More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0410 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0410  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
516 aa  1038    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0791  XRE family transcriptional regulator  34.3 
 
 
528 aa  236  8e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1852  Cro/CI family transcriptional regulator  30.12 
 
 
642 aa  120  7.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4229  hypothetical protein  29.18 
 
 
652 aa  107  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.60873 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1520  XRE family transcriptional regulator  35.76 
 
 
176 aa  99.4  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0757766  normal  0.0239869 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03313  transcriptional regulator, Cro/CI family protein  35.4 
 
 
175 aa  99  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0389  XRE family transcriptional regulator  37.58 
 
 
178 aa  92.8  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.762812  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0410  putative transcriptional regulator, XRE family  33.95 
 
 
189 aa  90.9  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4079  XRE family transcriptional regulator  30.25 
 
 
182 aa  86.3  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2487  XRE family transcriptional regulator  29.34 
 
 
189 aa  83.6  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3063  transcriptional regulator, XRE family  30.99 
 
 
201 aa  83.2  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4371  XRE family transcriptional regulator  30.06 
 
 
182 aa  83.2  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4285  transcriptional regulator, XRE family  30.06 
 
 
182 aa  83.2  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4437  XRE family transcriptional regulator  30.06 
 
 
182 aa  83.2  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4325  XRE family transcriptional regulator  30.06 
 
 
182 aa  83.2  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.735671  normal  0.293625 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4256  transcriptional regulator, XRE family  30.06 
 
 
182 aa  83.2  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.949593  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4106  transcriptional regulator, XRE family  31.03 
 
 
207 aa  81.3  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0938506  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01840  transcriptional regulator, XRE family  30.86 
 
 
182 aa  80.9  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2453  XRE family transcriptional regulator  29.48 
 
 
175 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.68554  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15000  predicted transcriptional regulator  32.26 
 
 
184 aa  79.7  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.904149  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0678  transcriptional regulator, XRE family  30.86 
 
 
188 aa  78.6  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2614  transcriptional regulator  31.93 
 
 
248 aa  78.2  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1719  XRE family transcriptional regulator  28.25 
 
 
178 aa  77.4  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.499876  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01392  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.54 
 
 
178 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2212  transcriptional regulator, XRE family  30.54 
 
 
178 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1613  DNA-binding protein  30.54 
 
 
178 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01402  hypothetical protein  30.54 
 
 
178 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1722  transcriptional regulator, XRE family  28.25 
 
 
185 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.185673  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2225  XRE family transcriptional regulator  30.54 
 
 
178 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.639128 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1517  DNA-binding protein  30.54 
 
 
178 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1740  DNA-binding protein  30.54 
 
 
178 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000189008  hitchhiker  2.35786e-17 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4589  transcriptional regulator, XRE family  30.67 
 
 
188 aa  75.5  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4544  transcriptional regulator, XRE family  32.21 
 
 
215 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.796901 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1556  transcriptional regulator, XRE family  28.25 
 
 
178 aa  75.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0766  helix-turn-helix domain protein  30.67 
 
 
182 aa  75.9  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1783  XRE family transcriptional regulator  28.32 
 
 
178 aa  73.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1737  XRE family transcriptional regulator  27.68 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1555  transcriptional regulator  28.57 
 
 
181 aa  73.6  0.000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2039  DNA-binding protein  29.94 
 
 
178 aa  73.6  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000824446  hitchhiker  5.01479e-19 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7277  transcriptional regulator, XRE family  31.48 
 
 
189 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2330  helix-turn-helix domain-containing protein  28.32 
 
 
203 aa  71.6  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.699676  decreased coverage  0.000887341 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1459  helix-turn-helix domain protein  29.87 
 
 
182 aa  71.6  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2054  transcriptional regulator, XRE family  29.41 
 
 
186 aa  71.2  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.388224 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2877  transcriptional regulator, XRE family  30.86 
 
 
207 aa  71.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0662  XRE family transcriptional regulator  32.39 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3140  transcriptional regulator, XRE family  32.57 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0872  transcriptional regulator  27.37 
 
 
192 aa  70.1  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.62802  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  30.67 
 
