More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2103 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_2103  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  391  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6405  XRE family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 189 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146143  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5130  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  55.19 
 
 		 188 aa  207  6e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.87177  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4478  transcriptional regulator  51.91 
 
 		 188 aa  204  8e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5030  transcriptional regulator, XRE family  50.85 
 
 		 189 aa  178  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.938239  normal  0.565327 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2039  transcriptional regulator, XRE family  48.62 
 
 		 187 aa  174  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0503  transcriptional regulator, XRE family  41.34 
 
 		 194 aa  144  9e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0483553 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0115  transcriptional regulatory protein  43.98 
 
 		 194 aa  138  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4257  transcriptional regulator, XRE family  43.16 
 
 		 189 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2210  transcriptional regulator, XRE family  39.78 
 
 		 195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949814  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4522  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0681879  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0127  transcriptional regulator, XRE family  40.22 
 
 		 193 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116873  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3403  putative transcriptional regulator  39.01 
 
 		 183 aa  121  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1428  DNA-binding protein  39.33 
 
 		 192 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1655  helix-turn-helix domain protein  40.8 
 
 		 194 aa  119  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000652652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3174  DNA-binding protein  39.33 
 
 		 195 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9176  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1033  transcriptional regulator, XRE family  37.63 
 
 		 195 aa  119  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2019  DNA-binding protein  39.33 
 
 		 195 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.649802  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3191  DNA-binding protein  39.33 
 
 		 195 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.479355  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0895  DNA-binding protein  39.33 
 
 		 195 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.955987  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1881  DNA-binding protein  39.33 
 
 		 195 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40150  putative transcriptional regulator  39.01 
 
 		 183 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1123  XRE family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0106313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2085  XRE family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3137  DNA-binding protein  38.76 
 
 		 195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3471  XRE family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0668  XRE family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 206 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1147  XRE family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 206 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2728  DNA-binding protein  38.76 
 
 		 195 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3132  putative transcription regulator protein  38.33 
 
 		 209 aa  114  8.999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.25062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1025  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 219 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.976587  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1029  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 219 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.289543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4259  XRE family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.655976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0099  transcriptional regulator, XRE family  37.02 
 
 		 194 aa  111  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4180  XRE family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 199 aa  108  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2158  XRE family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 224 aa  108  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00315318  normal  0.41098 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5472  putative transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 198 aa  105  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0377247 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3726  transcriptional regulator, XRE family  37.18 
 
 		 195 aa  105  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4768  XRE family transcriptional regulator  39.88 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.2486  normal  0.289686 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1454  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 189 aa  96.3  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1354  XRE family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 190 aa  94  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0758784  decreased coverage  0.00460659 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5267  transcriptional regulator, XRE family  34.05 
 
 		 190 aa  92.4  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.782951 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3563  transcriptional regulator, XRE family  32.58 
 
 		 189 aa  92  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5929  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 202 aa  87  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.828276  normal  0.0967353 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1265  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 203 aa  77.8  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.509144  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4589  transcriptional regulator, XRE family  28.07 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4268  transcriptional regulator, XRE family  28.74 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0379  transcriptional regulator  25.75 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.808324 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1737  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1783  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1719  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.499876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1722  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.185673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2231  XRE family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000245077 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1556  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1982  XRE family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.623481  normal  0.364753 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0981  DNA-binding protein  27.43 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2858  transcriptional regulator, XRE family  27.37 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000622832  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0321  XRE family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250107  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1088  transcriptional regulator  27.91 
 
 		 183 aa  64.3  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0319  XRE family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000379854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0328  transcriptional regulator, XRE family  38.16 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000353964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5143  putative transcriptional regulator, XRE family  25.29 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0117731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0424  XRE family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0327  XRE family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000523898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3700  XRE family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000696836  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1064  transciptional regulator  27.16 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0323  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000737434  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0772  transcriptional regulator  27.61 
 
 		 204 aa  62  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.855503 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0324  XRE family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000421536  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2075  helix-turn-helix domain protein  24.38 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241547  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4829  cupin 2 domain-containing protein  33.57 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0191257  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2039  DNA-binding protein  36.26 
 
 		 178 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000824446  hitchhiker  5.01479e-19 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01392  predicted DNA-binding transcriptional regulator  36.26 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2212  transcriptional regulator, XRE family  36.26 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2225  XRE family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.639128 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01402  hypothetical protein  36.26 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1517  DNA-binding protein  36.26 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1740  DNA-binding protein  36.26 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000189008  hitchhiker  2.35786e-17 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1613  DNA-binding protein  36.26 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1642  XRE family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.065261  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0134  hypothetical protein  34.41 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3519  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0116433 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3096  transcriptional regulator, XRE family  23.16 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00124629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5637  transcriptional regulator, XRE family  25.77 
 
 		 227 aa  57.8  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.76756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 198 aa  57.8  0.00000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2614  transcriptional regulator  26.09 
 
 		 248 aa  57  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  26.62 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04780  putative transcription regulator protein  30.34 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05657  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  30.34 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4838  transcriptional regulator, XRE family  24.24 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0168811  hitchhiker  0.0000750229 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  22.44 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2239  transcriptional regulator  23.33 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0224117  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6574  transcriptional regulator, XRE family  25.15 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0448941 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2770  XRE family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169539 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4931  transcriptional regulator, XRE family  24.31 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0929  XRE family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145461  normal  0.153472 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2481  DNA-binding protein  23.33 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193646  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  25.99 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2448  DNA-binding protein  23.33 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.191992  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>