More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0474 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0474  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 192 aa  392  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.554508  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09060  predicted transcriptional regulator  56.25 
 
 		 192 aa  229  2e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.391815  normal  0.265834 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1819  transcriptional regulator, XRE family  54.17 
 
 		 191 aa  213  9.999999999999999e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0201582  normal  0.3413 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0325  XRE family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 192 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2819  MerR family transcriptional regulator  52.6 
 
 		 192 aa  209  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1587  helix-turn-helix domain-containing protein  53.65 
 
 		 192 aa  207  1e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1039  MerR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 192 aa  206  2e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0661  MerR family transcriptional regulator  53.37 
 
 		 192 aa  204  5e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1444  cupin 2 domain-containing protein  51.56 
 
 		 192 aa  201  6e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0311  cupin 2 domain-containing protein  43.85 
 
 		 189 aa  156  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0556  MerR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 189 aa  155  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0869  XRE family transcriptional regulator  43.39 
 
 		 209 aa  153  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0402  transcriptional regulator, XRE family  41.88 
 
 		 189 aa  152  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.699228  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1668  transcriptional regulator, XRE family  41.36 
 
 		 188 aa  148  5e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2356  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.190302 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2327  transcriptional regulator, XRE family  37.89 
 
 		 189 aa  115  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0485  transcriptional regulator, XRE family  34.41 
 
 		 197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000244144  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0079  Cro/CI family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0878  cupin 2 domain-containing protein  32.8 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000206175  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2946  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0002  transcriptional regulator, XRE family  31.52 
 
 		 184 aa  101  8e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.138514 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3438  XRE family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 198 aa  101  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2318  transcriptional regulator  30.98 
 
 		 188 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00466136  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3151  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.18 
 
 		 503 aa  99.4  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4894  XRE family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 180 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1154  XRE family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0376883  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0076  XRE family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 180 aa  95.9  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5615  XRE family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 180 aa  95.5  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322287  normal  0.0794813 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5244  XRE family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 180 aa  95.5  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.664792  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5444  XRE family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 180 aa  95.1  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00345676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4613  XRE family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 180 aa  95.1  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  hitchhiker  0.00323798 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0992  cupin 2 domain-containing protein  30.43 
 
 		 186 aa  94.4  8e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00214756  normal  0.392819 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1110  Phosphate butyryltransferase  30.11 
 
 		 503 aa  94  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0817  transcriptional regulator, XRE family  29.57 
 
 		 184 aa  91.3  7e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3247  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 187 aa  91.7  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000592797 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1162  DNA-binding protein  29.83 
 
 		 187 aa  91.3  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3298  Cro/CI family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 187 aa  90.9  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3489  XRE family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 187 aa  90.9  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3393  transcriptional regulator, XRE family  28.26 
 
 		 199 aa  90.9  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000124891  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3456  transcriptional regulator, XRE family  28.26 
 
 		 199 aa  90.9  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0524  XRE family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 187 aa  90.9  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000827128  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0650  XRE family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 187 aa  90.1  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1001  DNA-binding protein  29.28 
 
 		 187 aa  89.4  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1008  DNA-binding protein  29.28 
 
 		 187 aa  89.4  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 212 aa  89.4  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0108  transcriptional regulator, XRE family  27.72 
 
 		 186 aa  89.4  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.35 
 
 		 189 aa  88.6  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2148  DNA-binding protein, putative  31.18 
 
 		 181 aa  87.8  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1806  transcriptional regulator, XRE family  31.18 
 
 		 181 aa  87.8  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0958  DNA-binding protein  28.73 
 
 		 187 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.704462  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0867  DNA-binding protein  28.73 
 
 		 187 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0281  DNA-binding protein  28.73 
 
 		 187 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1956  DNA-binding protein  28.73 
 
 		 187 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3263  transcriptional regulator, XRE family  27.72 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0450  XRE family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 180 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0805  DNA-binding protein  27.22 
 
 		 224 aa  85.9  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602444  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  29.51 
 
 		 182 aa  84.7  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0609  cupin sensor transcriptional regulator  30.11 
 
 		 184 aa  84.7  7e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.176567  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  29.12 
 
 		 175 aa  82.8  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0751  XRE family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000101746  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0154  XRE family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  26.52 
 
 		 191 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  30.05 
 
 		 190 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1309  transcriptional regulator  28.96 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 191 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0898  XRE family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6574  transcriptional regulator, XRE family  28.72 
 
 		 227 aa  80.9  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0448941 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 182 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0521  cupin 2 domain-containing protein  28.65 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6009  XRE family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.285081  hitchhiker  0.00726065 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  28.02 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1398  XRE family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.365461  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3301  XRE family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1934  DNA-binding protein  31.02 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0316  cupin 2 domain-containing protein  28.65 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0311  putative transcriptional regulator  29.51 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5637  transcriptional regulator, XRE family  29.59 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.76756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3684  transcriptional regulator, XRE family  27.81 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000437538  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2320  transcriptional regulator, XRE family  29.47 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1158  XRE family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000119717  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1180  helix-turn-helix domain-containing protein  26.6 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1889  transcriptional regulator, XRE family  29.47 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 193 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02750  putative transcriptional regulator  29.51 
 
 		 179 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.549892  normal  0.0746214 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2591  XRE family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 180 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 176 aa  76.3  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5748  transcriptional regulator  27.89 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0587  cupin 2 domain-containing protein  29.83 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1243  transcriptional regulator  28.65 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  26.23 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2222  DNA-binding protein  30.48 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>