More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A1789 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A1668  Cro/CI family transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  416  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.118403 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1789  transcriptional regulator, Cro/CI family  100 
 
 		 200 aa  416  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.225 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1849  Cro/CI family transcriptional regulator  99.5 
 
 		 200 aa  414  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1787  Cro/CI family transcriptional regulator  98.5 
 
 		 200 aa  408  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0263563  normal  0.220225 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1487  transcriptional regulator, Cro/CI family  98.5 
 
 		 200 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.335106  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3529  XRE family transcriptional regulator  63 
 
 		 200 aa  262  3e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.295271 
 
 
-
 
NC_003296  RS04780  putative transcription regulator protein  62 
 
 		 205 aa  260  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05657  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  62 
 
 		 205 aa  260  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5072  transcriptional regulator, XRE family  53.5 
 
 		 207 aa  204  9e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2770  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 192 aa  152  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169539 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4931  transcriptional regulator, XRE family  41.21 
 
 		 187 aa  149  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5123  hypothetical protein  36 
 
 		 198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.635702  normal  0.639471 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0332  transcriptional regulator, XRE family  29.73 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.865127  normal  0.108372 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2075  helix-turn-helix domain protein  30.77 
 
 		 196 aa  97.4  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241547  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4024  putative transcriptional regulator  37.91 
 
 		 195 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46710  putative transcriptional regulator  37.36 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0037508  decreased coverage  0.000000167672 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2346  transcriptional regulator  30.1 
 
 		 215 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34730  XRE family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 193 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0210921  normal  0.262574 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4848  transcriptional regulator, XRE family  32.4 
 
 		 198 aa  89  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3771  transcriptional regulator, XRE family  32.4 
 
 		 198 aa  89  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.471902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0632  DNA-binding protein  30.91 
 
 		 181 aa  87.4  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4320  XRE family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 181 aa  85.9  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.810122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0872  transcriptional regulator  29.03 
 
 		 192 aa  85.5  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.62802  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4806  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.24 
 
 		 203 aa  84.7  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0714  DNA-binding protein  33.53 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0893  DNA-binding protein  33.53 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6018  XRE family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0594  DNA-binding protein  33.53 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0728  DNA-binding protein  33.53 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2690  XRE family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02293  putative transcription regulator protein  32.1 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.40687 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0929  XRE family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145461  normal  0.153472 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3086  transcriptional regulator, putative  31.75 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0196484  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0416  XRE family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.387969 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3308  transcriptional regulator  30.94 
 
 		 187 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.38656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2718  XRE family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0197  XRE family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0555347  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2078  XRE family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0921  transcriptional regulator, XRE family  28.49 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3441  XRE family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.404086 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2441  DNA-binding protein  33.53 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0229  DNA-binding protein  33.53 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2361  DNA-binding protein  33.53 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2717  DNA-binding protein  33.53 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0917  transcriptional regulator, XRE family  28.49 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2607  XRE family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2743  XRE family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3325  transcriptional regulator, XRE family  30.35 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.610712  normal  0.167348 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1211  helix-turn-helix domain-containing protein  27.01 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0634  XRE family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1816  XRE family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00473491  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1855  XRE family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 177 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21785 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3250  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  31.07 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.653673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4365  XRE family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 197 aa  79.7  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000321232  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0945  transcriptional regulator, XRE family  27.78 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000133489  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0850  XRE family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.406298  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7005  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.89282 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4259  XRE family transcriptional regulator  28 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.655976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4158  XRE family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1109  XRE family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2254  XRE family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 185 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575156  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2924  XRE family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.705469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1579  transcriptional regulator  28.07 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  32.62 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0608  XRE family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0668  XRE family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1147  XRE family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2232  Cro/CI family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 177 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2463  DNA-binding protein  27.27 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2279  DNA-binding protein  27.27 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.268468  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2448  DNA-binding protein  27.27 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.191992  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1096  helix-turn-helix domain-containing protein  26.52 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0662  XRE family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 259 aa  75.1  0.0000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2239  transcriptional regulator  27.27 
 
 		 185 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0224117  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3508  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0510026 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3022  XRE family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  34.1 
 
 		 179 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  34.1 
 
 		 179 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3469  DNA-binding protein  30.22 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.162788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2197  transcriptional regulator  26.7 
 
 		 185 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26325  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  34.1 
 
 		 179 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  34.1 
 
 		 179 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  34.1 
 
 		 179 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0744  XRE family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 209 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.541206  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1123  XRE family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0106313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  34.1 
 
 		 179 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1029  XRE family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.289543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2877  transcriptional regulator, XRE family  27.93 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5322  XRE family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  30.11 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  34.1 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  30.59 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0321  XRE family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250107  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0324  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000421536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2542  DNA-binding protein  25.99 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0319  XRE family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000379854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5159  XRE family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>