More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA1956 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A0867  DNA-binding protein  100 
 
 
187 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1956  DNA-binding protein  100 
 
 
187 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0958  DNA-binding protein  100 
 
 
187 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.704462  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0281  DNA-binding protein  100 
 
 
187 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1001  DNA-binding protein  99.47 
 
 
187 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1008  DNA-binding protein  99.47 
 
 
187 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1162  DNA-binding protein  98.93 
 
 
187 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0805  DNA-binding protein  88.77 
 
 
224 aa  335  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602444  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4894  XRE family transcriptional regulator  78.33 
 
 
180 aa  298  3e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5444  XRE family transcriptional regulator  78.33 
 
 
180 aa  297  6e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00345676  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0076  XRE family transcriptional regulator  78.33 
 
 
180 aa  297  8e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196991  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5244  XRE family transcriptional regulator  77.78 
 
 
180 aa  295  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.664792  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5615  XRE family transcriptional regulator  77.78 
 
 
180 aa  295  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322287  normal  0.0794813 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4613  XRE family transcriptional regulator  77.22 
 
 
180 aa  294  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  hitchhiker  0.00323798 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  61.58 
 
 
182 aa  214  7e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02750  putative transcriptional regulator  55.8 
 
 
179 aa  179  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.549892  normal  0.0746214 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0311  putative transcriptional regulator  54.7 
 
 
179 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2732  XRE family transcriptional regulator  50.83 
 
 
180 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2591  XRE family transcriptional regulator  51.38 
 
 
180 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3125  Cro/CI family transcriptional regulator  50.28 
 
 
180 aa  167  9e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.888864  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1309  transcriptional regulator  52.49 
 
 
180 aa  165  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0450  XRE family transcriptional regulator  46.07 
 
 
180 aa  152  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  44.32 
 
 
212 aa  134  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0485  transcriptional regulator, XRE family  35.63 
 
 
197 aa  107  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000244144  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3393  transcriptional regulator, XRE family  33.89 
 
 
199 aa  105  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000124891  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3456  transcriptional regulator, XRE family  33.89 
 
 
199 aa  105  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3438  XRE family transcriptional regulator  32.6 
 
 
198 aa  101  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0878  cupin 2 domain-containing protein  36.16 
 
 
196 aa  101  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000206175  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0079  Cro/CI family transcriptional regulator  32.2 
 
 
196 aa  100  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2946  transcriptional regulator  33.51 
 
 
197 aa  97.1  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.15 
 
 
189 aa  97.4  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1154  XRE family transcriptional regulator  32.4 
 
 
204 aa  94.7  8e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0376883  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3298  Cro/CI family transcriptional regulator  31.46 
 
 
187 aa  92.4  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3247  XRE family transcriptional regulator  32.02 
 
 
187 aa  92.8  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000592797 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0524  XRE family transcriptional regulator  29.21 
 
 
187 aa  91.3  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000827128  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0402  transcriptional regulator, XRE family  30.9 
 
 
189 aa  91.3  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.699228  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2320  transcriptional regulator, XRE family  33.15 
 
 
188 aa  90.9  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3489  XRE family transcriptional regulator  31.64 
 
 
187 aa  90.5  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0650  XRE family transcriptional regulator  30.34 
 
 
187 aa  90.5  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1889  transcriptional regulator, XRE family  33.15 
 
 
188 aa  90.9  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1806  transcriptional regulator, XRE family  29.38 
 
 
181 aa  87.8  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2148  DNA-binding protein, putative  29.38 
 
 
181 aa  87.8  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2819  MerR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
192 aa  87.4  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3263  transcriptional regulator, XRE family  30.34 
 
 
188 aa  87  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3227  transcriptional regulator  33.33 
 
 
201 aa  87  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.792428  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0474  XRE family transcriptional regulator  28.73 
 
 
192 aa  86.3  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.554508  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2601  XRE family transcriptional regulator  34.25 
 
