More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_3174 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3174  DNA-binding protein  100 
 
 		 195 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9176  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0895  DNA-binding protein  98.46 
 
 		 195 aa  383  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.955987  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2019  DNA-binding protein  98.46 
 
 		 195 aa  383  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.649802  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3191  DNA-binding protein  98.46 
 
 		 195 aa  383  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.479355  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1881  DNA-binding protein  98.46 
 
 		 195 aa  383  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3137  DNA-binding protein  97.95 
 
 		 195 aa  363  1e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2728  DNA-binding protein  97.95 
 
 		 195 aa  362  1e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1428  DNA-binding protein  87.5 
 
 		 192 aa  335  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0099  transcriptional regulator, XRE family  67.2 
 
 		 194 aa  257  7e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4180  XRE family transcriptional regulator  66.13 
 
 		 199 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0668  XRE family transcriptional regulator  62.57 
 
 		 206 aa  225  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1147  XRE family transcriptional regulator  62.57 
 
 		 206 aa  225  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1029  XRE family transcriptional regulator  63.39 
 
 		 219 aa  224  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.289543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1123  XRE family transcriptional regulator  61.5 
 
 		 221 aa  224  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0106313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4259  XRE family transcriptional regulator  61.5 
 
 		 206 aa  224  8e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.655976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1025  XRE family transcriptional regulator  62.3 
 
 		 219 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.976587  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3132  putative transcription regulator protein  58.33 
 
 		 209 aa  210  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.25062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2158  XRE family transcriptional regulator  61.2 
 
 		 224 aa  210  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00315318  normal  0.41098 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2085  XRE family transcriptional regulator  55.98 
 
 		 207 aa  206  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1033  transcriptional regulator, XRE family  55.14 
 
 		 195 aa  199  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0127  transcriptional regulator, XRE family  53.26 
 
 		 193 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116873  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4768  XRE family transcriptional regulator  56.9 
 
 		 193 aa  169  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.2486  normal  0.289686 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4257  transcriptional regulator, XRE family  43.96 
 
 		 189 aa  154  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4522  transcriptional regulator, XRE family  43.72 
 
 		 188 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0681879  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5130  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  46.89 
 
 		 188 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.87177  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3471  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 197 aa  149  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0503  transcriptional regulator, XRE family  43.26 
 
 		 194 aa  145  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0483553 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0115  transcriptional regulatory protein  43.41 
 
 		 194 aa  141  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2039  transcriptional regulator, XRE family  43.96 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6405  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 189 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146143  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5030  transcriptional regulator, XRE family  41.08 
 
 		 189 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.938239  normal  0.565327 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40150  putative transcriptional regulator  44.09 
 
 		 183 aa  128  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2210  transcriptional regulator, XRE family  42.25 
 
 		 195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949814  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3403  putative transcriptional regulator  42.47 
 
 		 183 aa  124  9e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2103  XRE family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 191 aa  121  6e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1655  helix-turn-helix domain protein  36.26 
 
 		 194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000652652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4478  transcriptional regulator  37.16 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5472  putative transcriptional regulator, XRE family  37.43 
 
 		 198 aa  107  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0377247 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3726  transcriptional regulator, XRE family  34.05 
 
 		 195 aa  104  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5267  transcriptional regulator, XRE family  38.25 
 
 		 190 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.782951 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3563  transcriptional regulator, XRE family  32.62 
 
 		 189 aa  102  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1354  XRE family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 190 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0758784  decreased coverage  0.00460659 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1454  XRE family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 189 aa  98.6  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5929  XRE family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 202 aa  89  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.828276  normal  0.0967353 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2770  XRE family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 192 aa  84.7  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169539 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4806  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.39 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3771  transcriptional regulator, XRE family  33.88 
 
 		 198 aa  77.8  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.471902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4848  transcriptional regulator, XRE family  33.88 
 
 		 198 aa  77.8  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0772  transcriptional regulator  31.87 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.855503 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5143  putative transcriptional regulator, XRE family  34.27 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0117731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5322  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0981  DNA-binding protein  28.81 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  26.32 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3114  XRE family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935644  normal  0.475898 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1088  transcriptional regulator  28.25 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0744  XRE family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.541206  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1211  helix-turn-helix domain-containing protein  23.81 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4971  XRE family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110875  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4158  XRE family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7005  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.89282 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5159  XRE family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5700  XRE family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441066 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3180  XRE family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 203 aa  72  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4773  transcriptional regulator, XRE family  30.56 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0282623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3022  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2239  transcriptional regulator  24.29 
 
 		 185 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0224117  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2279  DNA-binding protein  24.29 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.268468  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2448  DNA-binding protein  24.29 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.191992  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4537  XRE family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2463  DNA-binding protein  24.29 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2254  XRE family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575156  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2197  transcriptional regulator  24.29 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26325  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0850  XRE family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.406298  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02293  putative transcription regulator protein  31.76 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.40687 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1064  transciptional regulator  28.05 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1579  transcriptional regulator  23.76 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2481  DNA-binding protein  24.29 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193646  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1096  helix-turn-helix domain-containing protein  24.86 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4967  transcriptional regulator, XRE family  28.42 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454469  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2075  helix-turn-helix domain protein  29.67 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241547  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1265  XRE family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.509144  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2346  transcriptional regulator  29.83 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2542  DNA-binding protein  24.29 
 
 		 185 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2868  Cro/CI family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4804  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  32.5 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5722  putative transcriptional regulator  27.12 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0079  Cro/CI family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  30.17 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3438  XRE family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 198 aa  67  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2913  XRE family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4938  XRE family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.839761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0379  transcriptional regulator  27.59 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.808324 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2821  XRE family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2578  transcriptional regulator, XRE family  30.32 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  25.57 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65950  putative transcriptional regulator  26.59 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0238  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.88 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5123  hypothetical protein  25.99 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.635702  normal  0.639471 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0950  transcriptional regulator, XRE family  29.32 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00163253 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>