More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4152 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 191 aa  383  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2429  XRE family transcriptional regulator  97.38 
 
 		 191 aa  372  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0848952 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  69.73 
 
 		 199 aa  280  7.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0428  transcriptional regulator, XRE family  69.78 
 
 		 197 aa  268  2.9999999999999997e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  67.6 
 
 		 192 aa  248  3e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3652  XRE family transcriptional regulator  59.69 
 
 		 196 aa  238  4e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533728 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4666  transcriptional regulator, XRE family  59.14 
 
 		 197 aa  237  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.223091  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  60.53 
 
 		 194 aa  234  5.0000000000000005e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1566  transcriptional regulator, XRE family  59.59 
 
 		 202 aa  234  6e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0862847 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0635  transcriptional regulator, XRE family  60 
 
 		 198 aa  233  9e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3404  cupin 2 domain-containing protein  58.95 
 
 		 215 aa  230  9e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5358  putative transcriptional regulator, XRE family  58.64 
 
 		 201 aa  229  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.406538  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3050  transcriptional regulator, XRE family  59.16 
 
 		 195 aa  228  3e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0215158  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1719  transcriptional regulator, XRE family  59.89 
 
 		 204 aa  217  7e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.017651  normal  0.124941 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8704  transcriptional regulator, XRE family  58.24 
 
 		 223 aa  217  8.999999999999998e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.264618 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1965  XRE family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 194 aa  207  5e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0249499  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  55.91 
 
 		 200 aa  205  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  54.97 
 
 		 201 aa  205  4e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  57.37 
 
 		 194 aa  201  5e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4623  putative transcriptional regulator, XRE family  54.64 
 
 		 197 aa  200  9e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1021  transcriptional regulator, XRE family  55.08 
 
 		 191 aa  200  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.438557  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2999  transcriptional regulator, XRE family  54.26 
 
 		 200 aa  198  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290253  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  61.08 
 
 		 195 aa  198  5e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2613  XRE family transcriptional regulator  51.05 
 
 		 219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.629122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5086  putative transcriptional regulator, XRE family  51.34 
 
 		 192 aa  190  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3019  transcriptional regulator, XRE family  52.6 
 
 		 198 aa  189  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1667  XRE family transcriptional regulator  54.59 
 
 		 214 aa  182  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2592  transcriptional regulator, XRE family  54.17 
 
 		 210 aa  182  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1711  transcriptional regulator, XRE family  53.7 
 
 		 200 aa  177  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63161  normal  0.919847 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2586  Cupin 2 conserved barrel domain protein  66.36 
 
 		 126 aa  166  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000628471  hitchhiker  0.000111842 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2231  transcriptional regulator, XRE family  49.44 
 
 		 190 aa  165  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2365  transcriptional regulator, XRE family  48.47 
 
 		 193 aa  137  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.977725  normal  0.0272358 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3352  XRE family transcriptional regulator  45.14 
 
 		 193 aa  137  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236659 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3341  XRE family transcriptional regulator  45.14 
 
 		 193 aa  137  7e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.272722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3403  XRE family transcriptional regulator  45.14 
 
 		 193 aa  137  7e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2893  XRE family transcriptional regulator  46.06 
 
 		 169 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3617  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 195 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4050  transcriptional regulator, XRE family  44.51 
 
 		 192 aa  128  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1170  helix-turn-helix domain-containing protein  39.66 
 
 		 196 aa  120  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0800  helix-turn-helix domain protein  40.91 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.860069  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3829  transcriptional regulator, XRE family  41.98 
 
 		 201 aa  108  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03340  predicted transcriptional regulator  37.57 
 
 		 190 aa  98.2  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0506  transcriptional regulator, XRE family  35.53 
 
 		 194 aa  93.6  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0504214  normal  0.112871 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5814  transcriptional regulator, XRE family  38.51 
 
 		 193 aa  91.7  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1889  transcriptional regulator, XRE family  36.16 
 
 		 198 aa  88.6  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4448  XRE family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 193 aa  83.6  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0311191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2440  transcriptional regulator, XRE family  37.19 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.086441  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2992  transcriptional regulator, XRE family  37.36 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.537679  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  30.39 
 
 		 182 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04250  transcriptional regulator  36.22 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0869  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0842  cupin 2 domain-containing protein  34.5 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  33.53 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2591  XRE family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 180 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  29.07 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  33.14 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1668  transcriptional regulator, XRE family  28.42 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  32.78 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0168  XRE family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4609  XRE family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2327  transcriptional regulator, XRE family  28.49 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1008  DNA-binding protein  29.35 
 
 		 187 aa  72  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1001  DNA-binding protein  29.35 
 
 		 187 aa  72  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2732  XRE family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 180 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3125  Cro/CI family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 180 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.888864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  30.17 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6377  XRE family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0311  cupin 2 domain-containing protein  26.09 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0410  putative transcriptional regulator, XRE family  29.81 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1162  DNA-binding protein  28.8 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5113  putative transcriptional regulator  32.2 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1956  DNA-binding protein  28.8 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0230  transcriptional regulator  29.89 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0958  DNA-binding protein  28.8 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.704462  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0281  DNA-binding protein  28.8 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0867  DNA-binding protein  28.8 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0450  XRE family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3075  XRE family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 269 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58380  putative transcriptional regulator  32.2 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1889  transcriptional regulator, XRE family  25.95 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3046  transcriptional regulator  27.55 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0805  DNA-binding protein  27.04 
 
 		 224 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602444  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2356  transcriptional regulator, XRE family  25.41 
 
 		 188 aa  67.8  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.190302 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0925  transcriptional regulator, putative  30.9 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0641  XRE family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199173  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1457  transcriptional regulator  27.01 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.96188e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2294  XRE family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0867  putative transcriptional regulator  30.9 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0318952  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2941  XRE family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0631546  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2320  transcriptional regulator, XRE family  25.41 
 
 		 188 aa  67  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2819  MerR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02750  putative transcriptional regulator  29.67 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.549892  normal  0.0746214 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>