More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_4333 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_4333  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
190 aa  393  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4240  DNA-binding protein  98.42 
 
 
190 aa  386  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4252  DNA-binding protein  98.42 
 
 
190 aa  386  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4631  DNA-binding protein  97.89 
 
 
190 aa  385  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4400  DNA-binding protein  98.42 
 
 
190 aa  385  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4617  DNA-binding protein  98.42 
 
 
190 aa  385  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4740  DNA-binding protein  98.42 
 
 
190 aa  385  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4633  DNA-binding protein  97.89 
 
 
190 aa  385  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4613  DNA-binding protein  96.84 
 
 
190 aa  379  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0622  DNA-binding protein  95.79 
 
 
190 aa  377  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.475485  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2928  DNA-binding protein  33.91 
 
 
185 aa  111  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00384603 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2197  transcriptional regulator  34.48 
 
 
185 aa  110  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26325  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2481  DNA-binding protein  35.47 
 
 
185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193646  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2279  DNA-binding protein  34.48 
 
 
185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.268468  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2463  DNA-binding protein  34.48 
 
 
185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2448  DNA-binding protein  34.48 
 
 
185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.191992  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2239  transcriptional regulator  34.48 
 
 
185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0224117  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2254  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575156  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2542  DNA-binding protein  34.88 
 
 
185 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0662  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 
259 aa  108  6e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2614  transcriptional regulator  28.8 
 
 
248 aa  106  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2231  XRE family transcriptional regulator  29.51 
 
 
187 aa  105  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000245077 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0929  XRE family transcriptional regulator  30.73 
 
 
224 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145461  normal  0.153472 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4589  transcriptional regulator, XRE family  30.98 
 
 
188 aa  101  7e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0917  transcriptional regulator, XRE family  31.05 
 
 
192 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0872  transcriptional regulator  30.53 
 
 
192 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.62802  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0921  transcriptional regulator, XRE family  31.05 
 
 
260 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1579  transcriptional regulator  32.76 
 
 
182 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0321  XRE family transcriptional regulator  32.96 
 
 
191 aa  99  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250107  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1211  helix-turn-helix domain-containing protein  30.86 
 
 
200 aa  99.4  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0323  XRE family transcriptional regulator  33.15 
 
 
191 aa  98.6  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000737434  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0424  XRE family transcriptional regulator  33.14 
 
 
188 aa  97.8  8e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0327  XRE family transcriptional regulator  33.15 
 
 
191 aa  97.8  9e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000523898  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0328  transcriptional regulator, XRE family  33.14 
 
 
191 aa  97.4  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000353964  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4268  transcriptional regulator, XRE family  30.05 
 
 
188 aa  97.1  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0850  XRE family transcriptional regulator  31.11 
 
 
182 aa  97.1  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.406298  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1109  XRE family transcriptional regulator  33.91 
 
 
183 aa  96.7  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0945  transcriptional regulator, XRE family  31.49 
 
 
184 aa  96.3  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000133489  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2484  XRE family transcriptional regulator  33.13 
 
 
187 aa  95.5  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0499056 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0744  XRE family transcriptional regulator  31.07 
 
 
209 aa  95.1  5e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.541206  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01392  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.18 
 
 
178 aa  95.1  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2212  transcriptional regulator, XRE family  31.18 
 
 
178 aa  95.1  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1613  DNA-binding protein  31.18 
 
 
178 aa  95.1  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2225  XRE family transcriptional regulator  31.18 
 
 
178 aa  95.1  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.639128 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1517  DNA-binding protein  31.18 
 
 
178 aa  95.1  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01402  hypothetical protein  31.18 
 
 
178 aa  95.1  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1096  helix-turn-helix domain-containing protein  31.11 
 
 
182 aa  94.7  7e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1740  DNA-binding protein  31.18 
 
 
178 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000189008  hitchhiker  2.35786e-17 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2039  DNA-binding protein  31.18 
 
 
178 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000824446  hitchhiker  5.01479e-19 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3700  XRE family transcriptional regulator  32.58 
 
 
191 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000696836  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0319  XRE family transcriptional regulator  32.02 
 
