More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B3180 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B3180  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
203 aa  407  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3114  XRE family transcriptional regulator  95.07 
 
 
203 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935644  normal  0.475898 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4971  XRE family transcriptional regulator  94.58 
 
 
203 aa  388  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110875  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5700  XRE family transcriptional regulator  97.04 
 
 
203 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441066 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4537  XRE family transcriptional regulator  96.55 
 
 
203 aa  367  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5159  XRE family transcriptional regulator  97.04 
 
 
203 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5322  XRE family transcriptional regulator  94.09 
 
 
203 aa  359  2e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869737  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0004  DNA-binding protein  86.21 
 
 
202 aa  351  4e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.278794  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1509  putative DNA-binding protein  86.21 
 
 
202 aa  351  4e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0004  DNA-binding cupin domain-containing protein  86.21 
 
 
202 aa  351  4e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0004  DNA-binding protein  85.71 
 
 
202 aa  348  4e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1150  DNA-binding protein  85.71 
 
 
202 aa  348  4e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129822  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1430  DNA-binding protein  85.71 
 
 
202 aa  348  4e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0005  DNA-binding protein  85.71 
 
 
202 aa  348  4e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792058  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0004  DNA-binding protein  85.22 
 
 
202 aa  341  4e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7005  transcriptional regulator, XRE family  75.24 
 
 
212 aa  316  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.89282 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3022  XRE family transcriptional regulator  74.76 
 
 
208 aa  308  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4158  XRE family transcriptional regulator  74.63 
 
 
204 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4806  putative DNA-binding transcriptional regulator  55.74 
 
 
203 aa  205  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4804  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  55.03 
 
 
198 aa  201  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02293  putative transcription regulator protein  53.89 
 
 
182 aa  190  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.40687 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4848  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 
198 aa  189  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3771  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 
198 aa  189  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.471902  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4365  XRE family transcriptional regulator  49.72 
 
 
197 aa  182  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000321232  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4967  transcriptional regulator, XRE family  38.55 
 
 
218 aa  142  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454469  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4933  transcriptional regulator, XRE family  37.99 
 
 
209 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4938  XRE family transcriptional regulator  37.99 
 
 
206 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.839761  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4469  helix-turn-helix domain-containing protein  37.43 
 
 
209 aa  138  6e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4983  transcriptional regulator, XRE family  37.99 
 
 
209 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0953387  normal  0.300371 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0950  transcriptional regulator, XRE family  36.46 
 
 
205 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00163253 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2075  helix-turn-helix domain protein  40.84 
 
 
196 aa  136  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241547  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0116  XRE family transcriptional regulator  36.41 
 
 
205 aa  134  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0574196 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4454  XRE family transcriptional regulator  36.87 
 
 
203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561636  normal  0.472987 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1957  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 
208 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.210401  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3086  transcriptional regulator, putative  35.2 
 
 
212 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0196484  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0929  XRE family transcriptional regulator  36.96 
 
 
224 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145461  normal  0.153472 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0872  transcriptional regulator  35.75 
 
 
192 aa  117  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.62802  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0921  transcriptional regulator, XRE family  34.9 
 
 
260 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34730  XRE family transcriptional regulator  34.95 
 
 
193 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0210921  normal  0.262574 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0917  transcriptional regulator, XRE family  35.2 
 
 
192 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2346  transcriptional regulator  36.52 
 
 
215 aa  116  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2924  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 
204 aa  113  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.705469  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2614  transcriptional regulator  35.2 
 
 
248 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2542  DNA-binding protein  31.64 
 
 
185 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3025  XRE family transcriptional regulator  40.12 
 
 
188 aa  111  9e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314698  normal  0.932142 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2254  XRE family transcriptional regulator  30.51 
 
 
185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575156  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2279  DNA-binding protein  30.51 
 
 
185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.268468  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2197  transcriptional regulator  30.51 
 
 
185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26325  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2463  DNA-binding protein  30.51 
 
 
185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2448  DNA-binding protein  30.51 
 
 
185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.191992  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2239  transcriptional regulator  30.51 
 
 
185 aa  109  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0224117  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2928  DNA-binding protein  29.94 
 
