More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5072 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5072  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 207 aa  416  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04780  putative transcription regulator protein  57.92 
 
 		 205 aa  232  3e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05657  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  57.92 
 
 		 205 aa  232  3e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3529  XRE family transcriptional regulator  56 
 
 		 200 aa  223  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.295271 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1789  transcriptional regulator, Cro/CI family  53.5 
 
 		 200 aa  204  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.225 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1668  Cro/CI family transcriptional regulator  53.5 
 
 		 200 aa  204  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.118403 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1487  transcriptional regulator, Cro/CI family  53.5 
 
 		 200 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.335106  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1849  Cro/CI family transcriptional regulator  53 
 
 		 200 aa  201  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1787  Cro/CI family transcriptional regulator  53 
 
 		 200 aa  201  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0263563  normal  0.220225 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4931  transcriptional regulator, XRE family  43.32 
 
 		 187 aa  158  6e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2770  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 192 aa  154  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5123  hypothetical protein  39.43 
 
 		 198 aa  129  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.635702  normal  0.639471 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0332  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 201 aa  108  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.865127  normal  0.108372 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3308  transcriptional regulator  37.1 
 
 		 187 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.38656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4024  putative transcriptional regulator  35.35 
 
 		 195 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0197  XRE family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 190 aa  94.4  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0555347  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2232  Cro/CI family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 177 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1096  helix-turn-helix domain-containing protein  31.55 
 
 		 182 aa  93.6  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1855  XRE family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 177 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21785 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4848  transcriptional regulator, XRE family  35.5 
 
 		 198 aa  92.8  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46710  putative transcriptional regulator  36.41 
 
 		 216 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0037508  decreased coverage  0.000000167672 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3771  transcriptional regulator, XRE family  35.5 
 
 		 198 aa  92.8  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.471902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3508  XRE family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 187 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0510026 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4806  putative DNA-binding transcriptional regulator  35.29 
 
 		 203 aa  92.8  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2075  helix-turn-helix domain protein  28.35 
 
 		 196 aa  91.7  7e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241547  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1109  XRE family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 183 aa  89.7  3e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0929  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 224 aa  89.4  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145461  normal  0.153472 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3441  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 187 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.404086 
 
 
-
 
NC_003296  RS02293  putative transcription regulator protein  32.77 
 
 		 182 aa  89  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.40687 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34730  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 193 aa  87.8  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0210921  normal  0.262574 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3250  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  35.36 
 
 		 189 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.653673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0850  XRE family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 182 aa  87.4  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.406298  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0872  transcriptional regulator  29.12 
 
 		 192 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.62802  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1211  helix-turn-helix domain-containing protein  33.16 
 
 		 200 aa  87.8  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0744  XRE family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 209 aa  86.3  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.541206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0921  transcriptional regulator, XRE family  28.65 
 
 		 260 aa  84.7  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4365  XRE family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 197 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000321232  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4158  XRE family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 204 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0917  transcriptional regulator, XRE family  28.02 
 
 		 192 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1579  transcriptional regulator  27.98 
 
 		 182 aa  84  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3469  DNA-binding protein  34.81 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.162788  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1816  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00473491  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2346  transcriptional regulator  30.99 
 
 		 215 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2877  transcriptional regulator, XRE family  31.28 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0004  DNA-binding protein  32.78 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.278794  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1430  DNA-binding protein  32.78 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0004  DNA-binding protein  32.78 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1509  putative DNA-binding protein  32.78 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0005  DNA-binding protein  32.78 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792058  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0004  DNA-binding cupin domain-containing protein  32.78 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3114  XRE family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935644  normal  0.475898 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4971  XRE family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110875  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1150  DNA-binding protein  32.78 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129822  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7005  transcriptional regulator, XRE family  32.22 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.89282 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3022  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0004  DNA-binding protein  32.22 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4537  XRE family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5159  XRE family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5700  XRE family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441066 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5322  XRE family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4804  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.93 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3180  XRE family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3086  transcriptional regulator, putative  30.51 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0196484  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2542  DNA-binding protein  25.5 
 
 		 185 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2231  XRE family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000245077 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2924  XRE family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.705469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3188  XRE family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.549125 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2254  XRE family transcriptional regulator  25 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575156  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0634  XRE family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3325  transcriptional regulator, XRE family  31.09 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.610712  normal  0.167348 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1642  XRE family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.065261  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03443  transcriptional regulator, HTH_3 family protein  29.61 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0950  transcriptional regulator, XRE family  27.54 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00163253 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0608  XRE family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 227 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0416  XRE family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.387969 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2279  DNA-binding protein  25.14 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.268468  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2239  transcriptional regulator  24.31 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0224117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2197  transcriptional regulator  25.68 
 
 		 185 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26325  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6018  XRE family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2448  DNA-binding protein  25.14 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.191992  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01840  transcriptional regulator, XRE family  28.89 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2463  DNA-binding protein  25.14 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0116  XRE family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0574196 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0945  transcriptional regulator, XRE family  26.4 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000133489  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2078  XRE family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 228 aa  72  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2690  XRE family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 228 aa  72  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2718  XRE family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 228 aa  72  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2481  DNA-binding protein  24.5 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193646  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2039  DNA-binding protein  28.8 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000824446  hitchhiker  5.01479e-19 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2928  DNA-binding protein  24.5 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384603 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0893  DNA-binding protein  31.49 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0321  XRE family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250107  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0714  DNA-binding protein  31.49 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0728  DNA-binding protein  31.49 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2607  XRE family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2743  XRE family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0327  XRE family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000523898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1740  DNA-binding protein  28.04 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000189008  hitchhiker  2.35786e-17 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0328  transcriptional regulator, XRE family  25.27 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000353964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2717  DNA-binding protein  31.49 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>