 
191 aa  93.2  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000379854  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0324  XRE family transcriptional regulator  31.46 
 
 
191 aa  91.3  7e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000421536  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2877  transcriptional regulator, XRE family  34.83 
 
 
207 aa  91.3  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03443  transcriptional regulator, HTH_3 family protein  30.22 
 
 
208 aa  90.1  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1737  XRE family transcriptional regulator  30.18 
 
 
185 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1722  transcriptional regulator, XRE family  30.18 
 
 
185 aa  89.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.185673  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1663  DNA-binding protein  29.71 
 
 
185 aa  88.6  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1556  transcriptional regulator, XRE family  30.18 
 
 
178 aa  88.2  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1555  transcriptional regulator  32.28 
 
 
181 aa  87.4  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1719  XRE family transcriptional regulator  29.59 
 
 
178 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.499876  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2346  transcriptional regulator  29.95 
 
 
215 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1783  XRE family transcriptional regulator  28.4 
 
 
178 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1642  XRE family transcriptional regulator  26.37 
 
 
186 aa  86.3  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.065261  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34730  XRE family transcriptional regulator  30.17 
 
 
193 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0210921  normal  0.262574 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1982  XRE family transcriptional regulator  27.53 
 
 
175 aa  85.1  6e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.623481  normal  0.364753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0410  putative transcriptional regulator, XRE family  30.32 
 
 
189 aa  83.2  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4967  transcriptional regulator, XRE family  26.52 
 
 
218 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454469  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4158  XRE family transcriptional regulator  28.65 
 
 
204 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4933  transcriptional regulator, XRE family  26.99 
 
 
209 aa  81.3  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0134  hypothetical protein  27.17 
 
 
191 aa  80.9  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4983  transcriptional regulator, XRE family  26.79 
 
 
209 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0953387  normal  0.300371 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4469  helix-turn-helix domain-containing protein  26.99 
 
 
209 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3551  transcriptional regulator, XRE family  29.61 
 
 
196 aa  79.7  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4938  XRE family transcriptional regulator  25.86 
 
 
206 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.839761  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  28.49 
 
 
192 aa  78.2  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3086  transcriptional regulator, putative  28.57 
 
 
212 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0196484  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0950  transcriptional regulator, XRE family  24.31 
 
 
205 aa  77  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00163253 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4454  XRE family transcriptional regulator  23.91 
 
 
203 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561636  normal  0.472987 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4875  HTH-type transcriptional regulator  32.34 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.256136  normal  0.0946557 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1509  putative DNA-binding protein  28.65 
 
 
202 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0678  transcriptional regulator, XRE family  27.62 
 
 
188 aa  77  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0004  DNA-binding cupin domain-containing protein  28.65 
 
 
202 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0004  DNA-binding protein  28.65 
 
 
202 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.278794  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01840  transcriptional regulator, XRE family  28.92 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0116  XRE family transcriptional regulator  25.71 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0574196 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2453  XRE family transcriptional regulator  27.33 
 
 
175 aa  75.5  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.68554  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1520  XRE family transcriptional regulator  27.22 
 
 
176 aa  75.1  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0757766  normal  0.0239869 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2924  XRE family transcriptional regulator  32.14 
 
 
204 aa  74.7  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.705469  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2330  helix-turn-helix domain-containing protein  28.05 
 
 
203 aa  74.3  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.699676  decreased coverage  0.000887341 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0004  DNA-binding protein  28.05 
 
 
202 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0004  DNA-binding protein  28.09 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1150  DNA-binding protein  28.09 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129822  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0005  DNA-binding protein  28.09 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792058  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4365  XRE family transcriptional regulator  23.53 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000321232  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3022  XRE family transcriptional regulator  27.44 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4079  XRE family transcriptional regulator  30.91 
 
 
182 aa  73.9  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1430  DNA-binding protein  28.09 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15000  predicted transcriptional regulator  26.82 
 
 
184 aa  74.3  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.904149  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2487  XRE family transcriptional regulator  27.17 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05657  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  29.19 
 
 
205 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>