655976  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3132  putative transcription regulator protein  39.15 
 
 		 209 aa  129  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.25062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4180  XRE family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 199 aa  129  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1025  XRE family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 219 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.976587  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1033  transcriptional regulator, XRE family  42.55 
 
 		 195 aa  127  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4257  transcriptional regulator, XRE family  39.77 
 
 		 189 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3726  transcriptional regulator, XRE family  44.13 
 
 		 195 aa  125  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0115  transcriptional regulatory protein  41.18 
 
 		 194 aa  125  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1029  XRE family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 219 aa  124  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.289543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1123  XRE family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 221 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0106313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0668  XRE family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 206 aa  124  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1147  XRE family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 206 aa  124  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4522  transcriptional regulator, XRE family  38.64 
 
 		 188 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0681879  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2158  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 224 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00315318  normal  0.41098 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3471  XRE family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 197 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5472  putative transcriptional regulator, XRE family  39.11 
 
 		 198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0377247 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2210  transcriptional regulator, XRE family  38.38 
 
 		 195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949814  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4768  XRE family transcriptional regulator  45.51 
 
 		 193 aa  112  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.2486  normal  0.289686 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1655  helix-turn-helix domain protein  37.31 
 
 		 194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000652652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1354  XRE family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0758784  decreased coverage  0.00460659 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3403  putative transcriptional regulator  37.85 
 
 		 183 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5267  transcriptional regulator, XRE family  37.17 
 
 		 190 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.782951 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3563  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 189 aa  108  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40150  putative transcriptional regulator  37.29 
 
 		 183 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1454  XRE family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 189 aa  105  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0981  DNA-binding protein  28.33 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5929  XRE family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 202 aa  77.8  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.828276  normal  0.0967353 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1088  transcriptional regulator  27.78 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5322  XRE family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 203 aa  72  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1265  XRE family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.509144  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5143  putative transcriptional regulator, XRE family  34.73 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0117731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4589  transcriptional regulator, XRE family  28.81 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3114  XRE family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935644  normal  0.475898 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3180  XRE family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2578  transcriptional regulator, XRE family  36.41 
 
 		 182 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5159  XRE family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4971  XRE family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110875  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5700  XRE family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441066 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4537  XRE family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1702  transcriptional regulator, XRE family  29.09 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1150  DNA-binding protein  30.22 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129822  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0004  DNA-binding protein  30.22 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1430  DNA-binding protein  30.22 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0005  DNA-binding protein  30.22 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792058  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0772  transcriptional regulator  31.28 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.855503 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1509  putative DNA-binding protein  30.22 
 
 		 202 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0004  DNA-binding protein  30.22 
 
 		 202 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.278794  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0004  DNA-binding cupin domain-containing protein  30.22 
 
 		 202 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5912  XRE family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1729  transcriptional regulator, XRE family  34.24 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114176  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0332  transcriptional regulator, XRE family  33.16 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.865127  normal  0.108372 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0004  DNA-binding protein  29.67 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3025  XRE family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314698  normal  0.932142 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  25 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 176 aa  62  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2913  XRE family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2614  transcriptional regulator  31.46 
 
 		 248 aa  61.6  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2868  Cro/CI family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 199 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2821  XRE family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1046  XRE family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0831  XRE family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000078794  normal  0.173113 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3308  transcriptional regulator  28.98 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.38656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65950  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2948  transcriptional regulator, XRE family  31.18 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211039  hitchhiker  0.000112709 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0437  transcriptional regulator  28.75 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5722  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2038  transcriptional regulator  28.12 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.547476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4806  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.51 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2770  XRE family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169539 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16550  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1434  transcriptional regulator, XRE family  32.65 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.887851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0230  transcriptional regulator  31.21 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3867  XRE family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0248  XRE family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4986  XRE family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5265  XRE family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4897  XRE family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0847  XRE family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0715  transcriptional regulator, XRE family  28.89 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.39864  normal  0.0327391 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0274  transcriptional regulator, XRE family  27.93 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.64998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>