More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3049 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_3049  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
259 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0258201 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2416  XRE family transcriptional regulator  99.61 
 
 
259 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3030  XRE family transcriptional regulator  99.61 
 
 
259 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6377  XRE family transcriptional regulator  84.96 
 
 
286 aa  394  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3075  XRE family transcriptional regulator  78.41 
 
 
269 aa  391  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2941  XRE family transcriptional regulator  76.86 
 
 
271 aa  377  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0631546  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3025  XRE family transcriptional regulator  85.43 
 
 
281 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.925102 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0698  DNA-binding protein  65.06 
 
 
247 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0375351  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2423  DNA-binding protein  65.06 
 
 
247 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1732  DNA-binding protein  65.06 
 
 
247 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1146  DNA-binding protein  65.06 
 
 
247 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112687  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1221  DNA-binding protein  65.06 
 
 
247 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0563936  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1575  DNA-binding protein  64.41 
 
 
249 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1565  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0768  DNA-binding protein  65.89 
 
 
242 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377611  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5113  putative transcriptional regulator  55.31 
 
 
187 aa  214  8e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58380  putative transcriptional regulator  55.31 
 
 
187 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0842  cupin 2 domain-containing protein  56.98 
 
 
188 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2714  XRE family transcriptional regulator  35.16 
 
 
204 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  36.87 
 
 
191 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2046  XRE family transcriptional regulator  33.15 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298774  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  35.2 
 
 
189 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  35.75 
 
 
179 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  35.75 
 
 
179 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  35.75 
 
 
179 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  35.75 
 
 
179 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  35.75 
 
 
179 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  35.75 
 
 
179 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  36.16 
 
 
193 aa  106  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  36.31 
 
 
190 aa  106  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 
191 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 
191 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 
191 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  35.59 
 
 
236 aa  105  9e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4729  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 
192 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5317  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 
192 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221767  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 
192 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  35.59 
 
 
236 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  35.2 
 
 
190 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  35.03 
 
 
193 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  34.07 
 
 
192 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  34.07 
 
 
192 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  34.46 
 
 
191 aa  102  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  33.52 
 
 
191 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0751  XRE family transcriptional regulator  34.07 
 
 
179 aa  98.2  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000101746  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1721  XRE family transcriptional regulator  32.4 
 
 
201 aa  91.7  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2540  Cro/CI family transcriptional regulator  31.11 
 
 
181 aa  89  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4678  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
276 aa  87.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.825044  normal  0.111013 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  29.78 
 
 
180 aa  85.5  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  33.88 
 
 
192 aa  85.5  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3867  XRE family transcriptional regulator  29.51 
 
 
201 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
178 aa  84.3  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2821  XRE family transcriptional regulator  29.63 
 
 
199 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2868  Cro/CI family transcriptional regulator  29.63 
 
 
199 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1941  transcriptional regulator  32.76 
 
 
225 aa  82.4  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0750  transcriptional regulator, XRE family  32.42 
 
 
181 aa  82.4  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0884701 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2913  XRE family transcriptional regulator  29.1 
 
 
199 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
292 aa  82  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0901  XRE family transcriptional regulator  29.44 
 
 
181 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000108423 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0230  transcriptional regulator  33.33 
 
 
197 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0898  XRE family transcriptional regulator  29.67 
 
 
179 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1871  putative HTH-type transcriptional regulator  31.52 
 
 
215 aa  81.6  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0589891  normal  0.573197 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1034  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 
181 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000342515  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1139  transcriptional regulator  28.89 
 
 
232 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  0.0958639 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  34.64 
 
 
201 aa  80.5  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3684  transcriptional regulator, XRE family  30.65 
 
 
180 aa  78.6  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000437538  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65950  putative transcriptional regulator  29.73 
 
 
199 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2946  transcriptional regulator  31.25 
 
 
197 aa  77.4  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2094  transcriptional regulator Cro/CI family protein  27.87 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1668  transcriptional regulator, XRE family  31.94 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0641  XRE family transcriptional regulator  31.02 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199173  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2294  XRE family transcriptional regulator  31.02 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7693  transcriptional regulator MerR family  31.69 
 
 
271 aa  76.6  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0980  XRE family transcriptional regulator  29.05 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000294477  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4838  transcriptional regulator, XRE family  28.96 
 
 
193 aa  75.9  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0168811  hitchhiker  0.0000750229 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3096  transcriptional regulator, XRE family  29.94 
 
 
192 aa  76.3  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00124629  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1035  transcriptional regulator, XRE family  26.44 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000017846  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0715  transcriptional regulator, XRE family  32.4 
 
 
187 aa  75.9  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.39864  normal  0.0327391 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3301  XRE family transcriptional regulator  32.43 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5722  putative transcriptional regulator  26.8 
 
 
199 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  29.48 
 
 
176 aa  75.1  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5748  transcriptional regulator  31.67 
 
 
219 aa  75.1  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  32.02 
 
 
211 aa  74.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  28.57 
 
 
188 aa  73.6  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  31.67 
 
 
181 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2948  transcriptional regulator, XRE family  30.3 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211039  hitchhiker  0.000112709 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0869  XRE family transcriptional regulator  28.04 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3652  XRE family transcriptional regulator  30.34 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00533728 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  31.67 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3035  XRE family transcriptional regulator  27.84 
 
 
208 aa  72  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.348685 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4811  XRE family transcriptional regulator  29.61 
 
 
201 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213383 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4694  XRE family transcriptional regulator  31.28 
 
 
224 aa  72  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.607677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5265  XRE family transcriptional regulator  29.83 
 
 
219 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4986  XRE family transcriptional regulator  29.83 
 
 
219 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4897  XRE family transcriptional regulator  29.83 
 
 
219 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  31.11 
 
 
181 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2327  transcriptional regulator, XRE family  27.32 
 
 
189 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0551  transcriptional regulator, XRE family  28.41 
 
 
198 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  31.11 
 
 
181 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6574  transcriptional regulator, XRE family  29.63 
 
 
227 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0448941 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2242  helix-turn-helix domain-containing protein  27.27 
 
 
201 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.453871 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>