More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_4079 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_4079  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
182 aa  372  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4437  XRE family transcriptional regulator  87.91 
 
 
182 aa  328  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4371  XRE family transcriptional regulator  87.91 
 
 
182 aa  328  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4325  XRE family transcriptional regulator  87.91 
 
 
182 aa  328  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.735671  normal  0.293625 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4256  transcriptional regulator, XRE family  87.91 
 
 
182 aa  328  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.949593  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4285  transcriptional regulator, XRE family  87.91 
 
 
182 aa  328  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0678  transcriptional regulator, XRE family  62.64 
 
 
188 aa  226  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15000  predicted transcriptional regulator  60.11 
 
 
184 aa  224  6e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.904149  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2054  transcriptional regulator, XRE family  60.67 
 
 
186 aa  218  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.388224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4544  transcriptional regulator, XRE family  64.6 
 
 
215 aa  217  7.999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.796901 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2487  XRE family transcriptional regulator  57.87 
 
 
189 aa  215  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1459  helix-turn-helix domain protein  56.67 
 
 
182 aa  211  5.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3484  transcriptional regulator, XRE family  55.06 
 
 
200 aa  203  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3725  DNA-binding protein  53.37 
 
 
258 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3184  transcriptional regulator, XRE family  51.69 
 
 
183 aa  183  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4106  transcriptional regulator, XRE family  40.46 
 
 
207 aa  123  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0938506  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0073  helix-turn-helix domain-containing protein  34.86 
 
 
210 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3063  transcriptional regulator, XRE family  32.61 
 
 
201 aa  104  8e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0662  XRE family transcriptional regulator  29.51 
 
 
259 aa  97.1  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2877  transcriptional regulator, XRE family  31.93 
 
 
207 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0872  transcriptional regulator  30.67 
 
 
192 aa  95.5  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.62802  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7277  transcriptional regulator, XRE family  34.48 
 
 
189 aa  94.7  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0921  transcriptional regulator, XRE family  30.06 
 
 
260 aa  94  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0917  transcriptional regulator, XRE family  30.06 
 
 
192 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0410  putative transcriptional regulator, XRE family  35.84 
 
 
189 aa  92  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0389  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 
178 aa  91.7  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.762812  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1520  XRE family transcriptional regulator  32.4 
 
 
176 aa  91.7  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0757766  normal  0.0239869 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2928  DNA-binding protein  26.25 
 
 
185 aa  89  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00384603 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4032  transcriptional regulator, XRE family  33.73 
 
 
187 aa  89.4  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.45676  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2924  XRE family transcriptional regulator  32.7 
 
 
204 aa  88.6  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.705469  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0929  XRE family transcriptional regulator  28.4 
 
 
224 aa  88.2  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145461  normal  0.153472 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4229  hypothetical protein  34.16 
 
 
652 aa  87  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.60873 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01840  transcriptional regulator, XRE family  27.11 
 
 
182 aa  87  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2453  XRE family transcriptional regulator  34.88 
 
 
175 aa  87.4  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.68554  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  34.36 
 
 
171 aa  86.3  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0410  XRE family transcriptional regulator  30.25 
 
 
516 aa  86.3  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2463  DNA-binding protein  26.06 
 
 
185 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2279  DNA-binding protein  26.06 
 
 
185 aa  85.5  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.268468  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2542  DNA-binding protein  26.06 
 
 
185 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2448  DNA-binding protein  26.06 
 
 
185 aa  85.5  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.191992  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03313  transcriptional regulator, Cro/CI family protein  31.9 
 
 
175 aa  85.1  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2197  transcriptional regulator  25.45 
 
 
185 aa  84.7  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2239  transcriptional regulator  26.06 
 
 
185 aa  84.3  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0224117  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2254  XRE family transcriptional regulator  25 
 
 
185 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575156  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2481  DNA-binding protein  25.45 
 
 
185 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193646  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0766  helix-turn-helix domain protein  32.52 
 
 
182 aa  82.4  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4589  transcriptional regulator, XRE family  29.94 
 
