More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4024 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4024  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 195 aa  388  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46710  putative transcriptional regulator  97.44 
 
 		 216 aa  374  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0037508  decreased coverage  0.000000167672 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0197  XRE family transcriptional regulator  62.96 
 
 		 190 aa  224  7e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0555347  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3441  XRE family transcriptional regulator  57.07 
 
 		 187 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.404086 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3308  transcriptional regulator  57.92 
 
 		 187 aa  200  9e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.38656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3508  XRE family transcriptional regulator  58.24 
 
 		 187 aa  197  6e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0510026 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3250  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  57.38 
 
 		 189 aa  192  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.653673  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2232  Cro/CI family transcriptional regulator  58.29 
 
 		 177 aa  191  6e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1855  XRE family transcriptional regulator  57.95 
 
 		 177 aa  191  6e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21785 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3469  DNA-binding protein  56.91 
 
 		 189 aa  190  9e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.162788  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3188  XRE family transcriptional regulator  56.15 
 
 		 189 aa  190  9e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.549125 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1816  XRE family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 191 aa  169  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00473491  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2770  XRE family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 192 aa  109  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5123  hypothetical protein  38.59 
 
 		 198 aa  108  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.635702  normal  0.639471 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4931  transcriptional regulator, XRE family  40.34 
 
 		 187 aa  101  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1668  Cro/CI family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 200 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.118403 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1849  Cro/CI family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 200 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1789  transcriptional regulator, Cro/CI family  37.91 
 
 		 200 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.225 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1787  Cro/CI family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 200 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0263563  normal  0.220225 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5072  transcriptional regulator, XRE family  35.35 
 
 		 207 aa  95.5  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1487  transcriptional regulator, Cro/CI family  38.42 
 
 		 200 aa  95.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.335106  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3529  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 200 aa  93.2  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.295271 
 
 
-
 
NC_003296  RS04780  putative transcription regulator protein  34.08 
 
 		 205 aa  86.3  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05657  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  34.08 
 
 		 205 aa  86.3  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2877  transcriptional regulator, XRE family  34.64 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0850  XRE family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 182 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.406298  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05910  predicted transcriptional regulator  38.56 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.848221  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1109  XRE family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 183 aa  74.7  0.0000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2254  XRE family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575156  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1096  helix-turn-helix domain-containing protein  25.58 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1579  transcriptional regulator  25.86 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2928  DNA-binding protein  27.01 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384603 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4079  XRE family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2075  helix-turn-helix domain protein  29.89 
 
 		 196 aa  71.2  0.000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241547  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0929  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  71.2  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145461  normal  0.153472 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2542  DNA-binding protein  27.01 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2279  DNA-binding protein  27.01 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.268468  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2448  DNA-binding protein  27.01 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.191992  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2463  DNA-binding protein  27.01 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0831  XRE family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000078794  normal  0.173113 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0678  transcriptional regulator, XRE family  32.52 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2239  transcriptional regulator  27.01 
 
 		 185 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0224117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2197  transcriptional regulator  25.99 
 
 		 185 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26325  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0332  transcriptional regulator, XRE family  33.72 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.865127  normal  0.108372 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2481  DNA-binding protein  26.55 
 
 		 185 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193646  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01840  transcriptional regulator, XRE family  28.4 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2487  XRE family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2346  transcriptional regulator  30.56 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1459  helix-turn-helix domain protein  31.9 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1520  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0757766  normal  0.0239869 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3484  transcriptional regulator, XRE family  31.61 
 
 		 200 aa  64.3  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0662  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  28.22 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2078  XRE family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2718  XRE family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2690  XRE family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3325  transcriptional regulator, XRE family  31.34 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.610712  normal  0.167348 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2607  XRE family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3725  DNA-binding protein  29.63 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0917  transcriptional regulator, XRE family  31.14 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6018  XRE family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0594  DNA-binding protein  32.79 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0744  XRE family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.541206  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0321  XRE family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250107  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2743  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4773  transcriptional regulator, XRE family  31.52 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0282623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2054  transcriptional regulator, XRE family  28.92 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.388224 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0634  XRE family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1211  helix-turn-helix domain-containing protein  27.01 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4806  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.95 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0324  XRE family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000421536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34730  XRE family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 193 aa  62  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0210921  normal  0.262574 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2039  DNA-binding protein  30 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000824446  hitchhiker  5.01479e-19 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0389  XRE family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.762812  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3286  DNA-binding protein  27.06 
 
 		 179 aa  60.8  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0608  XRE family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0728  DNA-binding protein  32.24 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0893  DNA-binding protein  32.24 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4256  transcriptional regulator, XRE family  29.03 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.949593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1719  XRE family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 178 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.499876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4371  XRE family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4285  transcriptional regulator, XRE family  29.03 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0872  transcriptional regulator  30.54 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.62802  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4437  XRE family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2231  XRE family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 187 aa  61.2  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000245077 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15000  predicted transcriptional regulator  30.72 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.904149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6084  XRE family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.207069 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0323  XRE family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000737434  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3700  XRE family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000696836  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0714  DNA-binding protein  32.24 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0319  XRE family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000379854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4325  XRE family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.735671  normal  0.293625 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0099  transcriptional regulator, XRE family  28.89 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0921  transcriptional regulator, XRE family  30.54 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2361  DNA-binding protein  32.24 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1033  transcriptional regulator, XRE family  29.51 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3114  XRE family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935644  normal  0.475898 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4589  transcriptional regulator, XRE family  27.06 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2717  DNA-binding protein  32.24 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>