More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0424 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0424  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 188 aa  390  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0327  XRE family transcriptional regulator  97.86 
 
 		 191 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000523898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0328  transcriptional regulator, XRE family  97.33 
 
 		 191 aa  380  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000353964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0323  XRE family transcriptional regulator  96.79 
 
 		 191 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000737434  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0321  XRE family transcriptional regulator  96.26 
 
 		 191 aa  377  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250107  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3700  XRE family transcriptional regulator  89.19 
 
 		 191 aa  345  2e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000696836  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0319  XRE family transcriptional regulator  87.7 
 
 		 191 aa  344  5e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000379854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0324  XRE family transcriptional regulator  88.65 
 
 		 191 aa  343  6e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000421536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2231  XRE family transcriptional regulator  54.89 
 
 		 187 aa  210  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000245077 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0134  hypothetical protein  54.35 
 
 		 191 aa  202  2e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1642  XRE family transcriptional regulator  55.38 
 
 		 186 aa  201  4e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.065261  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2039  DNA-binding protein  50.81 
 
 		 178 aa  197  7.999999999999999e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000824446  hitchhiker  5.01479e-19 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4589  transcriptional regulator, XRE family  51.7 
 
 		 188 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01392  predicted DNA-binding transcriptional regulator  50.27 
 
 		 178 aa  194  5.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2212  transcriptional regulator, XRE family  50.27 
 
 		 178 aa  194  5.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1740  DNA-binding protein  50.27 
 
 		 178 aa  194  5.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000189008  hitchhiker  2.35786e-17 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2225  XRE family transcriptional regulator  50.27 
 
 		 178 aa  194  5.000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.639128 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1517  DNA-binding protein  50.27 
 
 		 178 aa  194  5.000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1613  DNA-binding protein  50.27 
 
 		 178 aa  194  5.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01402  hypothetical protein  50.27 
 
 		 178 aa  194  5.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1982  XRE family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 175 aa  189  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.623481  normal  0.364753 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4268  transcriptional regulator, XRE family  50.56 
 
 		 188 aa  186  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1783  XRE family transcriptional regulator  47.31 
 
 		 178 aa  181  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1556  transcriptional regulator, XRE family  47.03 
 
 		 178 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1722  transcriptional regulator, XRE family  47.03 
 
 		 185 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.185673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1737  XRE family transcriptional regulator  47.03 
 
 		 185 aa  178  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1719  XRE family transcriptional regulator  46.49 
 
 		 178 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.499876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1555  transcriptional regulator  49.45 
 
 		 181 aa  174  7e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1663  DNA-binding protein  44.2 
 
 		 185 aa  167  7e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2484  XRE family transcriptional regulator  46.89 
 
 		 187 aa  159  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0499056 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03443  transcriptional regulator, HTH_3 family protein  48.37 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2279  DNA-binding protein  36.07 
 
 		 185 aa  122  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.268468  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2448  DNA-binding protein  36.07 
 
 		 185 aa  122  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.191992  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2463  DNA-binding protein  36.07 
 
 		 185 aa  122  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2542  DNA-binding protein  36.07 
 
 		 185 aa  122  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2197  transcriptional regulator  36.07 
 
 		 185 aa  121  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2239  transcriptional regulator  36.07 
 
 		 185 aa  121  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0224117  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2928  DNA-binding protein  34.97 
 
 		 185 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384603 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2346  transcriptional regulator  37.22 
 
 		 215 aa  119  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2254  XRE family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 185 aa  119  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575156  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2481  DNA-binding protein  35.52 
 
 		 185 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193646  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0929  XRE family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145461  normal  0.153472 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2877  transcriptional regulator, XRE family  36.57 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0662  XRE family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 259 aa  114  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1109  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 183 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0921  transcriptional regulator, XRE family  33.7 
 
 		 260 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0872  transcriptional regulator  33.7 
 
 		 192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.62802  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01840  transcriptional regulator, XRE family  33.88 
 
 		 182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2614  transcriptional regulator  37.57 
 
 		 248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0945  transcriptional regulator, XRE family  36.41 
 
 		 184 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000133489  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0917  transcriptional regulator, XRE family  35.06 
 
 		 192 aa  111  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4875  HTH-type transcriptional regulator  35.98 
 
 		 214 aa  107  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.256136  normal  0.0946557 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1096  helix-turn-helix domain-containing protein  32.43 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0850  XRE family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.406298  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3086  transcriptional regulator, putative  35.33 
 
 		 212 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0196484  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34730  XRE family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 193 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0210921  normal  0.262574 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4806  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.89 
 
 		 203 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1579  transcriptional regulator  31.89 
 
 		 182 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0004  DNA-binding cupin domain-containing protein  33.53 
 
 		 202 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02293  putative transcription regulator protein  35.54 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.40687 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1509  putative DNA-binding protein  33.53 
 
 		 202 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0004  DNA-binding protein  33.53 
 
 		 202 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.278794  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0004  DNA-binding protein  33.53 
 
 		 202 aa  102  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4931  transcriptional regulator, XRE family  34.66 
 
 		 187 aa  102  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7005  transcriptional regulator, XRE family  31.79 
 
 		 212 aa  101  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.89282 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0004  DNA-binding protein  32.95 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1150  DNA-binding protein  32.95 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129822  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4804  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  39.22 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1211  helix-turn-helix domain-containing protein  32.8 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0005  DNA-binding protein  32.95 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792058  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1430  DNA-binding protein  32.95 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4158  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 204 aa  99.4  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3771  transcriptional regulator, XRE family  31.22 
 
 		 198 aa  98.2  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.471902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0744  XRE family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 209 aa  98.2  6e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.541206  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4848  transcriptional regulator, XRE family  31.22 
 
 		 198 aa  98.2  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4631  DNA-binding protein  33.15 
 
 		 190 aa  98.2  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4400  DNA-binding protein  33.15 
 
 		 190 aa  98.2  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4240  DNA-binding protein  33.15 
 
 		 190 aa  98.2  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4252  DNA-binding protein  33.15 
 
 		 190 aa  98.2  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4633  DNA-binding protein  33.15 
 
 		 190 aa  98.2  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4740  DNA-binding protein  33.15 
 
 		 190 aa  98.2  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4617  DNA-binding protein  33.15 
 
 		 190 aa  98.2  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4333  XRE family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 190 aa  97.8  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5322  XRE family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 203 aa  97.1  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0622  DNA-binding protein  31.43 
 
 		 190 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.475485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3022  XRE family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 208 aa  97.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4613  DNA-binding protein  32 
 
 		 190 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3140  transcriptional regulator, XRE family  30.46 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4365  XRE family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 197 aa  96.3  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000321232  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3114  XRE family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 203 aa  95.5  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935644  normal  0.475898 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4971  XRE family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 203 aa  95.5  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110875  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3180  XRE family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 203 aa  94.4  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5700  XRE family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 203 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441066 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4537  XRE family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 203 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5159  XRE family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 203 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3063  transcriptional regulator, XRE family  30.34 
 
 		 201 aa  92.4  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4454  XRE family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 203 aa  90.5  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561636  normal  0.472987 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4983  transcriptional regulator, XRE family  29.94 
 
 		 209 aa  88.2  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0953387  normal  0.300371 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4967  transcriptional regulator, XRE family  28.73 
 
 		 218 aa  88.2  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454469  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1033  transcriptional regulator, XRE family  32.97 
 
 		 195 aa  87.8  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>