More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2924 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2924  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 204 aa  420  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.705469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2877  transcriptional regulator, XRE family  42.7 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2075  helix-turn-helix domain protein  38.89 
 
 		 196 aa  128  5.0000000000000004e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241547  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3771  transcriptional regulator, XRE family  41.44 
 
 		 198 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.471902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4848  transcriptional regulator, XRE family  41.44 
 
 		 198 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0004  DNA-binding protein  41.71 
 
 		 202 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0662  XRE family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 259 aa  124  8.000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1430  DNA-binding protein  41.71 
 
 		 202 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1150  DNA-binding protein  41.71 
 
 		 202 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129822  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0005  DNA-binding protein  41.71 
 
 		 202 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792058  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4365  XRE family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 197 aa  123  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000321232  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1509  putative DNA-binding protein  41.14 
 
 		 202 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0004  DNA-binding protein  41.14 
 
 		 202 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.278794  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0004  DNA-binding cupin domain-containing protein  41.14 
 
 		 202 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5322  XRE family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0004  DNA-binding protein  40.57 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4806  putative DNA-binding transcriptional regulator  40.35 
 
 		 203 aa  118  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4804  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  43.9 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3114  XRE family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935644  normal  0.475898 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34730  XRE family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0210921  normal  0.262574 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4971  XRE family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 203 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110875  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5159  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 203 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5700  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 203 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441066 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4537  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 203 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3180  XRE family transcriptional regulator  40.11 
 
 		 203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7005  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 212 aa  112  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.89282 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4875  HTH-type transcriptional regulator  39.88 
 
 		 214 aa  111  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.256136  normal  0.0946557 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2346  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3022  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02293  putative transcription regulator protein  38.2 
 
 		 182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.40687 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4158  XRE family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 204 aa  108  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3086  transcriptional regulator, putative  34.09 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0196484  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0929  XRE family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 224 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145461  normal  0.153472 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2614  transcriptional regulator  35.03 
 
 		 248 aa  103  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2481  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 185 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193646  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0850  XRE family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 182 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.406298  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2239  transcriptional regulator  32.77 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0224117  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2542  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2928  DNA-binding protein  32.2 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384603 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1579  transcriptional regulator  32.96 
 
 		 182 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1096  helix-turn-helix domain-containing protein  34.08 
 
 		 182 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2279  DNA-binding protein  32.2 
 
 		 185 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.268468  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2254  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 185 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575156  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2197  transcriptional regulator  32.2 
 
 		 185 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2448  DNA-binding protein  32.2 
 
 		 185 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.191992  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2463  DNA-binding protein  32.2 
 
 		 185 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0945  transcriptional regulator, XRE family  31.28 
 
 		 184 aa  97.4  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000133489  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4454  XRE family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 203 aa  96.3  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561636  normal  0.472987 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0921  transcriptional regulator, XRE family  33.93 
 
 		 260 aa  94.4  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0917  transcriptional regulator, XRE family  33.93 
 
 		 192 aa  94.7  9e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0872  transcriptional regulator  33.93 
 
 		 192 aa  94  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.62802  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1109  XRE family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 183 aa  90.9  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3140  transcriptional regulator, XRE family  31.46 
 
 		 206 aa  89  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01840  transcriptional regulator, XRE family  30.68 
 
 		 182 aa  88.6  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4079  XRE family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 182 aa  88.6  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4983  transcriptional regulator, XRE family  32.39 
 
 		 209 aa  88.2  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0953387  normal  0.300371 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0324  XRE family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 191 aa  86.3  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000421536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0950  transcriptional regulator, XRE family  31.07 
 
 		 205 aa  85.5  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00163253 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5929  XRE family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 202 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.828276  normal  0.0967353 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0328  transcriptional regulator, XRE family  32.16 
 
 		 191 aa  85.1  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000353964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0321  XRE family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 191 aa  85.1  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250107  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5143  putative transcriptional regulator, XRE family  33.94 
 
 		 192 aa  85.1  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0117731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0327  XRE family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 191 aa  85.1  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000523898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0424  XRE family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 188 aa  85.1  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4933  transcriptional regulator, XRE family  31.02 
 
 		 209 aa  84.7  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0678  transcriptional regulator, XRE family  33.54 
 
 		 188 aa  84.7  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4967  transcriptional regulator, XRE family  30.11 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454469  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4469  helix-turn-helix domain-containing protein  31.02 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1957  XRE family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.210401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0323  XRE family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000737434  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0319  XRE family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 191 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000379854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3700  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000696836  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4938  XRE family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.839761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0744  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.541206  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4931  transcriptional regulator, XRE family  32.53 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4325  XRE family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 182 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.735671  normal  0.293625 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4285  transcriptional regulator, XRE family  31.06 
 
 		 182 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4371  XRE family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 182 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4437  XRE family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 182 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4256  transcriptional regulator, XRE family  31.06 
 
 		 182 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.949593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6018  XRE family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0116  XRE family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0574196 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1555  transcriptional regulator  32.7 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1265  XRE family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.509144  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4544  transcriptional regulator, XRE family  33.1 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.796901 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2770  XRE family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169539 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1806  transcriptional regulator, XRE family  29.21 
 
 		 181 aa  79  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2148  DNA-binding protein, putative  29.21 
 
 		 181 aa  79  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0634  XRE family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3325  transcriptional regulator, XRE family  31.33 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.610712  normal  0.167348 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3725  DNA-binding protein  31.45 
 
 		 258 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0416  XRE family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.387969 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2078  XRE family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2690  XRE family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2718  XRE family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0229  DNA-binding protein  31.25 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2361  DNA-binding protein  31.25 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0728  DNA-binding protein  31.25 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 178 aa  78.6  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2441  DNA-binding protein  31.25 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>