More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1083 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
199 aa  415  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  90.5 
 
 
201 aa  382  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  35.75 
 
 
178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  32.43 
 
 
192 aa  114  7.999999999999999e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2836  DNA-binding protein  32.78 
 
 
184 aa  112  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000716748  hitchhiker  0.00000000374058 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  30.73 
 
 
181 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  30.73 
 
 
181 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  30.73 
 
 
181 aa  111  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  30.73 
 
 
181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  30.17 
 
 
181 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
181 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  30.17 
 
 
181 aa  108  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  30.17 
 
 
181 aa  108  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  30.17 
 
 
181 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  30.17 
 
 
181 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  33.51 
 
 
191 aa  106  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  32.99 
 
 
191 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  32.99 
 
 
191 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  32.99 
 
 
191 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  33.15 
 
 
193 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  32.43 
 
 
191 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2868  Cro/CI family transcriptional regulator  33.83 
 
 
199 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2913  XRE family transcriptional regulator  33.83 
 
 
199 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  34.07 
 
 
236 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  32.42 
 
 
189 aa  102  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  34.07 
 
 
236 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4729  XRE family transcriptional regulator  32.97 
 
 
192 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0230  transcriptional regulator  32.97 
 
 
197 aa  102  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  33.52 
 
 
191 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2821  XRE family transcriptional regulator  34.34 
 
 
199 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5317  XRE family transcriptional regulator  32.97 
 
 
192 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221767  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  32.97 
 
 
192 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  32.07 
 
 
193 aa  102  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  34.07 
 
 
179 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  34.07 
 
 
179 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  34.07 
 
 
179 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  34.07 
 
 
179 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  34.07 
 
 
179 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  34.07 
 
 
179 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  34.62 
 
 
190 aa  101  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  32.61 
 
 
192 aa  101  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  32.61 
 
 
192 aa  101  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  32.6 
 
 
186 aa  99.8  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  32.6 
 
 
186 aa  99.8  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  32.6 
 
 
186 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  32.6 
 
 
186 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65950  putative transcriptional regulator  32.82 
 
 
199 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  32.6 
 
 
186 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5722  putative transcriptional regulator  34.08 
 
 
199 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  33.15 
 
 
186 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  32.6 
 
 
197 aa  98.6  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  33.52 
 
 
190 aa  97.1  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  31.84 
 
 
188 aa  96.3  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3586  XRE family transcriptional regulator  33.93 
 
 
207 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  32.39 
 
 
176 aa  96.3  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0650  XRE family transcriptional regulator  32.93 
 
 
187 aa  95.5  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  29.38 
 
 
175 aa  95.1  6e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1480  XRE family transcriptional regulator  34.24 
 
 
198 aa  94  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1457  transcriptional regulator  30.69 
 
 
188 aa  93.6  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.96188e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  29.05 
 
 
292 aa  93.2  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3551  transcriptional regulator, XRE family  32.09 
 
 
196 aa  92.4  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4679  putative transcriptional regulator  29.67 
 
 
180 aa  91.7  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2819  MerR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
192 aa  91.3  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16550  predicted transcriptional regulator  30.73 
 
 
204 aa  91.3  9e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0791  transcriptional regulator, XRE family  32.34 
 
 
213 aa  90.5  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.49267e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1265  transcriptional regulator, putative  29.41 
 
 
182 aa  90.1  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4448  XRE family transcriptional regulator  30.81 
 
 
193 aa  90.5  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0311191  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  31.84 
 
 
180 aa  89.4  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  27.81 
 
 
182 aa  88.2  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3100  XRE family transcriptional regulator  29.41 
 
 
208 aa  87.8  9e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.510523  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2921  XRE family transcriptional regulator  29.41 
 
 
208 aa  87.8  9e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.899455  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3003  XRE family transcriptional regulator  29.41 
 
 
208 aa  87.8  9e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6084  XRE family transcriptional regulator  27.09 
 
 
234 aa  87  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.207069 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1091  XRE family transcriptional regulator  28.88 
 
 
182 aa  86.7  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.158888  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4841  cupin 2 domain-containing protein  28.5 
 
 
202 aa  86.3  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1128  XRE family transcriptional regulator  27.72 
 
 
182 aa  85.5  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4917  XRE family transcriptional regulator  33.15 
 
 
184 aa  85.5  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1058  XRE family transcriptional regulator  27.72 
 
 
184 aa  85.5  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3867  XRE family transcriptional regulator  31.38 
 
 
201 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0274  transcriptional regulator, XRE family  29.12 
 
 
205 aa  85.1  6e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.64998  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3046  transcriptional regulator  32.28 
 
 
201 aa  85.1  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2046  XRE family transcriptional regulator  31.84 
 
 
205 aa  85.1  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298774  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0751  XRE family transcriptional regulator  32.43 
 
 
179 aa  84.7  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000101746  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5178  XRE family transcriptional regulator  26.9 
 
 
199 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3329  transcriptional regulator  27.03 
 
 
201 aa  84.7  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.855836  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3195  transcriptional regulator, XRE family  27.81 
 
 
182 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0639399 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1195  XRE family transcriptional regulator  27.81 
 
 
182 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152731  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1163  cupin 2 domain-containing protein  27.81 
 
 
182 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.967119  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1104  cupin 2 domain-containing protein  27.81 
 
 
182 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.183758  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4258  DNA-binding protein  29.12 
 
 
181 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4094  transcriptional regulator  29.12 
 
 
181 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4105  transcriptional regulator  29.12 
 
 
181 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4442  DNA-binding protein  29.12 
 
 
181 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4590  DNA-binding protein  29.12 
 
 
181 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  31.52 
 
 
201 aa  83.2  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4443  DNA-binding protein  29.12 
 
 
181 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0524  XRE family transcriptional regulator  30.72 
 
 
187 aa  82.8  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000827128  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1154  XRE family transcriptional regulator  30.85 
 
 
204 aa  82.8  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0376883  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4493  DNA-binding protein  29.12 
 
 
181 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01840  transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 
182 aa  82.4  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>