 
203 aa  86.3  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512754  hitchhiker  0.000000366247 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0869  XRE family transcriptional regulator  31.64 
 
 
209 aa  86.3  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1345  XRE family transcriptional regulator  32.97 
 
 
209 aa  86.3  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200207  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2327  transcriptional regulator, XRE family  28.33 
 
 
189 aa  84.7  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1555  putative transcriptional regulator  31.46 
 
 
208 aa  84.3  9e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602269  normal  0.341998 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1668  transcriptional regulator, XRE family  29.94 
 
 
188 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3022  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 
208 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1456  xenobiotic response element family transcriptional regulator  28.57 
 
 
188 aa  83.6  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01823e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0556  MerR family transcriptional regulator  27.68 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4448  XRE family transcriptional regulator  28.41 
 
 
193 aa  82.8  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0311191  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1906  XRE family transcriptional regulator  32.04 
 
 
210 aa  82.4  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2356  transcriptional regulator, XRE family  26.52 
 
 
188 aa  81.6  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.190302 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0108  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 
186 aa  81.6  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2046  XRE family transcriptional regulator  30.26 
 
 
205 aa  81.3  0.000000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298774  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  30.68 
 
 
211 aa  80.5  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0004  DNA-binding protein  31.61 
 
 
202 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0004  DNA-binding protein  31.61 
 
 
202 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.278794  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1150  DNA-binding protein  31.61 
 
 
202 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129822  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0004  DNA-binding protein  31.61 
 
 
202 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1509  putative DNA-binding protein  31.61 
 
 
202 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7005  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 
212 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.89282 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0005  DNA-binding protein  31.61 
 
 
202 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792058  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0004  DNA-binding cupin domain-containing protein  31.61 
 
 
202 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
292 aa  80.1  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1430  DNA-binding protein  31.61 
 
 
202 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2578  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
182 aa  79.3  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0661  MerR family transcriptional regulator  27.07 
 
 
192 aa  79.3  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2714  XRE family transcriptional regulator  30.26 
 
 
204 aa  79.3  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
178 aa  78.6  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0311  cupin 2 domain-containing protein  25.56 
 
 
189 aa  78.2  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3046  transcriptional regulator  29.05 
 
 
201 aa  77.8  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3114  XRE family transcriptional regulator  31.61 
 
 
203 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935644  normal  0.475898 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1444  cupin 2 domain-containing protein  27.22 
 
 
192 aa  77.4  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  33.76 
 
 
189 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5085  XRE family transcriptional regulator  30.89 
 
 
251 aa  77  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00667568  normal  0.553791 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  32.1 
 
 
192 aa  77.4  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5322  XRE family transcriptional regulator  31.61 
 
 
203 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869737  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4537  XRE family transcriptional regulator  31.61 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2727  DNA-binding transcriptional regulator  32.96 
 
 
208 aa  76.6  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.118237 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5159  XRE family transcriptional regulator  31.61 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5700  XRE family transcriptional regulator  31.61 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441066 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0751  XRE family transcriptional regulator  26.16 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000101746  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  31.61 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3180  XRE family transcriptional regulator  31.61 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  32.37 
 
 
292 aa  75.9  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4971  XRE family transcriptional regulator  31.03 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110875  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3309  XRE family transcriptional regulator  31.84 
 
 
209 aa  75.5  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0325  XRE family transcriptional regulator  26.52 
 
 
192 aa  75.9  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1039  MerR family transcriptional regulator  27.72 
 
 
192 aa  75.5  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05970  hypothetical protein  31.15 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000231  predicted transcriptional regulator  31.15 
 
 
207 aa  75.1  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  27.33 
 
 
191 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4158  XRE family transcriptional regulator  32.57 
 
 
204 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2314  XRE family transcriptional regulator  31.18 
 
 
208 aa  74.7  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.059917  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>