More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4589 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4589  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 188 aa  385  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4268  transcriptional regulator, XRE family  85.11 
 
 		 188 aa  317  7.999999999999999e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2231  XRE family transcriptional regulator  61.41 
 
 		 187 aa  234  6e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000245077 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2039  DNA-binding protein  55.74 
 
 		 178 aa  208  4e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000824446  hitchhiker  5.01479e-19 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01392  predicted DNA-binding transcriptional regulator  55.74 
 
 		 178 aa  207  5e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2212  transcriptional regulator, XRE family  55.74 
 
 		 178 aa  207  5e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1613  DNA-binding protein  55.74 
 
 		 178 aa  207  5e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1517  DNA-binding protein  55.74 
 
 		 178 aa  207  5e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2225  XRE family transcriptional regulator  55.74 
 
 		 178 aa  207  5e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.639128 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01402  hypothetical protein  55.74 
 
 		 178 aa  207  5e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1642  XRE family transcriptional regulator  56.91 
 
 		 186 aa  207  6e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.065261  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1740  DNA-binding protein  55.74 
 
 		 178 aa  207  8e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000189008  hitchhiker  2.35786e-17 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0134  hypothetical protein  51.89 
 
 		 191 aa  204  8e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0321  XRE family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 191 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250107  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1556  transcriptional regulator, XRE family  53.55 
 
 		 178 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0323  XRE family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 191 aa  195  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000737434  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1722  transcriptional regulator, XRE family  53.55 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.185673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0328  transcriptional regulator, XRE family  51.7 
 
 		 191 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000353964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0424  XRE family transcriptional regulator  51.7 
 
 		 188 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0327  XRE family transcriptional regulator  51.7 
 
 		 191 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000523898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1783  XRE family transcriptional regulator  53.01 
 
 		 178 aa  195  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0319  XRE family transcriptional regulator  52.84 
 
 		 191 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000379854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1719  XRE family transcriptional regulator  53.01 
 
 		 178 aa  194  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.499876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1982  XRE family transcriptional regulator  51.93 
 
 		 175 aa  193  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.623481  normal  0.364753 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3700  XRE family transcriptional regulator  52.84 
 
 		 191 aa  193  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000696836  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1737  XRE family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 185 aa  191  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0324  XRE family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 191 aa  191  5e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000421536  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1663  DNA-binding protein  43.09 
 
 		 185 aa  154  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2481  DNA-binding protein  38.8 
 
 		 185 aa  142  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2542  DNA-binding protein  39.34 
 
 		 185 aa  142  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2197  transcriptional regulator  39.56 
 
 		 185 aa  140  7e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2279  DNA-binding protein  39.56 
 
 		 185 aa  140  9e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.268468  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2448  DNA-binding protein  39.56 
 
 		 185 aa  140  9e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.191992  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2463  DNA-binding protein  39.56 
 
 		 185 aa  140  9e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2239  transcriptional regulator  39.01 
 
 		 185 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0224117  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2254  XRE family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 185 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575156  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2928  DNA-binding protein  37.16 
 
 		 185 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384603 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1555  transcriptional regulator  42.11 
 
 		 181 aa  133  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2484  XRE family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 187 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0499056 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01840  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 182 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03443  transcriptional regulator, HTH_3 family protein  41.44 
 
 		 208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2614  transcriptional regulator  37.16 
 
 		 248 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2346  transcriptional regulator  38.3 
 
 		 215 aa  123  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1109  XRE family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 183 aa  120  8e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3086  transcriptional regulator, putative  38.3 
 
 		 212 aa  118  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0196484  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0929  XRE family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 224 aa  117  7e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145461  normal  0.153472 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0917  transcriptional regulator, XRE family  34.97 
 
 		 192 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0921  transcriptional regulator, XRE family  34.97 
 
 		 260 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1211  helix-turn-helix domain-containing protein  33.9 
 
 		 200 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0850  XRE family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 182 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.406298  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0744  XRE family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 209 aa  114  6e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.541206  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0872  transcriptional regulator  34.43 
 
 		 192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.62802  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1579  transcriptional regulator  31.87 
 
 		 182 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0945  transcriptional regulator, XRE family  32.99 
 
 		 184 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000133489  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1096  helix-turn-helix domain-containing protein  32.04 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2877  transcriptional regulator, XRE family  36.26 
 
 		 207 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0662  XRE family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 259 aa  106  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34730  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0210921  normal  0.262574 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4333  XRE family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 190 aa  101  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4240  DNA-binding protein  30.98 
 
 		 190 aa  99.4  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4252  DNA-binding protein  30.98 
 
 		 190 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4400  DNA-binding protein  30.98 
 
 		 190 aa  99.4  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4617  DNA-binding protein  30.98 
 
 		 190 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4740  DNA-binding protein  30.98 
 
 		 190 aa  99.4  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4631  DNA-binding protein  30.43 
 
 		 190 aa  98.2  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4633  DNA-binding protein  30.43 
 
 		 190 aa  98.2  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5472  putative transcriptional regulator, XRE family  34.05 
 
 		 198 aa  97.8  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0377247 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4613  DNA-binding protein  30.05 
 
 		 190 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0622  DNA-binding protein  29.51 
 
 		 190 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.475485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2085  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 207 aa  92.4  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0634  XRE family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 229 aa  92  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3325  transcriptional regulator, XRE family  35.75 
 
 		 229 aa  92.4  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.610712  normal  0.167348 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4522  transcriptional regulator, XRE family  31.69 
 
 		 188 aa  92  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0681879  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2054  transcriptional regulator, XRE family  32.32 
 
 		 186 aa  91.3  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.388224 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5267  transcriptional regulator, XRE family  31.46 
 
 		 190 aa  89.4  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.782951 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2770  XRE family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 192 aa  89.4  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169539 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1265  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  89.4  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.509144  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1033  transcriptional regulator, XRE family  32.64 
 
 		 195 aa  89  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4806  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.41 
 
 		 203 aa  88.6  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1354  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 190 aa  88.6  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0758784  decreased coverage  0.00460659 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4875  HTH-type transcriptional regulator  31.93 
 
 		 214 aa  88.2  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.256136  normal  0.0946557 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0594  DNA-binding protein  33.52 
 
 		 219 aa  87.4  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0893  DNA-binding protein  33.52 
 
 		 222 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3726  transcriptional regulator, XRE family  30.43 
 
 		 195 aa  86.3  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0004  DNA-binding protein  31.58 
 
 		 202 aa  86.3  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0714  DNA-binding protein  33.52 
 
 		 222 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0728  DNA-binding protein  33.52 
 
 		 222 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02293  putative transcription regulator protein  32.11 
 
 		 182 aa  86.3  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.40687 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0229  DNA-binding protein  33.52 
 
 		 222 aa  85.9  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4931  transcriptional regulator, XRE family  33.15 
 
 		 187 aa  85.9  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3140  transcriptional regulator, XRE family  27.68 
 
 		 206 aa  85.9  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2441  DNA-binding protein  33.52 
 
 		 222 aa  85.9  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4967  transcriptional regulator, XRE family  30.81 
 
 		 218 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454469  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2717  DNA-binding protein  33.52 
 
 		 222 aa  85.9  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7005  transcriptional regulator, XRE family  29.82 
 
 		 212 aa  85.9  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.89282 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2361  DNA-binding protein  33.52 
 
 		 222 aa  85.9  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5322  XRE family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 203 aa  85.9  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4971  XRE family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 203 aa  85.9  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110875  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3114  XRE family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 203 aa  85.9  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935644  normal  0.475898 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4365  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 197 aa  85.5  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000321232  normal  0.264561 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>