More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2601 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2601  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 203 aa  414  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512754  hitchhiker  0.000000366247 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05970  hypothetical protein  59.3 
 
 		 207 aa  258  4e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000231  predicted transcriptional regulator  59.3 
 
 		 207 aa  258  6e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0950  transcriptional regulator  60.3 
 
 		 207 aa  253  1.0000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1906  XRE family transcriptional regulator  61.66 
 
 		 210 aa  253  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2727  DNA-binding transcriptional regulator  59.6 
 
 		 208 aa  253  2.0000000000000002e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118237 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0763  putative DNA-binding protein  60 
 
 		 215 aa  251  5.000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3843  DNA-binding protein  54.55 
 
 		 209 aa  233  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1555  putative transcriptional regulator  55.43 
 
 		 208 aa  229  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602269  normal  0.341998 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2483  DNA-binding protein  53.03 
 
 		 198 aa  225  3e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4037  DNA-binding protein  53.57 
 
 		 199 aa  223  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1345  XRE family transcriptional regulator  51.91 
 
 		 209 aa  214  5.9999999999999996e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2314  XRE family transcriptional regulator  48 
 
 		 208 aa  204  8e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.059917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3227  transcriptional regulator  51.41 
 
 		 201 aa  195  3e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.792428  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3886  XRE family transcriptional regulator  44.13 
 
 		 210 aa  176  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6754  transcriptional regulator, XRE family  43.02 
 
 		 210 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36173  normal  0.846385 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2769  XRE family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 276 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3309  XRE family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4870  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 211 aa  149  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.523431 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8486  transcriptional regulator, XRE family  41.11 
 
 		 204 aa  145  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1466  XRE family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.609185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4798  transcriptional regulator  39.33 
 
 		 222 aa  133  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7013  transcriptional regulator  41.96 
 
 		 150 aa  129  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1430  XRE family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 259 aa  127  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00776927 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4610  XRE family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 252 aa  122  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.985679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0062  transcriptional regulator  32.58 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5469  XRE family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0381278  normal  0.011752 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0168  XRE family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 227 aa  111  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2158  XRE family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 239 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.233392  normal  0.181964 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1559  transcriptional regulator, XRE family  34.25 
 
 		 262 aa  106  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5085  XRE family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 251 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00667568  normal  0.553791 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3247  XRE family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 187 aa  99.8  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000592797 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1469  XRE family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 201 aa  99.8  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.978322 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3298  Cro/CI family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 187 aa  98.6  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2320  transcriptional regulator, XRE family  32.43 
 
 		 188 aa  96.3  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1889  transcriptional regulator, XRE family  32.43 
 
 		 188 aa  96.3  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5444  XRE family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 180 aa  94  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00345676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5615  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 180 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322287  normal  0.0794813 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0076  XRE family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 180 aa  94  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5244  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 180 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.664792  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4894  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 180 aa  94  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4613  XRE family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 180 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  hitchhiker  0.00323798 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2007  DNA-binding protein  30.43 
 
 		 205 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0650  XRE family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 187 aa  92.8  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 176 aa  92.8  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0805  DNA-binding protein  35 
 
 		 224 aa  92.4  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602444  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  30.34 
 
 		 188 aa  92  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1162  DNA-binding protein  34.81 
 
 		 187 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1008  DNA-binding protein  34.81 
 
 		 187 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3263  transcriptional regulator, XRE family  31.09 
 
 		 188 aa  89.4  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1001  DNA-binding protein  34.81 
 
 		 187 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1227  transcriptional regulator  29.89 
 
 		 220 aa  89  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.222447  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.36 
 
 		 189 aa  88.2  8e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0524  XRE family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 187 aa  88.2  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000827128  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3438  XRE family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 198 aa  87.4  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1876  XRE family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 197 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0867  DNA-binding protein  34.25 
 
 		 187 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1956  DNA-binding protein  34.25 
 
 		 187 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0958  DNA-binding protein  34.25 
 
 		 187 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.704462  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0281  DNA-binding protein  34.25 
 
 		 187 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2245  Cro/CI family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 197 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492638  normal  0.683994 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3493  XRE family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 197 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.499359  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0079  Cro/CI family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 196 aa  84.7  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0485  transcriptional regulator, XRE family  30.93 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000244144  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3489  XRE family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 187 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0878  cupin 2 domain-containing protein  27.89 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000206175  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  33.71 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 178 aa  78.6  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0751  XRE family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000101746  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1457  transcriptional regulator  31.32 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.96188e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2946  transcriptional regulator  27.08 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0477  XRE family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.566181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1154  XRE family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0376883  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3393  transcriptional regulator, XRE family  27.96 
 
 		 199 aa  74.7  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000124891  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5178  XRE family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  31.11 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3456  transcriptional regulator, XRE family  27.96 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0202  XRE family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.614203  hitchhiker  0.00167713 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  26.92 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5268  Cro/CI family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 182 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0450  XRE family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 180 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5320  XRE family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.8166  normal  0.310919 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2148  DNA-binding protein, putative  27.32 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1806  transcriptional regulator, XRE family  27.32 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1941  transcriptional regulator  31.43 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5514  XRE family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388539 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0980  XRE family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000294477  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0552  transcriptional regulator  28.02 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0032692  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1128  XRE family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1195  XRE family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 182 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5912  XRE family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5523  transcriptional regulator  26.55 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3100  XRE family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.510523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3195  transcriptional regulator, XRE family  28.74 
 
 		 182 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0639399 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2921  XRE family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.899455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3003  XRE family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>