 
188 aa  82  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4875  HTH-type transcriptional regulator  31.79 
 
 
214 aa  82  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.256136  normal  0.0946557 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0321  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 
191 aa  80.9  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250107  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7005  transcriptional regulator, XRE family  29.31 
 
 
212 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.89282 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1957  XRE family transcriptional regulator  29.48 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.210401  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0327  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 
191 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000523898  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0424  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0328  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 
191 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000353964  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4537  XRE family transcriptional regulator  30.86 
 
 
203 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3022  XRE family transcriptional regulator  29.89 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2330  helix-turn-helix domain-containing protein  32.58 
 
 
203 aa  79.7  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.699676  decreased coverage  0.000887341 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4158  XRE family transcriptional regulator  29.31 
 
 
204 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0323  XRE family transcriptional regulator  27.98 
 
 
191 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000737434  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5159  XRE family transcriptional regulator  30.86 
 
 
203 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5700  XRE family transcriptional regulator  30.86 
 
 
203 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441066 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0950  transcriptional regulator, XRE family  28.16 
 
 
205 aa  78.6  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00163253 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0791  XRE family transcriptional regulator  31.48 
 
 
528 aa  78.6  0.00000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1642  XRE family transcriptional regulator  30.18 
 
 
186 aa  78.6  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.065261  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4967  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 
218 aa  78.2  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454469  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4613  DNA-binding protein  31.1 
 
 
190 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4848  transcriptional regulator, XRE family  32.75 
 
 
198 aa  77.8  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3771  transcriptional regulator, XRE family  32.75 
 
 
198 aa  77.8  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.471902  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3700  XRE family transcriptional regulator  28.99 
 
 
191 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000696836  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0319  XRE family transcriptional regulator  28.4 
 
 
191 aa  77.8  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000379854  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3180  XRE family transcriptional regulator  30.49 
 
 
203 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2231  XRE family transcriptional regulator  27.78 
 
 
187 aa  77.8  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000245077 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0622  DNA-binding protein  29.88 
 
 
190 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.475485  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3025  XRE family transcriptional regulator  31.41 
 
 
188 aa  77  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314698  normal  0.932142 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4983  transcriptional regulator, XRE family  28.05 
 
 
209 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0953387  normal  0.300371 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4617  DNA-binding protein  31.52 
 
 
190 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4400  DNA-binding protein  31.52 
 
 
190 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4240  DNA-binding protein  31.52 
 
 
190 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4252  DNA-binding protein  31.52 
 
 
190 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4938  XRE family transcriptional regulator  29.31 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.839761  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4740  DNA-binding protein  31.52 
 
 
190 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2614  transcriptional regulator  29.01 
 
 
248 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0324  XRE family transcriptional regulator  28.4 
 
 
191 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000421536  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4631  DNA-binding protein  30.91 
 
 
190 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1509  putative DNA-binding protein  29.89 
 
 
202 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1579  transcriptional regulator  28.14 
 
 
182 aa  75.5  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0004  DNA-binding cupin domain-containing protein  29.89 
 
 
202 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0004  DNA-binding protein  29.89 
 
 
202 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.278794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4633  DNA-binding protein  30.91 
 
 
190 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0850  XRE family transcriptional regulator  29.17 
 
 
182 aa  75.5  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.406298  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0116  XRE family transcriptional regulator  27.84 
 
 
205 aa  75.1  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0574196 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0004  DNA-binding protein  29.89 
 
 
202 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1852  Cro/CI family transcriptional regulator  31.01 
 
 
642 aa  74.7  0.0000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0004  DNA-binding protein  29.89 
 
 
202 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1430  DNA-binding protein  29.89 
 
 
202 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0005  DNA-binding protein  29.89 
 
 
202 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792058  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1150  DNA-binding protein  29.89 
 
 
202 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129822  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4933  transcriptional regulator, XRE family  27.44 
 
 
209 aa  74.3  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4469  helix-turn-helix domain-containing protein  27.44 
 
 
209 aa  74.3  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46710  putative transcriptional regulator  31.68 
 
 
216 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0037508  decreased coverage  0.000000167672 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>