More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5123 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5123  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  398  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.635702  normal  0.639471 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0332  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 
201 aa  166  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.865127  normal  0.108372 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4931  transcriptional regulator, XRE family  41.85 
 
 
187 aa  140  9e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3529  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 
200 aa  130  9e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.295271 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5072  transcriptional regulator, XRE family  39.43 
 
 
207 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1787  Cro/CI family transcriptional regulator  36.57 
 
 
200 aa  128  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0263563  normal  0.220225 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1789  transcriptional regulator, Cro/CI family  36 
 
 
200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.225 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1668  Cro/CI family transcriptional regulator  36 
 
 
200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.118403 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1487  transcriptional regulator, Cro/CI family  36 
 
 
200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.335106  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1849  Cro/CI family transcriptional regulator  36 
 
 
200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04780  putative transcription regulator protein  36.81 
 
 
205 aa  123  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05657  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  36.81 
 
 
205 aa  123  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2770  XRE family transcriptional regulator  34.76 
 
 
192 aa  119  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.169539 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46710  putative transcriptional regulator  39.67 
 
 
216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0037508  decreased coverage  0.000000167672 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4024  putative transcriptional regulator  38.59 
 
 
195 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2232  Cro/CI family transcriptional regulator  36.46 
 
 
177 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0197  XRE family transcriptional regulator  39.46 
 
 
190 aa  106  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0555347  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3508  XRE family transcriptional regulator  35.52 
 
 
187 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0510026 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3441  XRE family transcriptional regulator  35.88 
 
 
187 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.404086 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3308  transcriptional regulator  34.97 
 
 
187 aa  103  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.38656  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1855  XRE family transcriptional regulator  34.81 
 
 
177 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.21785 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1816  XRE family transcriptional regulator  35.52 
 
 
191 aa  96.3  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00473491  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1211  helix-turn-helix domain-containing protein  27.68 
 
 
200 aa  94.4  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0678  transcriptional regulator, XRE family  33.7 
 
 
188 aa  94.4  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0850  XRE family transcriptional regulator  25.57 
 
 
182 aa  89.4  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.406298  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02293  putative transcription regulator protein  34.3 
 
 
182 aa  88.6  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.40687 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1109  XRE family transcriptional regulator  27.37 
 
 
183 aa  86.7  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0744  XRE family transcriptional regulator  24.86 
 
 
209 aa  86.3  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.541206  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1096  helix-turn-helix domain-containing protein  25.42 
 
 
182 aa  85.5  5e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1579  transcriptional regulator  24.43 
 
 
182 aa  84  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4804  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  32.53 
 
 
198 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4806  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.22 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1783  XRE family transcriptional regulator  30.43 
 
 
178 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1556  transcriptional regulator, XRE family  30.22 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3250  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  36.09 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.653673  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1722  transcriptional regulator, XRE family  30.22 
 
 
185 aa  82.4  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.185673  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2542  DNA-binding protein  27.32 
 
 
185 aa  82  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2487  XRE family transcriptional regulator  29.07 
 
 
189 aa  81.6  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3725  DNA-binding protein  30.29 
 
 
258 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2075  helix-turn-helix domain protein  27.87 
 
 
196 aa  81.3  0.000000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241547  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3469  DNA-binding protein  32.43 
 
 
189 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.162788  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2484  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 
187 aa  81.3  0.000000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0499056 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15000  predicted transcriptional regulator  29.12 
 
 
184 aa  80.9  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.904149  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2254  XRE family transcriptional regulator  25.68 
 
 
185 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575156  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1737  XRE family transcriptional regulator  29.67 
 
 
185 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2928  DNA-binding protein  27.17 
 
 
185 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00384603 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4229  hypothetical protein  30.51 
 
 
652 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.60873 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2481  DNA-binding protein  26.11 
 
 
185 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193646  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1719  XRE family transcriptional regulator  29.67 
 
