More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4931 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4931  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 187 aa  371  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2770  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 192 aa  174  9e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169539 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5072  transcriptional regulator, XRE family  43.32 
 
 		 207 aa  158  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1787  Cro/CI family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0263563  normal  0.220225 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1487  transcriptional regulator, Cro/CI family  41.76 
 
 		 200 aa  150  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.335106  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3529  XRE family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 200 aa  150  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.295271 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1789  transcriptional regulator, Cro/CI family  41.21 
 
 		 200 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.225 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1849  Cro/CI family transcriptional regulator  41.21 
 
 		 200 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1668  Cro/CI family transcriptional regulator  41.21 
 
 		 200 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.118403 
 
 
-
 
NC_003296  RS04780  putative transcription regulator protein  40.54 
 
 		 205 aa  147  8e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05657  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  40.54 
 
 		 205 aa  147  8e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5123  hypothetical protein  41.85 
 
 		 198 aa  140  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.635702  normal  0.639471 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0332  transcriptional regulator, XRE family  38.17 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.865127  normal  0.108372 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1855  XRE family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21785 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3508  XRE family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0510026 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3441  XRE family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.404086 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3308  transcriptional regulator  38.07 
 
 		 187 aa  109  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.38656  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2232  Cro/CI family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 177 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0197  XRE family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 190 aa  105  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0555347  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01840  transcriptional regulator, XRE family  35.03 
 
 		 182 aa  104  9e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46710  putative transcriptional regulator  40.91 
 
 		 216 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0037508  decreased coverage  0.000000167672 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0424  XRE family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 188 aa  102  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0319  XRE family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 191 aa  101  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000379854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3700  XRE family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 191 aa  101  7e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000696836  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4024  putative transcriptional regulator  40.34 
 
 		 195 aa  101  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0321  XRE family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250107  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0328  transcriptional regulator, XRE family  34.66 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000353964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0324  XRE family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000421536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0327  XRE family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 191 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000523898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0323  XRE family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 191 aa  99.4  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000737434  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0929  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 224 aa  95.5  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145461  normal  0.153472 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2877  transcriptional regulator, XRE family  35.56 
 
 		 207 aa  95.1  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3250  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  37.08 
 
 		 189 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.653673  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2075  helix-turn-helix domain protein  30.77 
 
 		 196 aa  93.2  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241547  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3469  DNA-binding protein  37.43 
 
 		 189 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.162788  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1642  XRE family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 186 aa  89.7  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.065261  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0678  transcriptional regulator, XRE family  37.65 
 
 		 188 aa  89.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1982  XRE family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 175 aa  89  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.623481  normal  0.364753 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0850  XRE family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 182 aa  87.4  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.406298  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2231  XRE family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 187 aa  86.3  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000245077 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4589  transcriptional regulator, XRE family  33.15 
 
 		 188 aa  85.9  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34730  XRE family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 193 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0210921  normal  0.262574 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4806  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.6 
 
 		 203 aa  85.5  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1096  helix-turn-helix domain-containing protein  27.53 
 
 		 182 aa  85.9  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0945  transcriptional regulator, XRE family  29.61 
 
 		 184 aa  85.1  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000133489  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1109  XRE family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 183 aa  85.1  5e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4268  transcriptional regulator, XRE family  32.61 
 
 		 188 aa  83.6  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0872  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.62802  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1579  transcriptional regulator  27.03 
 
 		 182 aa  83.2  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1520  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 176 aa  82.8  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0757766  normal  0.0239869 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2239  transcriptional regulator  27.22 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0224117  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2254  XRE family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575156  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2039  DNA-binding protein  28.82 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000824446  hitchhiker  5.01479e-19 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1816  XRE family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00473491  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3771  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.471902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4848  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2924  XRE family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 204 aa  81.3  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.705469  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2197  transcriptional regulator  27.22 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26325  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3086  transcriptional regulator, putative  31.07 
 
 		 212 aa  80.9  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0196484  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2463  DNA-binding protein  26.67 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2279  DNA-binding protein  26.67 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.268468  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2542  DNA-binding protein  27.22 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0662  XRE family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2448  DNA-binding protein  26.67 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.191992  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0917  transcriptional regulator, XRE family  32.77 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2928  DNA-binding protein  27.22 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384603 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0921  transcriptional regulator, XRE family  32.78 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2481  DNA-binding protein  27.22 
 
 		 185 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193646  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4448  XRE family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0311191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03313  transcriptional regulator, Cro/CI family protein  31.32 
 
 		 175 aa  79  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3725  DNA-binding protein  34.5 
 
 		 258 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7005  transcriptional regulator, XRE family  29.55 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.89282 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1719  XRE family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 178 aa  78.6  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.499876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1211  helix-turn-helix domain-containing protein  24.71 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.924879 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01392  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.24 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2212  transcriptional regulator, XRE family  28.24 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2225  XRE family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.639128 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1517  DNA-binding protein  28.24 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1740  DNA-binding protein  28.24 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000189008  hitchhiker  2.35786e-17 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01402  hypothetical protein  28.24 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1613  DNA-binding protein  28.24 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4773  transcriptional regulator, XRE family  34.13 
 
 		 187 aa  77.8  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0282623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03443  transcriptional regulator, HTH_3 family protein  28.73 
 
 		 208 aa  77.8  0.00000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1722  transcriptional regulator, XRE family  29.41 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.185673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3551  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 196 aa  77.8  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1783  XRE family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1737  XRE family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 185 aa  77  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0744  XRE family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.541206  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1556  transcriptional regulator, XRE family  29.41 
 
 		 178 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02293  putative transcription regulator protein  32.95 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.40687 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5322  XRE family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2346  transcriptional regulator  29.35 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4365  XRE family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000321232  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4983  transcriptional regulator, XRE family  32.4 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0953387  normal  0.300371 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2484  XRE family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0499056 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2487  XRE family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4967  transcriptional regulator, XRE family  30.16 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454469  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4938  XRE family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.839761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4875  HTH-type transcriptional regulator  32.56 
 
 		 214 aa  74.7  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.256136  normal  0.0946557 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0389  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.762812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>