More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3046 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3046  transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  405  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4448  XRE family transcriptional regulator  48.47 
 
 		 193 aa  194  6e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0311191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3438  XRE family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0650  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1154  XRE family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 204 aa  108  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0376883  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3263  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2320  transcriptional regulator, XRE family  32.8 
 
 		 188 aa  105  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1889  transcriptional regulator, XRE family  32.8 
 
 		 188 aa  105  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3247  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 187 aa  105  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000592797 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3298  Cro/CI family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 187 aa  105  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0079  Cro/CI family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 196 aa  104  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0878  cupin 2 domain-containing protein  34.78 
 
 		 196 aa  104  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000206175  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3393  transcriptional regulator, XRE family  32.47 
 
 		 199 aa  102  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000124891  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3456  transcriptional regulator, XRE family  32.47 
 
 		 199 aa  102  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0485  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 		 197 aa  100  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000244144  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2946  transcriptional regulator  35.68 
 
 		 197 aa  99  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0524  XRE family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 187 aa  99  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000827128  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2819  MerR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 192 aa  97.1  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3489  XRE family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 187 aa  92  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  36.69 
 
 		 192 aa  89.4  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 212 aa  88.6  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1034  transcriptional regulator, XRE family  31.84 
 
 		 181 aa  85.9  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000342515  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 199 aa  85.1  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1444  cupin 2 domain-containing protein  32.93 
 
 		 192 aa  84.7  7e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  30.69 
 
 		 201 aa  84.7  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1587  helix-turn-helix domain-containing protein  30.39 
 
 		 192 aa  84.3  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.95 
 
 		 189 aa  84  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1879  transcriptional regulator, XRE family  31.87 
 
 		 182 aa  83.2  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  31.28 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 176 aa  82.8  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4610  XRE family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.985679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2821  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1457  transcriptional regulator  28.11 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.96188e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0325  XRE family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2913  XRE family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 199 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2868  Cro/CI family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 199 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2247  transcriptional regulator, XRE family  31.91 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4894  XRE family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 180 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0076  XRE family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  27.07 
 
 		 175 aa  79.7  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5244  XRE family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.664792  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1039  MerR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5615  XRE family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322287  normal  0.0794813 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4613  XRE family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  hitchhiker  0.00323798 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0661  MerR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5444  XRE family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00345676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1456  xenobiotic response element family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01823e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0556  MerR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 191 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1987  transcriptional regulator, XRE family  30.16 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144245  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5954  transcriptional regulator, XRE family  30.16 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 191 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 191 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0281  DNA-binding protein  29.05 
 
 		 187 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0867  DNA-binding protein  29.05 
 
 		 187 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1956  DNA-binding protein  29.05 
 
 		 187 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0958  DNA-binding protein  29.05 
 
 		 187 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.704462  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  30.64 
 
 		 191 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1668  transcriptional regulator, XRE family  30.72 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1008  DNA-binding protein  29.05 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1001  DNA-binding protein  29.05 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0750  transcriptional regulator, XRE family  27.42 
 
 		 181 aa  76.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0884701 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0869  XRE family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  28.89 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4811  XRE family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213383 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6084  XRE family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.207069 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0477  XRE family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.566181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 292 aa  75.5  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  28.89 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1985  transcriptional regulator, XRE family  30.85 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.127285  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5086  putative transcriptional regulator, XRE family  29.67 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4729  XRE family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5317  XRE family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221767  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5931  transcriptional regulator, XRE family  30.16 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  33.72 
 
 		 179 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  33.72 
 
 		 179 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0311  cupin 2 domain-containing protein  26.67 
 
 		 189 aa  74.3  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  33.72 
 
 		 179 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 193 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  33.72 
 
 		 179 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  33.72 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2046  XRE family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 190 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  33.72 
 
 		 179 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  33.72 
 
 		 179 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6009  XRE family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.285081  hitchhiker  0.00726065 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1162  DNA-binding protein  28.49 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  33.72 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2356  transcriptional regulator, XRE family  29.7 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.190302 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1139  transcriptional regulator  29.78 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  0.0958639 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2231  transcriptional regulator, XRE family  31.32 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1871  putative HTH-type transcriptional regulator  32.54 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0589891  normal  0.573197 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0474  XRE family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.554508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>