More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0831 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0831  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 183 aa  375  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000078794  normal  0.173113 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0632  DNA-binding protein  37.43 
 
 		 181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4320  XRE family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.810122  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3286  DNA-binding protein  35.67 
 
 		 179 aa  112  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3114  XRE family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 203 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935644  normal  0.475898 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4971  XRE family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 203 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110875  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5700  XRE family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 203 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441066 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4537  XRE family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 203 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5159  XRE family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 203 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3180  XRE family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 203 aa  105  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0004  DNA-binding protein  33.14 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.278794  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1509  putative DNA-binding protein  33.14 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0004  DNA-binding protein  33.14 
 
 		 202 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0004  DNA-binding cupin domain-containing protein  33.14 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1150  DNA-binding protein  33.14 
 
 		 202 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129822  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0005  DNA-binding protein  33.14 
 
 		 202 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792058  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0004  DNA-binding protein  33.14 
 
 		 202 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1430  DNA-binding protein  33.14 
 
 		 202 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5322  XRE family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 203 aa  102  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3022  XRE family transcriptional regulator  32 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7005  transcriptional regulator, XRE family  31.43 
 
 		 212 aa  99.4  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.89282 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4158  XRE family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 204 aa  94.7  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4806  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.21 
 
 		 203 aa  92  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2614  transcriptional regulator  30.98 
 
 		 248 aa  88.6  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4773  transcriptional regulator, XRE family  31.21 
 
 		 187 aa  87.8  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0282623  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2770  XRE family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 192 aa  85.5  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169539 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4848  transcriptional regulator, XRE family  27.68 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3771  transcriptional regulator, XRE family  27.68 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.471902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4933  transcriptional regulator, XRE family  30.23 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4469  helix-turn-helix domain-containing protein  30.23 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02293  putative transcription regulator protein  26.82 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.40687 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4983  transcriptional regulator, XRE family  30.23 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0953387  normal  0.300371 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2714  XRE family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 204 aa  80.9  0.000000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0929  XRE family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145461  normal  0.153472 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1740  DNA-binding protein  30.36 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000189008  hitchhiker  2.35786e-17 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0872  transcriptional regulator  30.27 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.62802  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4365  XRE family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000321232  normal  0.264561 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01392  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.36 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2212  transcriptional regulator, XRE family  30.36 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2225  XRE family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.639128 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1613  DNA-binding protein  30.36 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01402  hypothetical protein  30.36 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1517  DNA-binding protein  30.36 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4804  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.57 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1088  transcriptional regulator  26.86 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1096  helix-turn-helix domain-containing protein  25 
 
 		 182 aa  77.8  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01840  transcriptional regulator, XRE family  24.86 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1722  transcriptional regulator, XRE family  28.74 
 
 		 185 aa  77.8  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.185673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6084  XRE family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 234 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.207069 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1783  XRE family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 178 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0981  DNA-binding protein  26.29 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0850  XRE family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.406298  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1109  XRE family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 183 aa  77.4  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1737  XRE family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2039  DNA-binding protein  30.36 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000824446  hitchhiker  5.01479e-19 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4589  transcriptional regulator, XRE family  29.59 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1787  Cro/CI family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0263563  normal  0.220225 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0921  transcriptional regulator, XRE family  29.73 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4967  transcriptional regulator, XRE family  26.97 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454469  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0917  transcriptional regulator, XRE family  29.73 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1556  transcriptional regulator, XRE family  28.14 
 
 		 178 aa  75.9  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1033  transcriptional regulator, XRE family  29.83 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34730  XRE family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0210921  normal  0.262574 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1719  XRE family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.499876  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3086  transcriptional regulator, putative  32.1 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0196484  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04780  putative transcription regulator protein  29.17 
 
 		 205 aa  74.7  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05657  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  29.17 
 
 		 205 aa  74.7  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1982  XRE family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 175 aa  73.9  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.623481  normal  0.364753 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3308  transcriptional regulator  29.65 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.38656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2254  XRE family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 185 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575156  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1579  transcriptional regulator  24.39 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0950  transcriptional regulator, XRE family  25.81 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00163253 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1957  XRE family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.210401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  24.4 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2075  helix-turn-helix domain protein  28.99 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241547  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5143  putative transcriptional regulator, XRE family  32.53 
 
 		 192 aa  72  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0117731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2928  DNA-binding protein  23.53 
 
 		 185 aa  72  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384603 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2231  XRE family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000245077 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2542  DNA-binding protein  23.67 
 
 		 185 aa  71.2  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4938  XRE family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 206 aa  71.2  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.839761  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4400  DNA-binding protein  25.15 
 
 		 190 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4240  DNA-binding protein  25.15 
 
 		 190 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4252  DNA-binding protein  25.15 
 
 		 190 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4617  DNA-binding protein  25.15 
 
 		 190 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3529  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 200 aa  71.2  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.295271 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4740  DNA-binding protein  25.15 
 
 		 190 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2481  DNA-binding protein  25.58 
 
 		 185 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193646  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1668  Cro/CI family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.118403 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2279  DNA-binding protein  24.42 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.268468  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2463  DNA-binding protein  24.42 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2197  transcriptional regulator  25 
 
 		 185 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26325  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0134  hypothetical protein  27.11 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2448  DNA-binding protein  24.42 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.191992  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4333  XRE family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1849  Cro/CI family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1789  transcriptional regulator, Cro/CI family  28.57 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.225 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0622  DNA-binding protein  24.54 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.475485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4613  DNA-binding protein  25.15 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4633  DNA-binding protein  24.54 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>