 
171 aa  69.3  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4268  transcriptional regulator, XRE family  29.61 
 
 
188 aa  69.3  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2239  transcriptional regulator  26.14 
 
 
185 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0224117  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4806  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.09 
 
 
203 aa  68.6  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2481  DNA-binding protein  27.59 
 
 
185 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193646  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0929  XRE family transcriptional regulator  29.7 
 
 
224 aa  67.8  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145461  normal  0.153472 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4032  transcriptional regulator, XRE family  28.49 
 
 
187 aa  67.8  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.45676  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2542  DNA-binding protein  26.99 
 
 
185 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2075  helix-turn-helix domain protein  28.25 
 
 
196 aa  67.4  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241547  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2279  DNA-binding protein  26.14 
 
 
185 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.268468  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2197  transcriptional regulator  26.14 
 
 
185 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26325  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3184  transcriptional regulator, XRE family  29.88 
 
 
183 aa  67.4  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2463  DNA-binding protein  26.14 
 
 
185 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2448  DNA-binding protein  26.14 
 
 
185 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.191992  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0921  transcriptional regulator, XRE family  27.07 
 
 
260 aa  67.4  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0917  transcriptional regulator, XRE family  26.52 
 
 
192 aa  67  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0004  DNA-binding cupin domain-containing protein  29.21 
 
 
202 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1509  putative DNA-binding protein  29.21 
 
 
202 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2928  DNA-binding protein  25.86 
 
 
185 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00384603 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0004  DNA-binding protein  29.21 
 
 
202 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0004  DNA-binding protein  29.21 
 
 
202 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.278794  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0945  transcriptional regulator, XRE family  30.82 
 
 
184 aa  65.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000133489  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4365  XRE family transcriptional regulator  27.62 
 
 
197 aa  65.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000321232  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4613  DNA-binding protein  28.48 
 
 
190 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0073  helix-turn-helix domain-containing protein  29.05 
 
 
210 aa  65.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4209  XRE family transcriptional regulator  27.61 
 
 
194 aa  65.1  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2254  XRE family transcriptional regulator  25.29 
 
 
185 aa  65.1  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575156  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0005  DNA-binding protein  28.65 
 
 
202 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792058  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0004  DNA-binding protein  28.65 
 
 
202 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4333  XRE family transcriptional regulator  27.27 
 
 
190 aa  64.3  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0622  DNA-binding protein  27.85 
 
 
190 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.475485  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1642  XRE family transcriptional regulator  28.65 
 
 
186 aa  64.7  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.065261  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1150  DNA-binding protein  28.65 
 
 
202 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129822  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1430  DNA-binding protein  28.65 
 
 
202 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1109  XRE family transcriptional regulator  28.32 
 
 
183 aa  64.3  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3725  DNA-binding protein  27.78 
 
 
258 aa  63.9  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4631  DNA-binding protein  27.84 
 
 
190 aa  63.5  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0755  DNA-binding protein  26.16 
 
 
181 aa  63.5  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4481  DNA-binding protein  26.16 
 
 
181 aa  63.5  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4633  DNA-binding protein  27.84 
 
 
190 aa  63.5  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3080  XRE family transcriptional regulator  27.16 
 
 
181 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.995144  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02293  putative transcription regulator protein  29.21 
 
 
182 aa  63.5  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.40687 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4875  HTH-type transcriptional regulator  33.78 
 
 
214 aa  63.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.256136  normal  0.0946557 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4400  DNA-binding protein  27.27 
 
 
190 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4240  DNA-binding protein  27.27 
 
 
190 aa  62.4  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4252  DNA-binding protein  27.27 
 
 
190 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4617  DNA-binding protein  27.27 
 
 
190 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4740  DNA-binding protein  27.27 
 
 
190 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  28.49 
 
 
178 aa  62.8  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1982  XRE family transcriptional regulator  29.41 
 
 
175 aa  62.8  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.623481  normal  0.364753 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3025  XRE family transcriptional regulator  32.03 
 
 
188 aa  62.4  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314698  normal  0.932142 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3484  transcriptional regulator, XRE family  26.35 
 
 
200 aa  62.4  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4443  DNA-binding protein  25.75 
 
 
181 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>