More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0197 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0197  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 190 aa  386  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0555347  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46710  putative transcriptional regulator  63.49 
 
 		 216 aa  226  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0037508  decreased coverage  0.000000167672 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4024  putative transcriptional regulator  62.96 
 
 		 195 aa  224  6e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3508  XRE family transcriptional regulator  56.76 
 
 		 187 aa  204  5e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0510026 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3441  XRE family transcriptional regulator  54.84 
 
 		 187 aa  202  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.404086 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2232  Cro/CI family transcriptional regulator  56 
 
 		 177 aa  197  7e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1855  XRE family transcriptional regulator  55.68 
 
 		 177 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21785 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3250  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  55.32 
 
 		 189 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.653673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3308  transcriptional regulator  53.76 
 
 		 187 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.38656  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3469  DNA-binding protein  54.79 
 
 		 189 aa  192  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.162788  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3188  XRE family transcriptional regulator  53.44 
 
 		 189 aa  179  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.549125 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1816  XRE family transcriptional regulator  51.05 
 
 		 191 aa  168  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00473491  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2770  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 192 aa  111  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5123  hypothetical protein  39.46 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.635702  normal  0.639471 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4931  transcriptional regulator, XRE family  41.57 
 
 		 187 aa  105  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3529  XRE family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 200 aa  97.4  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.295271 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5072  transcriptional regulator, XRE family  37.02 
 
 		 207 aa  94.4  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04780  putative transcription regulator protein  36.57 
 
 		 205 aa  91.7  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05657  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  36.57 
 
 		 205 aa  91.7  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05910  predicted transcriptional regulator  35.87 
 
 		 190 aa  87.4  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.848221  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1849  Cro/CI family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1487  transcriptional regulator, Cro/CI family  33.71 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.335106  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1668  Cro/CI family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.118403 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1789  transcriptional regulator, Cro/CI family  33.71 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.225 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1787  Cro/CI family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0263563  normal  0.220225 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2254  XRE family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575156  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0678  transcriptional regulator, XRE family  34.91 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4773  transcriptional regulator, XRE family  32.57 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0282623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0929  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145461  normal  0.153472 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1579  transcriptional regulator  28.48 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0632  DNA-binding protein  29.81 
 
 		 181 aa  72  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15000  predicted transcriptional regulator  32.73 
 
 		 184 aa  72  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.904149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2484  XRE family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 187 aa  72  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0499056 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01840  transcriptional regulator, XRE family  28.98 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0850  XRE family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.406298  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0945  transcriptional regulator, XRE family  27.33 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000133489  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4320  XRE family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.810122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2928  DNA-binding protein  25 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384603 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2481  DNA-binding protein  27.17 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193646  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3286  DNA-binding protein  28.07 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2054  transcriptional regulator, XRE family  31.03 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.388224 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2346  transcriptional regulator  31.87 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1109  XRE family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2542  DNA-binding protein  25.77 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3942  transcriptional regulator, XRE family  41.53 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4537  XRE family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5159  XRE family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5700  XRE family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441066 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2279  DNA-binding protein  25 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.268468  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2463  DNA-binding protein  25 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2197  transcriptional regulator  25 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2448  DNA-binding protein  25 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.191992  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3725  DNA-binding protein  35.62 
 
 		 258 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2239  transcriptional regulator  25 
 
 		 185 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0224117  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0389  XRE family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.762812  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2075  helix-turn-helix domain protein  30.06 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241547  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0332  transcriptional regulator, XRE family  30.9 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.865127  normal  0.108372 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1096  helix-turn-helix domain-containing protein  27.27 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2039  DNA-binding protein  30.59 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000824446  hitchhiker  5.01479e-19 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3180  XRE family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16550  predicted transcriptional regulator  31.32 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0831  XRE family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 183 aa  67  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000078794  normal  0.173113 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1459  helix-turn-helix domain protein  33.54 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2877  transcriptional regulator, XRE family  31.07 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2614  transcriptional regulator  32.56 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1556  transcriptional regulator, XRE family  30.22 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5322  XRE family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4848  transcriptional regulator, XRE family  30.95 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3771  transcriptional regulator, XRE family  30.95 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.471902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1783  XRE family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5317  XRE family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221767  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4729  XRE family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4079  XRE family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1737  XRE family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1722  transcriptional regulator, XRE family  30.22 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.185673  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3086  transcriptional regulator, putative  33.33 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0196484  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0099  transcriptional regulator, XRE family  30.56 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0872  transcriptional regulator  31.14 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.62802  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4158  XRE family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7005  transcriptional regulator, XRE family  27.12 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.89282 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3114  XRE family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935644  normal  0.475898 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2487  XRE family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3022  XRE family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2921  XRE family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.899455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3003  XRE family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3100  XRE family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.510523  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01392  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2212  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3184  transcriptional regulator, XRE family  32.1 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2225  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.639128 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1517  DNA-binding protein  30 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01402  hypothetical protein  30 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1613  DNA-binding protein  30 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5929  XRE family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.828276  normal  0.0967353 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1719  XRE family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.499876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4971  XRE family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110875  normal  0.347082 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>