More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4829 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4829  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 182 aa  360  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0191257  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5929  XRE family transcriptional regulator  68.56 
 
 		 202 aa  241  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.828276  normal  0.0967353 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5143  putative transcriptional regulator, XRE family  43.24 
 
 		 192 aa  121  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0117731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1265  XRE family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 203 aa  106  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.509144  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5130  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  35.97 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.87177  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3471  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4257  transcriptional regulator, XRE family  31.69 
 
 		 189 aa  74.7  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5472  putative transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0377247 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2039  transcriptional regulator, XRE family  37.59 
 
 		 187 aa  72  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3132  putative transcription regulator protein  31.5 
 
 		 209 aa  71.2  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.25062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0115  transcriptional regulatory protein  32.89 
 
 		 194 aa  71.2  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1029  XRE family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.289543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1025  XRE family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.976587  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4522  transcriptional regulator, XRE family  30.99 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0681879  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1428  DNA-binding protein  34.48 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0981  DNA-binding protein  27.46 
 
 		 183 aa  67  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1088  transcriptional regulator  27.46 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  28.25 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2158  XRE family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00315318  normal  0.41098 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4259  XRE family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.655976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3563  transcriptional regulator, XRE family  28.09 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0668  XRE family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1147  XRE family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1123  XRE family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0106313  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0099  transcriptional regulator, XRE family  30.56 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2019  DNA-binding protein  34.06 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.649802  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1881  DNA-binding protein  34.06 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3191  DNA-binding protein  34.06 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.479355  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3726  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0127  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116873  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40150  putative transcriptional regulator  34.53 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4917  XRE family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 184 aa  64.3  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0895  DNA-binding protein  34.06 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.955987  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3174  DNA-binding protein  34.06 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9176  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4180  XRE family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3137  DNA-binding protein  34.06 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2728  DNA-binding protein  34.06 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2921  XRE family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.899455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3003  XRE family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4768  XRE family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.2486  normal  0.289686 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3100  XRE family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.510523  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1265  transcriptional regulator, putative  36.9 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3403  putative transcriptional regulator  33.81 
 
 		 183 aa  62  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1454  XRE family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3867  XRE family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 201 aa  62  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69980  putative transcriptional regulator  31.3 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2103  XRE family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1091  XRE family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.158888  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  32.65 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1163  cupin 2 domain-containing protein  33.64 
 
 		 182 aa  61.2  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.967119  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1195  XRE family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 182 aa  61.2  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1354  XRE family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 190 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0758784  decreased coverage  0.00460659 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3195  transcriptional regulator, XRE family  33.64 
 
 		 182 aa  61.2  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0639399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1104  cupin 2 domain-containing protein  33.64 
 
 		 182 aa  61.2  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.183758  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1058  XRE family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2646  XRE family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 182 aa  61.2  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.73 
 
 		 189 aa  60.8  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3049  XRE family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0258201 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2416  XRE family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6075  putative transcriptional regulator  30.53 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3030  XRE family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0248  XRE family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16550  predicted transcriptional regulator  32.34 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2714  XRE family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1655  helix-turn-helix domain protein  29.5 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000652652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2210  transcriptional regulator, XRE family  32.39 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949814  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3114  XRE family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935644  normal  0.475898 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4971  XRE family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110875  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5267  transcriptional regulator, XRE family  29.41 
 
 		 190 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.782951 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1128  XRE family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0842  cupin 2 domain-containing protein  32.16 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2919  transcriptional regulator, XRE family  24.64 
 
 		 170 aa  57.4  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4806  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.37 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1306  transcriptional regulator, XRE family  24.64 
 
 		 170 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000237827 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1033  transcriptional regulator, XRE family  30.73 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0202  XRE family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.614203  hitchhiker  0.00167713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5123  hypothetical protein  25.27 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.635702  normal  0.639471 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5523  transcriptional regulator  38.04 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3075  XRE family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 269 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2941  XRE family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0631546  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0238  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  32 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2346  transcriptional regulator  30.56 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2085  XRE family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5322  XRE family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6377  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3025  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 281 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.925102 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3771  transcriptional regulator, XRE family  28.67 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.471902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4848  transcriptional regulator, XRE family  28.67 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1457  transcriptional regulator  28.85 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.96188e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1721  XRE family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2877  transcriptional regulator, XRE family  30.71 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7005  transcriptional regulator, XRE family  28.87 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.89282 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>