More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1265 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1265  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 203 aa  386  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.509144  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5929  XRE family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 202 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.828276  normal  0.0967353 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5143  putative transcriptional regulator, XRE family  46.2 
 
 		 192 aa  152  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0117731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3551  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 196 aa  118  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4829  cupin 2 domain-containing protein  41.43 
 
 		 182 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0191257  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4257  transcriptional regulator, XRE family  37.08 
 
 		 189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0127  transcriptional regulator, XRE family  40.76 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116873  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4522  transcriptional regulator, XRE family  36.52 
 
 		 188 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0681879  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2039  transcriptional regulator, XRE family  39.23 
 
 		 187 aa  105  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2614  transcriptional regulator  37.7 
 
 		 248 aa  104  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3471  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 197 aa  103  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1033  transcriptional regulator, XRE family  36.72 
 
 		 195 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4768  XRE family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 193 aa  101  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.2486  normal  0.289686 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3132  putative transcription regulator protein  38.55 
 
 		 209 aa  101  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.25062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1123  XRE family transcriptional regulator  37 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0106313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0929  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145461  normal  0.153472 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1088  transcriptional regulator  32 
 
 		 183 aa  99.8  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0981  DNA-binding protein  32 
 
 		 183 aa  99.8  3e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1147  XRE family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 206 aa  99.4  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0668  XRE family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 206 aa  99.4  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2158  XRE family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 224 aa  98.2  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00315318  normal  0.41098 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2346  transcriptional regulator  34.97 
 
 		 215 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4259  XRE family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 206 aa  97.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.655976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2085  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 207 aa  97.4  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3726  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 195 aa  97.8  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4448  XRE family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 193 aa  96.7  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0311191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1029  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 219 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.289543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2877  transcriptional regulator, XRE family  35.42 
 
 		 207 aa  95.1  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0872  transcriptional regulator  35.52 
 
 		 192 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.62802  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1025  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 219 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.976587  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2075  helix-turn-helix domain protein  34.05 
 
 		 196 aa  94  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241547  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0921  transcriptional regulator, XRE family  34.97 
 
 		 260 aa  92.8  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5130  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.15 
 
 		 188 aa  92.4  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.87177  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34730  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 193 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0210921  normal  0.262574 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5472  putative transcriptional regulator, XRE family  33.68 
 
 		 198 aa  92  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0377247 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2770  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 192 aa  92  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169539 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0917  transcriptional regulator, XRE family  34.97 
 
 		 192 aa  91.3  8e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3563  transcriptional regulator, XRE family  34.44 
 
 		 189 aa  91.3  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0662  XRE family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 259 aa  90.9  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 178 aa  90.9  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0004  DNA-binding protein  33.15 
 
 		 202 aa  90.5  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4589  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 188 aa  91.3  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3403  putative transcriptional regulator  38.42 
 
 		 183 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0004  DNA-binding cupin domain-containing protein  33.15 
 
 		 202 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3086  transcriptional regulator, putative  32.81 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0196484  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0004  DNA-binding protein  33.15 
 
 		 202 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.278794  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0004  DNA-binding protein  33.15 
 
 		 202 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1509  putative DNA-binding protein  33.15 
 
 		 202 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1457  transcriptional regulator  29.61 
 
 		 188 aa  90.5  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.96188e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0005  DNA-binding protein  33.15 
 
 		 202 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792058  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1150  DNA-binding protein  33.15 
 
 		 202 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129822  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1430  DNA-binding protein  33.15 
 
 		 202 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4806  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.78 
 
 		 203 aa  90.1  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6405  XRE family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 189 aa  89.4  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146143  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  32.2 
 
 		 192 aa  89.7  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3140  transcriptional regulator, XRE family  36.31 
 
 		 206 aa  89.4  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0115  transcriptional regulatory protein  34.07 
 
 		 194 aa  89  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 176 aa  88.2  8e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7005  transcriptional regulator, XRE family  33.15 
 
 		 212 aa  88.2  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.89282 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  31.46 
 
 		 188 aa  88.2  8e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4478  transcriptional regulator  31.15 
 
 		 188 aa  87.8  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2924  XRE family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 204 aa  87.8  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.705469  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2239  transcriptional regulator  31.36 
 
 		 185 aa  87.8  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0224117  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1454  XRE family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 189 aa  87.8  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4158  XRE family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 204 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40150  putative transcriptional regulator  37.29 
 
 		 183 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2254  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 185 aa  86.7  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575156  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2197  transcriptional regulator  31.95 
 
 		 185 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26325  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0327  XRE family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 191 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000523898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0328  transcriptional regulator, XRE family  29.19 
 
 		 191 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000353964  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2279  DNA-binding protein  31.36 
 
 		 185 aa  86.3  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.268468  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5322  XRE family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 203 aa  86.3  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2928  DNA-binding protein  30.18 
 
 		 185 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384603 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2463  DNA-binding protein  31.36 
 
 		 185 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2448  DNA-binding protein  31.36 
 
 		 185 aa  86.3  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.191992  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0321  XRE family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 191 aa  85.9  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250107  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0556  MerR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 189 aa  85.9  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4365  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 197 aa  85.5  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000321232  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3046  transcriptional regulator  33.51 
 
 		 201 aa  85.9  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4971  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 203 aa  85.9  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110875  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3114  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 203 aa  85.5  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935644  normal  0.475898 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3022  XRE family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 208 aa  85.5  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  30.27 
 
 		 201 aa  85.5  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1737  XRE family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 185 aa  85.1  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0379  transcriptional regulator  28.48 
 
 		 184 aa  85.1  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.808324 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1655  helix-turn-helix domain protein  34.83 
 
 		 194 aa  84.7  9e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000652652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0323  XRE family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 191 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000737434  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2210  transcriptional regulator, XRE family  36.31 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949814  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0424  XRE family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 188 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  34.44 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_003296  RS04780  putative transcription regulator protein  30.86 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05657  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  30.86 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01392  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.73 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2212  transcriptional regulator, XRE family  28.73 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01402  hypothetical protein  28.73 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2481  DNA-binding protein  31.36 
 
 		 185 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193646  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1517  DNA-binding protein  28.73 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2542  DNA-binding protein  30.77 
 
 		 185 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2225  XRE family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.639128 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>