More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_46710 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_46710  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 216 aa  431  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0037508  decreased coverage  0.000000167672 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4024  putative transcriptional regulator  97.44 
 
 		 195 aa  374  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0197  XRE family transcriptional regulator  63.49 
 
 		 190 aa  226  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0555347  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3508  XRE family transcriptional regulator  60 
 
 		 187 aa  204  6e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0510026 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3308  transcriptional regulator  58.56 
 
 		 187 aa  202  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.38656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3441  XRE family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 187 aa  201  7e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.404086 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2232  Cro/CI family transcriptional regulator  59.43 
 
 		 177 aa  198  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1855  XRE family transcriptional regulator  59.09 
 
 		 177 aa  198  5e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21785 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3188  XRE family transcriptional regulator  57.75 
 
 		 189 aa  196  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.549125 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3250  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  57.92 
 
 		 189 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.653673  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3469  DNA-binding protein  57.46 
 
 		 189 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.162788  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1816  XRE family transcriptional regulator  52.78 
 
 		 191 aa  171  5.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00473491  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5123  hypothetical protein  39.67 
 
 		 198 aa  112  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.635702  normal  0.639471 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2770  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169539 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4931  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 187 aa  102  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1789  transcriptional regulator, Cro/CI family  37.36 
 
 		 200 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.225 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1849  Cro/CI family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 200 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3529  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 200 aa  94  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.295271 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1668  Cro/CI family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 200 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.118403 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1787  Cro/CI family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 200 aa  93.2  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0263563  normal  0.220225 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5072  transcriptional regulator, XRE family  36.41 
 
 		 207 aa  93.2  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1487  transcriptional regulator, Cro/CI family  37.85 
 
 		 200 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.335106  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04780  putative transcription regulator protein  33.52 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05657  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  33.52 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2877  transcriptional regulator, XRE family  35.36 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0850  XRE family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 182 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.406298  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2254  XRE family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575156  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05910  predicted transcriptional regulator  39.22 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.848221  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2928  DNA-binding protein  27.59 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384603 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1579  transcriptional regulator  26.32 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2279  DNA-binding protein  27.59 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.268468  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2463  DNA-binding protein  27.59 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2448  DNA-binding protein  27.59 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.191992  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2075  helix-turn-helix domain protein  28.72 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241547  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2542  DNA-binding protein  27.59 
 
 		 185 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4079  XRE family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2239  transcriptional regulator  27.59 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0224117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2197  transcriptional regulator  27.01 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26325  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1096  helix-turn-helix domain-containing protein  25.58 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2481  DNA-binding protein  27.12 
 
 		 185 aa  72  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193646  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1109  XRE family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0678  transcriptional regulator, XRE family  32.52 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2487  XRE family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0332  transcriptional regulator, XRE family  33.72 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.865127  normal  0.108372 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01840  transcriptional regulator, XRE family  29.63 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0831  XRE family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000078794  normal  0.173113 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0929  XRE family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145461  normal  0.153472 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1459  helix-turn-helix domain protein  32.52 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1520  XRE family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0757766  normal  0.0239869 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  29.09 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2039  DNA-binding protein  30.59 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000824446  hitchhiker  5.01479e-19 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4320  XRE family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.810122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2054  transcriptional regulator, XRE family  29.34 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.388224 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6084  XRE family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.207069 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4537  XRE family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1033  transcriptional regulator, XRE family  28.18 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3725  DNA-binding protein  29.63 
 
 		 258 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4806  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.48 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1719  XRE family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.499876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5322  XRE family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2924  XRE family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.705469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2614  transcriptional regulator  34.3 
 
 		 248 aa  64.7  0.0000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0321  XRE family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 191 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250107  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0004  DNA-binding protein  29.7 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3484  transcriptional regulator, XRE family  31.61 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3114  XRE family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935644  normal  0.475898 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4971  XRE family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110875  normal  0.347082 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01392  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2212  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0004  DNA-binding protein  29.7 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.278794  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0662  XRE family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01402  hypothetical protein  30 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2225  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.639128 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1509  putative DNA-binding protein  29.7 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1737  XRE family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0099  transcriptional regulator, XRE family  29.44 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1517  DNA-binding protein  30 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0004  DNA-binding cupin domain-containing protein  29.7 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1613  DNA-binding protein  30 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5159  XRE family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0632  DNA-binding protein  27.27 
 
 		 181 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4773  transcriptional regulator, XRE family  31.1 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0282623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5700  XRE family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441066 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0917  transcriptional regulator, XRE family  29.7 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1740  DNA-binding protein  30 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000189008  hitchhiker  2.35786e-17 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0004  DNA-binding protein  29.7 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2346  transcriptional regulator  30.56 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1556  transcriptional regulator, XRE family  29.31 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1150  DNA-binding protein  29.7 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129822  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0005  DNA-binding protein  29.7 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792058  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1783  XRE family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1430  DNA-binding protein  29.7 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3325  transcriptional regulator, XRE family  30.05 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.610712  normal  0.167348 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0323  XRE family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000737434  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1722  transcriptional regulator, XRE family  29.31 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.185673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2718  XRE family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3180  XRE family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2690  XRE family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0945  transcriptional regulator, XRE family  25 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000133489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>