More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1469 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1469  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  403  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.978322 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2245  Cro/CI family transcriptional regulator  60.91 
 
 		 197 aa  223  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492638  normal  0.683994 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3493  XRE family transcriptional regulator  60.41 
 
 		 197 aa  222  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.499359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1876  XRE family transcriptional regulator  60.41 
 
 		 197 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2007  DNA-binding protein  57.75 
 
 		 205 aa  202  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0168  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0062  transcriptional regulator  48.44 
 
 		 211 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5469  XRE family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 215 aa  157  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0381278  normal  0.011752 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1559  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 262 aa  131  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1555  putative transcriptional regulator  36.41 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602269  normal  0.341998 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2314  XRE family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 208 aa  121  7e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.059917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1345  XRE family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5085  XRE family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 251 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00667568  normal  0.553791 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2727  DNA-binding transcriptional regulator  34.07 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118237 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0763  putative DNA-binding protein  33.51 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1430  XRE family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 259 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00776927 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05970  hypothetical protein  31.87 
 
 		 207 aa  107  8.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4798  transcriptional regulator  35.86 
 
 		 222 aa  106  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000231  predicted transcriptional regulator  31.87 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3227  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  104  8e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.792428  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3309  XRE family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2601  XRE family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 203 aa  102  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512754  hitchhiker  0.000000366247 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1906  XRE family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 210 aa  102  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3843  DNA-binding protein  31.22 
 
 		 209 aa  101  8e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0950  transcriptional regulator  29.12 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1466  XRE family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.609185  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4037  DNA-binding protein  28.65 
 
 		 199 aa  99  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2483  DNA-binding protein  29.51 
 
 		 198 aa  97.4  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3886  XRE family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 210 aa  95.1  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2769  XRE family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 276 aa  90.5  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8486  transcriptional regulator, XRE family  30.3 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4610  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 252 aa  89.7  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.985679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6754  transcriptional regulator, XRE family  32.78 
 
 		 210 aa  88.6  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36173  normal  0.846385 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.15 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3438  XRE family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 198 aa  72  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7013  transcriptional regulator  31.54 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0079  Cro/CI family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 196 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4870  XRE family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.523431 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0992  cupin 2 domain-containing protein  29.57 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00214756  normal  0.392819 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1154  XRE family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0376883  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5113  putative transcriptional regulator  28.42 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4894  XRE family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0076  XRE family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 180 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5444  XRE family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 180 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00345676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58380  putative transcriptional regulator  28.42 
 
 		 187 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1566  transcriptional regulator, XRE family  29.17 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0862847 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0878  cupin 2 domain-containing protein  27.78 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000206175  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2946  transcriptional regulator  27.37 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2318  transcriptional regulator  28.26 
 
 		 188 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00466136  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0154  XRE family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 182 aa  67  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5244  XRE family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.664792  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5615  XRE family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322287  normal  0.0794813 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1227  transcriptional regulator  29.74 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.222447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0450  XRE family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4613  XRE family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  hitchhiker  0.00323798 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0609  cupin sensor transcriptional regulator  24.04 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.176567  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1806  transcriptional regulator, XRE family  27.96 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2148  DNA-binding protein, putative  27.96 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0842  cupin 2 domain-containing protein  30.85 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2327  transcriptional regulator, XRE family  27.98 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0474  XRE family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.554508  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2158  XRE family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 239 aa  64.7  0.0000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.233392  normal  0.181964 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2819  MerR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0108  transcriptional regulator, XRE family  29.05 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3489  XRE family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0325  XRE family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0477  XRE family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.566181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0002  transcriptional regulator, XRE family  27.72 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.138514 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0402  transcriptional regulator, XRE family  25.79 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.699228  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0485  transcriptional regulator, XRE family  28.27 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000244144  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  25 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1444  cupin 2 domain-containing protein  26.63 
 
 		 192 aa  62  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2171  transcriptional regulator  26.37 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.809699 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1587  helix-turn-helix domain-containing protein  23.44 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2429  XRE family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 191 aa  61.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0848952 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3352  XRE family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0817  transcriptional regulator, XRE family  28.96 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3341  XRE family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.272722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3403  XRE family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  27.32 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1039  MerR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4666  transcriptional regulator, XRE family  28.42 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.223091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  29.61 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0521  cupin 2 domain-containing protein  22.7 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0869  XRE family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0428  transcriptional regulator, XRE family  27.27 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0316  cupin 2 domain-containing protein  23.24 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3025  XRE family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 281 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.925102 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09060  predicted transcriptional regulator  27.75 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.391815  normal  0.265834 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0661  MerR family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5358  putative transcriptional regulator, XRE family  28.65 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.406538  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1243  transcriptional regulator  25.27 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4357  transcriptional regulator, MerR family  29.89 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00580847 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0805  DNA-binding protein  29.73 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602444  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4694  XRE family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.607677 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3075  XRE family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 269 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  27.8 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1398  XRE family transcriptional regulator  22.16 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.365461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>