More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3586 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3586  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 207 aa  400  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0361  XRE family transcriptional regulator  60.1 
 
 		 205 aa  186  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0230  transcriptional regulator  43.55 
 
 		 197 aa  141  9e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3867  XRE family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2868  Cro/CI family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 199 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2913  XRE family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 199 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2821  XRE family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 199 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5722  putative transcriptional regulator  40.96 
 
 		 199 aa  123  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0188  XRE family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 229 aa  119  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.054457 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0772  transcriptional regulator  42.05 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.855503 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65950  putative transcriptional regulator  39.36 
 
 		 199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  37.22 
 
 		 192 aa  117  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4841  cupin 2 domain-containing protein  41.67 
 
 		 202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 292 aa  115  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0638  putative transcriptional regulator  41.08 
 
 		 184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1441  XRE family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 227 aa  109  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0636175 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3556  XRE family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.427188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 199 aa  108  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2042  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 188 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4807  XRE family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 185 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730727  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2181  Cro/CI family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 184 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1027  XRE family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 223 aa  108  8.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0803  XRE family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215741  normal  0.130979 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06970  Cro/CI family transcriptional regulator  40 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  33.15 
 
 		 201 aa  106  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4279  XRE family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 185 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 178 aa  105  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5178  XRE family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 199 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2578  transcriptional regulator, XRE family  41.57 
 
 		 182 aa  105  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3720  XRE family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 200 aa  105  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.310668  normal  0.0265405 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5268  Cro/CI family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 182 aa  104  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2635  XRE family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 185 aa  104  9e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.362634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5320  XRE family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.8166  normal  0.310919 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1788  XRE family transcriptional regulator  39.88 
 
 		 184 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2836  DNA-binding protein  30.98 
 
 		 184 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000716748  hitchhiker  0.00000000374058 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2177  transcriptional regulator, putative  38.2 
 
 		 184 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1846  XRE family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 183 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.677123  hitchhiker  0.00632075 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3560  XRE family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 184 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.444346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1784  XRE family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 184 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0544  XRE family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 203 aa  101  7e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5384  XRE family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 185 aa  101  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  normal  0.424249 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4902  XRE family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 185 aa  101  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.634753 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3464  XRE family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 185 aa  101  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4679  putative transcriptional regulator  30.36 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  32.57 
 
 		 188 aa  100  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 176 aa  100  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0277  XRE family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 204 aa  99.4  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.128046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0202  XRE family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 182 aa  97.8  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.614203  hitchhiker  0.00167713 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2294  XRE family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 211 aa  97.1  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0641  XRE family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 211 aa  97.1  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199173  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1058  XRE family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 184 aa  97.8  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1128  XRE family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 182 aa  97.8  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1456  xenobiotic response element family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 188 aa  95.5  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01823e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4917  XRE family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 184 aa  95.5  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3869  XRE family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 183 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0766  XRE family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 183 aa  95.1  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  28.96 
 
 		 181 aa  95.1  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1265  transcriptional regulator, putative  33.33 
 
 		 182 aa  94.7  8e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0238  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  32.14 
 
 		 199 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0105  DNA-binding protein  35.33 
 
 		 199 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0274  transcriptional regulator, XRE family  40.78 
 
 		 205 aa  94  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.64998  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3411  transcriptional regulator, XRE family  36.59 
 
 		 183 aa  94  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  35.36 
 
 		 201 aa  94.4  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 182 aa  93.6  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1104  cupin 2 domain-containing protein  32.14 
 
 		 182 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.183758  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5523  transcriptional regulator  32.14 
 
 		 182 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3100  XRE family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.510523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1195  XRE family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 182 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2985  XRE family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 183 aa  94  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3195  transcriptional regulator, XRE family  32.14 
 
 		 182 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0639399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1163  cupin 2 domain-containing protein  32.14 
 
 		 182 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.967119  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2921  XRE family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.899455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3003  XRE family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2646  XRE family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 182 aa  93.2  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2991  XRE family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 183 aa  93.2  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1457  transcriptional regulator  29.19 
 
 		 188 aa  92.8  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.96188e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4415  XRE family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 213 aa  93.2  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 181 aa  93.2  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2901  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 183 aa  92.8  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2377  XRE family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 183 aa  93.2  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3038  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 183 aa  92.8  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3011  XRE family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 183 aa  93.2  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4784  transcriptional regulator, XRE family  35.98 
 
 		 182 aa  92.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0510271 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  27.87 
 
 		 181 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6084  XRE family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 234 aa  92.8  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.207069 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  27.32 
 
 		 181 aa  92  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 181 aa  92  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  27.32 
 
 		 181 aa  92  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  28.42 
 
 		 181 aa  91.7  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1943  Cro/CI family transcriptional regulator putative  34.46 
 
 		 189 aa  91.7  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.693839  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  28.42 
 
 		 181 aa  91.7  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 189 aa  91.3  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  28.42 
 
 		 181 aa  91.3  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47950  Cupin, RmlC-type protein  32.35 
 
 		 182 aa  91.3  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  34.52 
 
 		 211 aa  90.5  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1091  XRE family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 182 aa  90.9  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.158888  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6340  XRE family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 183 aa  90.9  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4609  XRE family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 229 aa  90.5  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0641  aldehyde dehydrogenase-like protein  33.9 
 
 		 183 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 181 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>