 
185 aa  109  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00384603 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0831  XRE family transcriptional regulator  33.71 
 
 
183 aa  105  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000078794  normal  0.173113 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2481  DNA-binding protein  28.25 
 
 
185 aa  104  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193646  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0662  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 
259 aa  103  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2877  transcriptional regulator, XRE family  32.2 
 
 
207 aa  98.2  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0416  XRE family transcriptional regulator  32.24 
 
 
229 aa  95.1  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.387969 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0327  XRE family transcriptional regulator  31.21 
 
 
191 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000523898  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0945  transcriptional regulator, XRE family  31.07 
 
 
184 aa  94  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000133489  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0321  XRE family transcriptional regulator  32.08 
 
 
191 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250107  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0328  transcriptional regulator, XRE family  31.21 
 
 
191 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000353964  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0634  XRE family transcriptional regulator  31.49 
 
 
229 aa  93.2  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0424  XRE family transcriptional regulator  31.21 
 
 
188 aa  93.6  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3325  transcriptional regulator, XRE family  31.49 
 
 
229 aa  92.8  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.610712  normal  0.167348 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0323  XRE family transcriptional regulator  31.45 
 
 
191 aa  92.4  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000737434  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4875  HTH-type transcriptional regulator  36.09 
 
 
214 aa  91.3  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.256136  normal  0.0946557 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03443  transcriptional regulator, HTH_3 family protein  29.89 
 
 
208 aa  90.5  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3140  transcriptional regulator, XRE family  31.47 
 
 
206 aa  90.5  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01840  transcriptional regulator, XRE family  26.55 
 
 
182 aa  90.1  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4522  transcriptional regulator, XRE family  31.64 
 
 
188 aa  89.4  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0681879  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6018  XRE family transcriptional regulator  31.32 
 
 
233 aa  89  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1579  transcriptional regulator  30.29 
 
 
182 aa  88.6  5e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2690  XRE family transcriptional regulator  31.32 
 
 
228 aa  88.6  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0981  DNA-binding protein  28.65 
 
 
183 aa  88.6  6e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2078  XRE family transcriptional regulator  31.32 
 
 
228 aa  88.6  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2718  XRE family transcriptional regulator  31.32 
 
 
228 aa  88.6  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5143  putative transcriptional regulator, XRE family  33.91 
 
 
192 aa  88.2  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0117731  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0850  XRE family transcriptional regulator  30.9 
 
 
182 aa  87.8  9e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.406298  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2607  XRE family transcriptional regulator  30.68 
 
 
227 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2441  DNA-binding protein  30.27 
 
 
222 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0229  DNA-binding protein  30.27 
 
 
222 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2361  DNA-binding protein  30.27 
 
 
222 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0893  DNA-binding protein  30.27 
 
 
222 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0714  DNA-binding protein  30.27 
 
 
222 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0594  DNA-binding protein  30.89 
 
 
219 aa  87.4  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2717  DNA-binding protein  30.27 
 
 
222 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0728  DNA-binding protein  30.27 
 
 
222 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2743  XRE family transcriptional regulator  30.68 
 
 
227 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1109  XRE family transcriptional regulator  29.83 
 
 
183 aa  86.3  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0608  XRE family transcriptional regulator  29.83 
 
 
227 aa  86.3  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1088  transcriptional regulator  28.09 
 
 
183 aa  85.9  4e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4268  transcriptional regulator, XRE family  30.9 
 
 
188 aa  85.9  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1096  helix-turn-helix domain-containing protein  29.55 
 
 
182 aa  85.5  5e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4589  transcriptional regulator, XRE family  29.21 
 
 
188 aa  85.1  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1740  DNA-binding protein  29.7 
 
 
178 aa  84.7  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000189008  hitchhiker  2.35786e-17 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2212  transcriptional regulator, XRE family  29.7 
 
 
178 aa  84.7  9e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1613  DNA-binding protein  29.7 
 
 
178 aa  84.7  9e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1517  DNA-binding protein  29.7 
 
 
178 aa  84.7  9e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01402  hypothetical protein  29.7 
 
 
178 aa  84.7  9e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2225  XRE family transcriptional regulator  29.7 
 
 
178 aa  84.7  9e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.639128 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>