 
178 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.499876  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2197  transcriptional regulator  28.02 
 
 
185 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26325  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3188  XRE family transcriptional regulator  35.67 
 
 
189 aa  79.3  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.549125 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3063  transcriptional regulator, XRE family  30.9 
 
 
201 aa  79  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2279  DNA-binding protein  27.47 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.268468  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2239  transcriptional regulator  26.14 
 
 
185 aa  79  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0224117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2448  DNA-binding protein  27.47 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.191992  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2463  DNA-binding protein  27.47 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3484  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 
200 aa  78.6  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4544  transcriptional regulator, XRE family  34.9 
 
 
215 aa  78.6  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.796901 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3551  transcriptional regulator, XRE family  34.25 
 
 
196 aa  77.8  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0945  transcriptional regulator, XRE family  28.42 
 
 
184 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000133489  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  29.31 
 
 
201 aa  77.4  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2039  DNA-binding protein  27.47 
 
 
178 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000824446  hitchhiker  5.01479e-19 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0319  XRE family transcriptional regulator  29.52 
 
 
191 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000379854  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4773  transcriptional regulator, XRE family  28.33 
 
 
187 aa  75.9  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0282623  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2054  transcriptional regulator, XRE family  27.87 
 
 
186 aa  76.3  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.388224 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03443  transcriptional regulator, HTH_3 family protein  25.93 
 
 
208 aa  75.5  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  28.74 
 
 
199 aa  75.9  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0321  XRE family transcriptional regulator  25.68 
 
 
191 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250107  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  32.11 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0327  XRE family transcriptional regulator  25.53 
 
 
191 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000523898  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0328  transcriptional regulator, XRE family  25.68 
 
 
191 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000353964  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0324  XRE family transcriptional regulator  27.37 
 
 
191 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000421536  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0450  XRE family transcriptional regulator  28.25 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1740  DNA-binding protein  26.82 
 
 
178 aa  75.1  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000189008  hitchhiker  2.35786e-17 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4365  XRE family transcriptional regulator  29.21 
 
 
197 aa  75.1  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000321232  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3700  XRE family transcriptional regulator  28.92 
 
 
191 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000696836  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_004310  BR1852  Cro/CI family transcriptional regulator  32.18 
 
 
642 aa  74.7  0.0000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01392  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.26 
 
 
178 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2212  transcriptional regulator, XRE family  26.26 
 
 
178 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4079  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 
182 aa  73.9  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0929  XRE family transcriptional regulator  28.98 
 
 
224 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145461  normal  0.153472 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0323  XRE family transcriptional regulator  25 
 
 
191 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000737434  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1509  putative DNA-binding protein  30.77 
 
 
202 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3771  transcriptional regulator, XRE family  29.44 
 
 
198 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.471902  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1517  DNA-binding protein  26.26 
 
 
178 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0004  DNA-binding protein  30.77 
 
 
202 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.278794  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16550  predicted transcriptional regulator  33.54 
 
 
204 aa  73.9  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4032  transcriptional regulator, XRE family  30.11 
 
 
187 aa  74.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.45676  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0872  transcriptional regulator  28.41 
 
 
192 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.62802  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01402  hypothetical protein  26.26 
 
 
178 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2225  XRE family transcriptional regulator  26.26 
 
 
178 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.639128 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4848  transcriptional regulator, XRE family  29.44 
 
 
198 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0004  DNA-binding cupin domain-containing protein  30.77 
 
 
202 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1613  DNA-binding protein  26.26 
 
 
178 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0004  DNA-binding protein  30.77 
 
 
202 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4325  XRE family transcriptional regulator  28.49 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.735671  normal  0.293625 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2231  XRE family transcriptional regulator  26.82 
 
 
187 aa  73.2  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000245077 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1430  DNA-binding protein  30.77 
 
 
202 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4437  XRE family transcriptional regulator  28.49 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4371  XRE family transcriptional regulator  28.49 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>