More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C1849 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C1849  Cro/CI family transcriptional regulator  100 
 
 
200 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1668  Cro/CI family transcriptional regulator  99.5 
 
 
200 aa  414  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.118403 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1789  transcriptional regulator, Cro/CI family  99.5 
 
 
200 aa  414  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.225 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1487  transcriptional regulator, Cro/CI family  99 
 
 
200 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.335106  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1787  Cro/CI family transcriptional regulator  99 
 
 
200 aa  410  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0263563  normal  0.220225 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3529  XRE family transcriptional regulator  63 
 
 
200 aa  263  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.295271 
 
 
-
 
NC_003296  RS04780  putative transcription regulator protein  62 
 
 
205 aa  261  6.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05657  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  62 
 
 
205 aa  261  6.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5072  transcriptional regulator, XRE family  53 
 
 
207 aa  201  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2770  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 
192 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.169539 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4931  transcriptional regulator, XRE family  41.21 
 
 
187 aa  149  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5123  hypothetical protein  36 
 
 
198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.635702  normal  0.639471 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0332  transcriptional regulator, XRE family  29.73 
 
 
201 aa  99.8  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.865127  normal  0.108372 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2075  helix-turn-helix domain protein  30.77 
 
 
196 aa  97.4  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241547  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4024  putative transcriptional regulator  37.91 
 
 
195 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46710  putative transcriptional regulator  37.36 
 
 
216 aa  94  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0037508  decreased coverage  0.000000167672 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2346  transcriptional regulator  29.59 
 
 
215 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0632  DNA-binding protein  30.91 
 
 
181 aa  87.4  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404047  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34730  XRE family transcriptional regulator  30.6 
 
 
193 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0210921  normal  0.262574 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4848  transcriptional regulator, XRE family  32.93 
 
 
198 aa  85.5  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0872  transcriptional regulator  29.03 
 
 
192 aa  85.5  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.62802  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4320  XRE family transcriptional regulator  30.91 
 
 
181 aa  85.5  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.810122  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3771  transcriptional regulator, XRE family  32.93 
 
 
198 aa  85.5  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.471902  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3308  transcriptional regulator  30.94 
 
 
187 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.38656  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0929  XRE family transcriptional regulator  27.93 
 
 
224 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145461  normal  0.153472 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0197  XRE family transcriptional regulator  33.71 
 
 
190 aa  83.6  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0555347  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0921  transcriptional regulator, XRE family  28.49 
 
 
260 aa  82.8  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3441  XRE family transcriptional regulator  31.79 
 
 
187 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.404086 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0917  transcriptional regulator, XRE family  28.49 
 
 
192 aa  82  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4806  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.69 
 
 
203 aa  81.3  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0714  DNA-binding protein  32.95 
 
 
222 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0893  DNA-binding protein  32.95 
 
 
222 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0728  DNA-binding protein  32.95 
 
 
222 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6018  XRE family transcriptional regulator  32.45 
 
 
233 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0945  transcriptional regulator, XRE family  27.78 
 
 
184 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000133489  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0594  DNA-binding protein  32.95 
 
 
219 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02293  putative transcription regulator protein  31.48 
 
 
182 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.40687 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3086  transcriptional regulator, putative  31.22 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0196484  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2690  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 
228 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1816  XRE family transcriptional regulator  29.94 
 
 
191 aa  80.1  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00473491  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2718  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 
228 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2078  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 
228 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1211  helix-turn-helix domain-containing protein  27.01 
 
 
200 aa  80.1  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2441  DNA-binding protein  31.72 
 
 
222 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0229  DNA-binding protein  31.72 
 
 
222 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3250  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  31.07 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.653673  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0850  XRE family transcriptional regulator  26.52 
 
 
182 aa  79.7  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.406298  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2717  DNA-binding protein  31.72 
 
 
222 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1855  XRE family transcriptional regulator  32.95 
 
 
177 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.21785 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0416  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 
229 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.387969 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2361  DNA-binding protein  31.72 
 
 
222 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4259  XRE family transcriptional regulator  28 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.655976  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1109  XRE family transcriptional regulator  30.36 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7005  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 
212 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.89282 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4158  XRE family transcriptional regulator  30.32 
 
 
204 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2254  XRE family transcriptional regulator  27.27 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575156  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2607  XRE family transcriptional regulator  32.04 
 
 
227 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3325  transcriptional regulator, XRE family  29.85 
 
 
229 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.610712  normal  0.167348 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2743  XRE family transcriptional regulator  32.04 
 
 
227 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0634  XRE family transcriptional regulator  29.85 
 
 
229 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2924  XRE family transcriptional regulator  29.38 
 
 
204 aa  76.3  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.705469  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1579  transcriptional regulator  28.07 
 
 
182 aa  76.3  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4365  XRE family transcriptional regulator  26.95 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000321232  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2279  DNA-binding protein  27.27 
 
 
185 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.268468  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2448  DNA-binding protein  27.27 
 
 
185 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.191992  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2463  DNA-binding protein  27.27 
 
 
185 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2232  Cro/CI family transcriptional regulator  32.39 
 
 
177 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1096  helix-turn-helix domain-containing protein  26.52 
 
 
182 aa  75.1  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2239  transcriptional regulator  27.27 
 
 
185 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0224117  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0662  XRE family transcriptional regulator  28.42 
 
 
259 aa  75.1  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0668  XRE family transcriptional regulator  26.5 
 
 
206 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1147  XRE family transcriptional regulator  26.5 
 
 
206 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2197  transcriptional regulator  26.7 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26325  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0744  XRE family transcriptional regulator  26.99 
 
 
209 aa  74.7  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.541206  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3508  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 
187 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0510026 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3469  DNA-binding protein  30.22 
 
 
189 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.162788  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  31.1 
 
 
189 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3022  XRE family transcriptional regulator  31.74 
 
 
208 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1123  XRE family transcriptional regulator  26.67 
 
 
221 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0106313  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5322  XRE family transcriptional regulator  30.54 
 
 
203 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869737  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1029  XRE family transcriptional regulator  26.67 
 
 
219 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.289543  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2542  DNA-binding protein  25.99 
 
 
185 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2877  transcriptional regulator, XRE family  27.93 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  32.09 
 
 
236 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4537  XRE family transcriptional regulator  30.54 
 
 
203 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0608  XRE family transcriptional regulator  30.32 
 
 
227 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2928  DNA-binding protein  25.57 
 
 
185 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00384603 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5700  XRE family transcriptional regulator  30.54 
 
 
203 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441066 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5159  XRE family transcriptional regulator  30.54 
 
 
203 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4804  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  32.89 
 
 
198 aa  72  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  33.53 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  33.53 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  33.53 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  33.53 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  33.53 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  33.53 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2158  XRE family transcriptional regulator  26.15 
 
 
224 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00315318  normal  0.41098 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0831  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 
183 aa  70.9  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000078794  normal  0.173113 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0950  transcriptional regulator, XRE family  27.04 
 
 
205 aa  70.1  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00163253 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  29.55 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>