More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2578 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2578  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 182 aa  358  2e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1729  transcriptional regulator, XRE family  50.56 
 
 		 195 aa  165  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114176  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1434  transcriptional regulator, XRE family  52.17 
 
 		 232 aa  161  5.0000000000000005e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.887851  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1418  transcriptional regulator, XRE family  53.04 
 
 		 203 aa  157  9e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.560909  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2948  transcriptional regulator, XRE family  45.51 
 
 		 225 aa  151  5e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211039  hitchhiker  0.000112709 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0965  transcriptional regulator, XRE family  45.51 
 
 		 191 aa  149  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0847  XRE family transcriptional regulator  44.38 
 
 		 191 aa  145  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0274  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 205 aa  143  1e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.64998  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1046  XRE family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 186 aa  137  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0715  transcriptional regulator, XRE family  43.43 
 
 		 187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.39864  normal  0.0327391 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0599  transcriptional regulator, XRE family  51.85 
 
 		 193 aa  127  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04340  predicted transcriptional regulator  41.14 
 
 		 189 aa  116  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2913  XRE family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 199 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 292 aa  97.1  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2821  XRE family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 199 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2868  Cro/CI family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 199 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1456  xenobiotic response element family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 188 aa  94.4  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01823e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1034  transcriptional regulator, XRE family  31.18 
 
 		 181 aa  93.6  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000342515  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3586  XRE family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 207 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5722  putative transcriptional regulator  33.7 
 
 		 199 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65950  putative transcriptional regulator  33.15 
 
 		 199 aa  92  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0230  transcriptional regulator  36.22 
 
 		 197 aa  92  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3684  transcriptional regulator, XRE family  31.18 
 
 		 180 aa  91.7  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000437538  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3867  XRE family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 201 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6084  XRE family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 234 aa  89.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.207069 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4841  cupin 2 domain-containing protein  36.07 
 
 		 202 aa  89  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 178 aa  89  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  35.87 
 
 		 211 aa  89  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  36.72 
 
 		 201 aa  87  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1457  transcriptional regulator  30.43 
 
 		 188 aa  87.4  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.96188e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0842  cupin 2 domain-containing protein  36.96 
 
 		 188 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  33.52 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 176 aa  86.7  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0751  XRE family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 179 aa  85.9  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000101746  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2294  XRE family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 211 aa  84.3  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0641  XRE family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 211 aa  84.3  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199173  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4807  XRE family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 185 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0803  XRE family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 185 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215741  normal  0.130979 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5113  putative transcriptional regulator  36.14 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1441  XRE family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0636175 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58380  putative transcriptional regulator  36.14 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0099  transcriptional regulator, XRE family  34.25 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0772  transcriptional regulator  36.11 
 
 		 204 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.855503 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3720  XRE family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 200 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.310668  normal  0.0265405 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1027  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  80.9  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 212 aa  80.9  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 199 aa  80.5  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2540  Cro/CI family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5384  XRE family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  normal  0.424249 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0188  XRE family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.054457 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0638  putative transcriptional regulator  33.71 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0281  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0867  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0958  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.704462  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1956  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  29.67 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4902  XRE family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 185 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.634753 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3464  XRE family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 185 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1480  XRE family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 198 aa  79  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2635  XRE family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.362634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1806  transcriptional regulator, XRE family  27.81 
 
 		 181 aa  79  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2148  DNA-binding protein, putative  27.81 
 
 		 181 aa  79  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4279  XRE family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  30.05 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3551  transcriptional regulator, XRE family  35.33 
 
 		 196 aa  77.8  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0980  XRE family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 181 aa  77.8  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000294477  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2734  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00297691  normal  0.0817302 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1721  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4917  XRE family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 184 aa  77.4  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4679  putative transcriptional regulator  31.33 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  27.59 
 
 		 175 aa  76.6  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  27.93 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0901  XRE family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108423 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1846  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.677123  hitchhiker  0.00632075 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1008  DNA-binding protein  32.77 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06970  Cro/CI family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1001  DNA-binding protein  32.77 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  35.03 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0805  DNA-binding protein  31.61 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602444  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4589  transcriptional regulator, XRE family  30.36 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1419  XRE family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 178 aa  74.3  0.0000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 192 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 292 aa  74.3  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 192 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4729  XRE family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  30.73 
 
 		 191 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>